| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2777266 = | 163 (0.990) | 8 (0.050) | 6/256 | NT | 5.1% | coding (211/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2777291 = | 145 (0.920) | coding (186/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCTGCTGCCACT > NC_002947/2777117‑2777415 | tggacaagcaagacccccagcagcagtggcagcaggcagtcatcgcctatgcccaggccgtcaacgactacgtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgcct > 2:4042692‑M1/150‑150 (MQ=255)gATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGtt < 2:476151/150‑1 (MQ=255)gATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGtt < 1:4239677/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTgg > 1:1723231/1‑150 (MQ=255) gCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGc > 2:3378293/1‑150 (MQ=255) acaagcaagacccccagcagcagtggcagcaggcagtcatcgcctatgcccaggccgtcaacgactacgtcgcgcagggccgtgcgcacggctgggacaacctcgaagagccgcaggcacccgccaccgaacacctgctcgacgccTGGc < 1:5210558‑M1/4‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGctgc > 1:396598/1‑150 (MQ=255) cagcagGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGctgcctg > 1:2449706/1‑150 (MQ=255) cagGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCATCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAg < 1:4744072/150‑1 (MQ=255) cTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCt < 1:3362427/150‑1 (MQ=255) tGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGtt < 2:212913/133‑1 (MQ=255) tGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTg > 1:232489/1‑150 (MQ=255) cATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGGGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACa > 2:4137255/1‑150 (MQ=255) aTCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAg > 2:5210388/1‑150 (MQ=255) aTCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAg > 1:648551/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGccc > 2:1234621/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCa > 1:3594734/1‑150 (MQ=255) cagcagcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTCTCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGc > 2:3926424/1‑150 (MQ=255) cagcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTc < 2:426148/150‑1 (MQ=255) cagcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTc < 1:1072204/150‑1 (MQ=255) cagcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTc < 1:1072193/150‑1 (MQ=255) gcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGa < 2:3747699/150‑1 (MQ=255) gcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCAGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGa < 2:2453908/150‑1 (MQ=255) gcagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCAGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGa < 2:471831/150‑1 (MQ=255) cagGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAg > 1:2012175/1‑150 (MQ=255) agGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGct > 1:4239308/1‑120 (MQ=255) gACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAg < 1:5399145/150‑1 (MQ=255) gACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAg > 2:2778861/1‑150 (MQ=255) 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tGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCgg > 1:3398253/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCgg > 2:1722980/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTGGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTGGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGt < 2:2772521/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCa > 1:5359742/1‑98 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGctc > 2:5211804/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGctc > 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ttGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAg > 1:3670071/1‑150 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTc < 1:4136613/150‑1 (MQ=255) gCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCAGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTc < 2:3712480/150‑1 (MQ=255) ggAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCAGCGCGACGTAGTCGt > 1:307503/1‑150 (MQ=255) gAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGtt < 1:1953077/150‑1 (MQ=255) aTGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGa < 2:5039471/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACg < 1:3733957/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGc > 2:4317341/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGcc > 2:2750303/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTg < 2:396598/150‑1 (MQ=255) cgcTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTgg < 1:3378296/150‑1 (MQ=255) gctgctGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTggg > 1:671739/1‑150 (MQ=255) tgTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAg < 2:2402914/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAgg > 2:5005058/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGACATAGGc < 1:4764171/150‑1 (MQ=255) cgaacacctgctcgacgccTGGCTGTCAGCCCTGCAGGCAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGCCGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCg < 1:2997420‑M1/131‑1 (MQ=255) cgtcgACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGa < 2:5000858/150‑1 (MQ=255) cgtcgACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGa < 1:1670064/150‑1 (MQ=255) gACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGAc > 1:2928727/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGa > 2:2014432/1‑145 (MQ=255) aCGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGAct > 1:4168716/1‑150 (MQ=255) gCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGActgc > 1:710829/1‑150 (MQ=255) aGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTgcgc > 2:2002064/1‑108 (MQ=255) cGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCtgctgc < 1:3320499/150‑1 (MQ=255) TGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCTGCTGCCAct > 2:3488988‑M1/1‑150 (MQ=255) | GATGCGGGCCAGCAGGCTGCCATCTTCCAGCAGCAGGACATGGCTGATGCCTTGGCCGTGGTCTTCGAGCAACGGTATCAAGGGGTGGTGTGCGGGTGGCCAGGCCTTGCGGAATGCCTGGCGCTGCTGTTCGTCGACGCCAGGACGGTTGGCTGCCTGCAGGGCTGACAGCCAGGCGTCGAGCAGGTGTTCGGTGGCGGGTGCCTGCGGCTCTTCGAGGTTGTCCCAGCCGTGCGCACGGCCCTGCGCGACGTAGTCGTTGACGGCCTGGGCATAGGCGATGACTGCCTGCTGCCACT > NC_002947/2777117‑2777415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |