| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3321086 = | 124 (0.750) | 9 (0.060) | 6/246 | NT | 7.9% | intergenic (‑85/+107) | treSA/PP_2919 | trehalose synthase A/LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 3321171 = | 97 (0.640) | intergenic (‑170/+22) | treSA/PP_2919 | trehalose synthase A/LysR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TGGGAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGAAACGCAT > NC_002947/3320937‑3321233 | tGGGAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGttt < 2:2960129/150‑1 (MQ=255)tGGGAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGttt > 2:4081208/1‑150 (MQ=255)tGGGAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGttt > 1:4274486/1‑150 (MQ=255) ggAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTttct > 2:2733374/1‑150 (MQ=255) gAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTttctt < 1:2460384/150‑1 (MQ=255) gAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTttctt < 1:421148/150‑1 (MQ=255) gccgatgagcgtggggttggcctggcaccgggaacgggcattcagcccggcgatgcaggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTcgc < 2:1556685‑M1/7‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTcgc < 1:3007186/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTcgc < 1:1553835/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTcgc < 1:1706000/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCgg > 2:2516190/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCgg < 2:4815653/150‑1 (MQ=255) ttGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCggg > 1:3287915/1‑150 (MQ=255) ttGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCggg > 2:801446/1‑150 (MQ=255) ttGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCggg > 2:3542188/1‑150 (MQ=255) ttGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCggg > 1:173602/1‑150 (MQ=255) gatgagcgtggggttggcctggcaccgggaacgggcattcagcccggcgatgcaggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCggg < 1:2498368‑M1/10‑1 (MQ=255) tGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGc > 2:4479320/1‑150 (MQ=255) gatgagcgtggggttggctggcaccgggaacgggcattcagcccggcgatgcaggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGc < 1:2498364‑M1/11‑1 (MQ=255) aGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCtt < 1:3106098/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGc < 1:4399206/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGc < 1:671830/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGc > 2:2044491/1‑150 (MQ=255) cATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGc > 2:5041856/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTTCCCGc > 1:1904682/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGc > 1:1036798/1‑150 (MQ=255) cgcgGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCt < 1:861574/150‑1 (MQ=255) gcgGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTc < 2:1300756/150‑1 (MQ=255) gcgGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTc < 2:2130671/150‑1 (MQ=255) cgGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCAAGCCCGcgaa < 1:1381508/150‑4 (MQ=255) tCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCcac > 2:2417698/1‑150 (MQ=255) tCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCcac < 2:3971365/150‑1 (MQ=255) tCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAgg < 2:396170/150‑1 (MQ=255) cGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGc < 1:948825/150‑1 (MQ=255) cGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGc < 1:3691736/150‑1 (MQ=255) aGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTTGCCCCGCCCACAAGccg > 1:1034701/1‑148 (MQ=255) gCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGGCCCCGCCCACACGccgc > 1:3268272/1‑147 (MQ=255) gCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGccgc > 2:4411101/1‑147 (MQ=255) ccATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCcaca > 2:1537749/1‑143 (MQ=255) ccATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCcaca < 1:1537749/143‑1 (MQ=255) cATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACa < 1:1300380/150‑1 (MQ=255) aTTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACAt > 2:3878338/1‑150 (MQ=255) tttGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATa > 2:5427737/1‑150 (MQ=255) gTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGGTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTACTTCGCGGGCAAGCCCCCGCCCCCAGGCGGCCATAccccgg > 2:821186/1‑146 (MQ=255) tGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAg < 1:2620190/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGACGaat > 2:3464646/1‑148 (MQ=255) gggTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGAttt > 1:2290890/1‑150 (MQ=255) gggTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACACGCCGACCTGCCGCAGACGAatt > 2:392706/1‑150 (MQ=255) agcccggcgatgcaggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTcgc < 2:4095316‑M1/7‑1 (MQ=255) ggTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGc > 1:1600889/1‑146 (MQ=255) tCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGGCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCCCTCCCACACGCCGACATACCGCAGAAGATTTGCGCGGCAccagg > 2:1611413/1‑147 (MQ=255) caggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCtgt > 1:4135887‑M1/89‑150 (MQ=255) caggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCtgt > 1:4135831‑M1/89‑150 (MQ=255) ggcggtgcgcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTgg > 1:2037218‑M1/87‑150 (MQ=255) tCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAg < 1:2213675/150‑1 (MQ=255) tCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACACGCGGGCCTACCGCGGAAGAATTGCGCTGCACCACTGGGAg > 2:382869/1‑150 (MQ=255) cgcgTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGc < 2:3906664/150‑1 (MQ=255) cgcgTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGc < 2:730931/150‑1 (MQ=255) gcgTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACa > 1:621349/1‑115 (MQ=255) gcgTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTATTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACCTACCGCGGAAGATTTGCGCGGCACCGGGGGGGGCg > 2:940483/1‑150 (MQ=255) tCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCAGTGGGAGCGGgc > 1:5386418/1‑150 (MQ=255) gcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGgc > 1:3966817‑M1/79‑150 (MQ=255) gcaattacttccatgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGgc > 1:3966852‑M1/79‑150 (MQ=255) tctTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAgg < 2:2213884/103‑1 (MQ=255) tctTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAgg > 1:2213884/1‑103 (MQ=255) tttGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGCCATACCGCTGAAGATTTGCGCGGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGcc > 2:2123408/1‑150 (MQ=255) ttGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGccc < 2:1036798/150‑1 (MQ=255) cttccatgatgcgtttctggcaccgcagctgttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcg > 1:2875586‑M1/72‑150 (MQ=255) gCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCAGGCGGACCTACCGCGGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgc > 2:2933936/1‑150 (MQ=255) gtgtCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCcgcgc > 2:4765015/1‑149 (MQ=255) tgtCGGCACCGGCTCAGGTTATGCCGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaa < 1:2318647/150‑1 (MQ=255) atgatgcgtttctggcaccgcagcagttgtcggcccggcgctgatcctgcctttgcaggcccggccTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAag > 2:565816‑M1/67‑150 (MQ=255) gCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGc > 2:4301181/1‑150 (MQ=255) ccGGCTCAGGTTATGAGGGCGGTGCGGCCTGAAGGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGTTTTCTTCGGGGGCTTGCCGGCTCCCACCGGCGGACATACCGCTTAAGATTTGGGCTGCACCTGTGGGTGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCgg < 1:416556/150‑1 (MQ=255) gCTCAGTTTATGACGGCGCTGGGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGCTCCCACCGGCGCACATACCGCTGAATTTTTGCGGTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGcc < 1:2123408/150‑1 (MQ=255) cTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCATTATGGGTTTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTTAATATTTGCGCTGCACCTGTGGTAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCt < 1:5411127/150‑1 (MQ=39) cTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCt < 2:5072209/150‑1 (MQ=255) aTGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACAGGCGGACATACCCCGGAAGGGTTGCGCTGCACCGGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCACAGGCCGGGCCGGCCAAGGc > 2:328261/1‑150 (MQ=255) tgcgggCGCTGCGGCCTGACGGTTCGGCTCACGTTGGGTGTGGGTTTCTTCGGGGGCTGGCCCGCTCCCACCGGCGCACATCCCGCTGAAGATTGGCGCGGCCCCTGTGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCa < 1:4171517/146‑1 (MQ=255) ggCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCATTCCCCCACACACACCCGGACCAAACGCACAAGAAATTCGCAGCACCAGTGGGTGCCGGCCAGCCCGCGTACAGGGCCGGCCTGCAAAGGCACGaa > 2:1624413/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGcc < 2:744312/150‑1 (MQ=255) gAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTGTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCg < 1:3154717/150‑1 (MQ=255) aaCGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGa < 1:4081208/150‑1 (MQ=255) aaCGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCCGACATACCGCGGAAGATTTTCGCTGCACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATAAGCGCCCGGCCGa > 2:1894614/1‑150 (MQ=255) aCGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGAc < 2:3617943/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCGGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACaa < 1:4047225/150‑1 (MQ=255) ttCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTgcgc < 1:408286/77‑1 (MQ=255) atctcTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCGGCACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAAct < 1:3517883/146‑1 (MQ=255) ggCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTTCCCGCGCCCACAGGCCGCCAAACCCCGGAAGATTTGCGCTGCACCAGTGGGGGCGGGCGCGCCCCCGAAGAGGCCGGGCCAGCAAAGGCAGGATCACCGCCGGGCCGACAAcagc > 2:2515199/1‑150 (MQ=255) tCACGATGGGGGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCAGGCGGACATACCGCTTAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACtgctgc < 2:607742/150‑1 (MQ=39) acgATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCgg < 2:179046/148‑1 (MQ=255) aGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTTCCCCCGCCCACACGCCGACAAACCGCGGAAGATTTGCGCTGCACCGGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAACACGCCGGGCCAGCCAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACAGCGGCGGt > 2:2029577/1‑150 (MQ=255) gATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTgcgc > 2:1905076/1‑67 (MQ=255) gATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTgcgc < 1:1905076/67‑1 (MQ=255) ggTGTTGGTTTCTCCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACCGGCGCACAAACCGCTTATGTTTTGCGCGCCACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAg < 1:3878338/150‑1 (MQ=255) gtTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGaaa < 2:2322847/150‑1 (MQ=255) ttGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGAAAc < 2:2458295/150‑1 (MQ=255) ttGGTTTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACAGGCGGCCATACCGCTGAAGATTTGCGCGGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGAAAc < 2:2271378/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGAAACGc < 1:3542188/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGAAACGc < 1:801446/150‑1 (MQ=255) | TGGGAGGCCTTGAGCATGGCGCGGTCTTCGAGCCATTTGACGTATGACGGGTCGGGCTGGGTCATTTCGCGTCCTCTTTGCGTGTCGGCACCGGCTCAGGTTATGACGGCGCTGCGGCCTGAACGTTCGGCTCAAGATGGGTGTTGGTTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCGGACATACCGCTGAAGATTTGCGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCAAAGGCAGGATCAGCGCCGGGCCGACAACTGCTGCGGTGCCAGAAACGCAT > NC_002947/3320937‑3321233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |