| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3342618 = | 140 (0.850) | 8 (0.050) | 7/252 | NT | 5.8% | coding (175/1587 nt) | ybiT | ABC‑F family ATPase |
| ? | NC_002947 | 3342647 = | 130 (0.840) | coding (146/1587 nt) | ybiT | ABC‑F family ATPase | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGAAATCAA > NC_002947/3342498‑3342792 | gCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCAc > 1:2918365/1‑150 (MQ=255) cTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGCACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGTCGGCTCGAGGTCAcc < 2:4062384/150‑1 (MQ=255) cTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCAcc < 1:3391441/150‑1 (MQ=255) tCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCAccg > 1:3298210/1‑150 (MQ=255) agttcggctccaagccgctgttcgaaaacgtttccgtcaaattcaacaacggcaaccgctacggcctgatcggcgccaacggttgcggcaagtcgaccttcatgaaaatcctcggcggTGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCAccg > 2:932973‑M1/119‑150 (MQ=255) cggctccaagccgctgttcgaaaacgtttccgtcaaattcaacaacggcaaccgcgacggcctgatcggcgccaacggttgcggcaagtcgaccttcatgaaaatcctcggcggTGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGa > 1:1926464‑M1/115‑150 (MQ=255) tttGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAg > 1:4954555/1‑150 (MQ=255) ttGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAgg > 1:911634/1‑150 (MQ=255) cTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGAttt > 2:1241761/1‑150 (MQ=255) tttCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGAtttt > 1:2849405/1‑150 (MQ=255) tttCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGAtttt > 2:4041483/1‑150 (MQ=255) tCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCa < 1:1267364/150‑1 (MQ=255) ccACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCAt > 1:127832/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) GACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTCGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGCCCAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCAt > 1:1831668‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGt < 1:4204839‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGa < 1:1135655‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGAt > 1:3838272‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGAt > 1:3962255‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGtt > 2:3168210/1‑150 (MQ=255) cGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAg < 2:3038175/150‑1 (MQ=255) aCGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCgg < 1:437193/150‑1 (MQ=255) ggCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTg < 1:2037223/120‑1 (MQ=255) cTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGa < 1:1919512/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGa > 2:1986235/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGaa > 2:4335884/1‑150 (MQ=255) caggtcaCCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGGTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCAGGGTGATGTTAGCGGTAGAAAt > 2:3314419‑M2/8‑150 (MQ=255) aggtcaCCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGAAATc < 2:1110855‑M2/144‑1 (MQ=255) gtcaCCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGAAATCaa > 1:4007290‑M2/5‑150 (MQ=255) gtcaCCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGAAATCaa < 1:5425065‑M2/146‑1 (MQ=255) | GCTCGGCTTTGACTTTCCACAGCTGGCCGTGGCCCATGATCACCGTGTCGATCACGGTGAATTCCTCGTAGGCGAACTGGTCCTGGCGCAGCTTGCCCAGGCGGGTATTCGGCTCGAGCATGACCTGGCCTGCGGACGGCTCCAGGTCACCGCCGAGGATTTTCATGAAGGTCGACTTGCCGCAACCGTTGGCGCCGATCAGGCCGTAGCGGTTGCCGTTGTTGAATTTGACGGAAACGTTTTCGAACAGCGGCTTGGAGCCGAACTGCATGGTGATGTTAGCGGTAGAAATCAA > NC_002947/3342498‑3342792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |