New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3265438 | 132 (0.800) | 6 (0.060) +GCACGCGCATCGGCGGCGTGCTGGACGTGATTCGTTCCATTGCCGAA |
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? | NC_002947 | = 4457258 | 188 (1.140) | coding (1693/2178 nt) | PP_3950 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTGCGCGG > NC_002947/4457111‑4457406 | tctcGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCtggt < 2:2801366/150‑1 (MQ=255) tgtgGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGAttt > 1:1969955/1‑150 (MQ=255) gtgGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTc < 1:288234/150‑1 (MQ=255) tgGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCg < 2:706060/150‑1 (MQ=255) tgGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCg < 2:3434756/150‑1 (MQ=255) ggCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGc < 2:1090551/150‑1 (MQ=255) ggCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGc < 2:369471/150‑1 (MQ=255) gCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCt < 2:2671757/150‑1 (MQ=255) gAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGa > 2:4203190/1‑150 (MQ=255) gAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGa < 2:509718/150‑1 (MQ=255) gAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGa > 2:5358933/1‑150 (MQ=255) tGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCa > 1:5434758/1‑150 (MQ=255) tGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCa > 1:2711193/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAAc < 1:4090031/150‑1 (MQ=255) cgtcgGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAAcc > 1:1378028/1‑150 (MQ=255) ggcggcACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGt < 2:1884929/150‑1 (MQ=255) cggcACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGa < 1:5171682/150‑1 (MQ=255) cggcACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGa < 1:2821125/150‑1 (MQ=255) 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tgcgtgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAtct > 2:1757342/1‑150 (MQ=255) tgcgtgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAtct < 1:866425/150‑1 (MQ=255) tgcgtgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAtct > 2:3017142/1‑150 (MQ=255) tgcgtgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAtct > 1:3611962/1‑150 (MQ=255) cgtgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCg > 1:113749/1‑150 (MQ=255) gtgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGa < 1:605165/150‑1 (MQ=255) tgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAt < 2:1002827/144‑1 (MQ=255) tgcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAt > 1:1002827/1‑144 (MQ=255) gcgGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGAcc < 1:3017142/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCAt > 2:3318337/1‑150 (MQ=255) 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cGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGa > 1:1501102/1‑150 (MQ=255) ggCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGAt < 2:79293/150‑1 (MQ=255) gCCCGTGCCGCCTCGATGGCGGCATTCAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGttcggcaatggaacgaatcacgtccagcacgccgccgatgcgcgtgctgtggccgtacaggtaatccgcgacctggccggccacagc > 2:2512988‑M2/1‑47 (MQ=255) aCGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGa < 1:2570911/150‑1 (MQ=255) cgcgCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGAc < 1:4688946/150‑1 (MQ=255) cgcgCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGAc < 1:1788723/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGAGGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACAGCGCGGATCGACt > 2:518825/1‑150 (MQ=255) gccgccTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGc < 2:4634776/150‑1 (MQ=255) gATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGc > 2:2195659/1‑150 (MQ=255) ggcATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGAtctc > 2:4096135/1‑69 (MQ=255) tGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCt > 1:774493/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTg < 2:554267/150‑1 (MQ=255) gAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTg < 1:1128985/150‑1 (MQ=255) gcCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGgat < 1:4611578/93‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACt > 1:3629362/1‑150 (MQ=255) agcagGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTgc < 1:3350535/150‑1 (MQ=255) agGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTgcgcg < 1:2231076/150‑1 (MQ=255) ggTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTgcgcgc < 2:203941/150‑1 (MQ=255) gTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGcgcgcg > 1:190385/1‑150 (MQ=255) ttGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGt < 2:5097835/150‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGt < 2:1073606/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTgcgc < 2:5424551/150‑1 (MQ=255) tggttggtGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTGCGCgg < 2:3506613/150‑1 (MQ=255) tggttggtGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTGCGCgg < 1:5371071/150‑1 (MQ=255) tggttggtGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTGCGCgg < 2:2369654/150‑1 (MQ=255) tggttggtGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGACCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTGCGCgg < 2:315243/150‑1 (MQ=255) | TCTCGACCATGTGGCGAATGTCGTCGGCGGCACGCGAGGTGCGTGCGGCCAGGCTGCGCACCTCGTCGGCCACCACCGCGAAGCCACGGCCATGCTCCCCGGCACGCGCCGCCTCGATGGCGGCATTGAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGGTTGGTGATTTCGCTGATCAACCCGGTGATGTTGTCGATCTCGACCATGCGGCTGTCGAGCCGCTGCACGCTGGATGATGAGCGCGCCACCACATCGCGGATCGACTGCGTGCCCGCCTGCACCGCCTGGTACTGCGCGCGTGCGCGG > NC_002947/4457111‑4457406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |