New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3341082 = | 108 (0.660) | 7 (0.050) | 5/224 | NT | 8.2% | intergenic (‑119/+124) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
? | NC_002947 | 3341170 = | 67 (0.490) | intergenic (‑207/+36) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGG‑CCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATCCGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTGGCTACGC > NC_002947/3340933‑3341230 | gcgagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggcagggcc < 2:1400408‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggccgggccatccgagatggccaggcc > 1:4316869‑M1/150‑150 (MQ=255) ctacactggggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTAct > 2:2688515/8‑150 (MQ=255) gagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcccggccatccgagatggccaggccgt > 1:4759265‑M1/148‑148 (MQ=255) tcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTcg < 1:1368193‑M1/7‑1 (MQ=255) gggggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTcgc < 1:1202205/150‑1 (MQ=255) gtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTcgcg < 2:4249982‑M1/9‑1 (MQ=255) gtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTcgcg < 2:2367489‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCgg < 1:3716390‑M1/10‑1 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCgg < 1:3766207/150‑1 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCgg < 1:314236/150‑1 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCgg > 1:4787635/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACCCTTCGCggg < 2:5192913/150‑1 (MQ=255) tcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGc > 2:203020‑M1/139‑150 (MQ=255) gCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGc < 1:1348720/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGAGGGGGATGTACTCTTCGCGGGc > 2:45775/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTTGCGCGGTCATTGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCtt < 2:4091792/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCtt < 2:4092156/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCtt < 2:4092164/150‑1 (MQ=255) gtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCtt > 2:785216‑M1/137‑150 (MQ=255) gtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCtt > 1:2983722‑M1/137‑150 (MQ=255) gtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtggggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCCCGGGCtt > 1:2983866‑M1/137‑150 (MQ=255) cgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGc > 1:2866974‑M1/135‑150 (MQ=255) ttgttgCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGcc < 2:3445803/150‑1 (MQ=255) gttgCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCTTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCCTGCACg > 1:16142/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGctc > 2:3842199/1‑150 (MQ=255) ccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGctc < 2:3011002‑M1/22‑1 (MQ=255) tCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCaa < 2:4528066/150‑1 (MQ=255) 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cggTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGG‑CCCCACAAGCGTCCAATACCt < 1:1573433/150‑1 (MQ=255) gTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGG‑CCCCACAAGCGTCCAATACCtgt < 1:2629719/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCAAGCCCGcgaaga < 1:1217697/121‑6 (MQ=255) ttGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCAAGCCCGcgaaga > 2:1217697/1‑116 (MQ=255) gggCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGG‑CCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCg < 2:4075670/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGG‑CCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGt > 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |