| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3342618 = | 140 (0.850) | 8 (0.050) | 7/252 | NT | 5.8% | coding (175/1587 nt) | ybiT | ABC‑F family ATPase |
| ? | NC_002947 | 3342647 = | 130 (0.840) | coding (146/1587 nt) | ybiT | ABC‑F family ATPase | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CATTTCCGGCAGCGAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCA > NC_002947/3342469‑3342767 | cATTTCCGGCAGCGAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTACCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCAt < 2:5114956/150‑1 (MQ=255) tttCCGGCAGCGAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGa > 1:2150692/1‑150 (MQ=255) ttgatttctaccgctaacatcaccatgcagttcggctccaagccgctgttcgaaaacgtttccgtcaaattcaacaacggcaaccgctacggcctgatcggcgccaacggttgcggcaagtcgaccttcatgaaaatcctcggcggTGAc < 1:611816‑M1/4‑1 (MQ=255) ttgatttctaccgctaacatcaccatgcagttcggctccaagccgctgttcgaaaacgtttccgtcaaattcaacaacggcaaccgctacggcctgatcggcgccaacggttgcggcaagtcgaccttcatgaaaatcctcggcggTGAc < 1:4041483‑M1/4‑1 (MQ=255) tCCGGCAGCGAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGAcc < 2:5017971/150‑1 (MQ=255) gatttctacctctaacatcaccatgcagttcggctccaagccgatgttcgaaaacgtttccgtcaaattcaacaacggcaaccgctacggcctgatcggcgccaacggtttcggcaagtcgaccttcatgaaaatcctcggcggTGACCt > 2:5001082‑M1/145‑150 (MQ=255) ggCAGCGAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTgg < 2:232930/150‑1 (MQ=255) gAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCg > 1:3256930/1‑150 (MQ=255) gAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCg > 2:5425065/1‑150 (MQ=255) gATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACgg > 1:3662033/1‑150 (MQ=255) aTACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGc > 1:1110855/1‑150 (MQ=255) aCGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTc < 2:3145680/150‑1 (MQ=255) cGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTcc < 1:5361362/150‑1 (MQ=255) ggTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCa > 1:1467697/1‑150 (MQ=255) gTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAg < 2:1208188/150‑1 (MQ=255) tCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTATGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAgg > 2:1248125/1‑150 (MQ=255) tCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAgg > 2:103784/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCAc > 2:2284233/1‑150 (MQ=255) 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tttCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGAtttt > 2:4041483/1‑150 (MQ=255) ttCCACAGCTGTCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTTGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTc < 1:4694561/150‑1 (MQ=255) tCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCa < 1:1267364/150‑1 (MQ=255) ccACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCAt < 2:205273/150‑1 (MQ=255) ccACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCAt < 2:2936223/150‑1 (MQ=255) 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aGGCGGGTATTCGGCACGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAAc > 1:3054780/1‑150 (MQ=255) gTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGc < 2:693485/150‑1 (MQ=255) gTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGc > 1:4480751/1‑150 (MQ=255) ttCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTg < 1:1312939/150‑1 (MQ=255) tCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTgg > 1:2445919/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGa < 1:161784/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGa < 2:4431720/150‑1 (MQ=255) ggCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAg > 1:1384337/1‑150 (MQ=255) tCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCg > 2:2472570/1‑150 (MQ=255) cGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGa > 1:460870/1‑150 (MQ=255) gAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGaa > 1:4708608/1‑150 (MQ=255) aGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAAc < 2:4569736/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGc < 2:349031/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGc < 2:3111797/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGc > 1:5335961/1‑150 (MQ=255) TGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCa > 2:3256930‑M1/1‑150 (MQ=255) | CATTTCCGGCAGCGAGTAGATACGGTCACGCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTG‑TCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCA > NC_002947/3342469‑3342767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |