| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 3265438 | 132 (0.800) | 6 (0.060) +GCACGCGCATCGGCGGCGTGCTGGACGTGATTCGTTCCATTGCCGAA |
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| ? | NC_002947 | = 4457258 | 188 (1.140) | coding (1693/2178 nt) | PP_3950 | methyl‑accepting chemotaxis transducer | |||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
CCCGGCCTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCACCTCATT > NC_002947/3265290‑3265587 | cccGGCCTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCAt < 2:3930564/150‑1 (MQ=255)cccGGCCTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCAt < 2:3466252/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATc > 2:5342109/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATg < 2:5272798/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATc > 2:3266347/1‑145 (MQ=255) cTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATc < 1:3266347/145‑1 (MQ=255) tGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTc > 1:3078725/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGc > 1:535026/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCg > 1:601584/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGa > 2:967918/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGAc > 1:4279343/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAgg < 2:1612673/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTc < 2:782622/150‑1 (MQ=255) ccgccTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGa > 2:3526662/1‑150 (MQ=255) ccTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCt > 1:5404033/1‑150 (MQ=255) tCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTgc > 1:1540205/1‑150 (MQ=255) tCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTgc > 2:4438429/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGcc < 2:607789/150‑1 (MQ=255) 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cAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCAc > 1:3071467/1‑96 (MQ=255) tCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTcc > 2:2583940/1‑150 (MQ=255) aCCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCg > 1:3348875/1‑150 (MQ=255) ccTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCtgttgttgt < 1:3569589/92‑1 (MQ=255) ccTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGt > 2:198260/1‑150 (MQ=255) ccTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGt > 2:4611835/1‑150 (MQ=255) cTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTa < 2:3835096/150‑1 (MQ=255) tGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAg < 1:170661/150‑1 (MQ=255) tGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAg < 2:2835432/150‑1 (MQ=255) tGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTGGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTAGGCCACGTCCTGCACGGCGTAg > 2:5324764/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCa > 1:1105936/1‑150 (MQ=255) ggCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCAc > 2:1576940/1‑150 (MQ=255) ggCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCAc < 2:3166129/150‑1 (MQ=255) ccTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGc > 1:377583/1‑68 (MQ=255) ccTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGc < 2:377583/68‑1 (MQ=255) cTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTg < 1:943877/132‑1 (MQ=255) tCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCACCTCa > 1:3034437/1‑150 (MQ=255) tCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCACCTCa > 2:3403867/1‑150 (MQ=255) aTCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGc > 1:364537/1‑81 (MQ=255) aTCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGc < 2:364537/81‑1 (MQ=255) aTCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCACCTCAtt > 1:5111638/1‑150 (MQ=255) aTCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCACCTCAtt > 1:2538123/1‑150 (MQ=255) | CCCGGCCTTGCTCGCCAGCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGTTCGGCAATGGAACGAATCACGTCCAGCACGCCGCCGATGCGCGTGCTGTGGCCGGCCAGGTCGCGGATTACCTGTACGGCCTCATCGATGGTCAGCGACAGGCGGTCGATCTGCGCCAGGCTGCCGTGGATAGCCTGCTGGCCGTGCGTCACCTGTTGTTGTGCCGTACGCATTTCTCCGGCGGCCTGTTCAGCGGTCTTGGCCACGTCCTGCACGGCGTAGGTCACCTCATT > NC_002947/3265290‑3265587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |