New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3934753 = | 153 (0.930) | 10 (0.060) | 6/256 | NT | 6.4% | coding (690/1710 nt) | PP_3466 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 3934792 = | 146 (0.930) | coding (651/1710 nt) | PP_3466 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GCCAGGTGCCCTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAGCGCAGCCA > NC_002947/3934605‑3934902 | gctgttgctggcgctgctggtgccgatcgaagtgctgtggctgcgctggatgcggcgcaaggtggagcgcgaagtgcgcaacttgcgtgagcgctcggcggatgtgtcgtctttcctggtcgagaccctgccggcgatgaagttcattca > 2:2839805‑M1/149‑150 (MQ=255) ctgttgctggcgctgctggtgccgatcgaagtgctgtggctgcgctggatgcggcgcaaggtggagcgcgaagtgcgcaacttgcgtgagcgctcggcggatgtgtcgtctttcctggtcgagaccctgccggcgatgaagttcattCAg > 1:1586587‑M1/148‑150 (MQ=255) ccAGGTGCCCTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGACGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAg > 2:3096780/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCCTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGgc > 2:2653323/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCCTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGgc > 2:1483901/1‑150 (MQ=255) cTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGc > 1:1285870/1‑150 (MQ=255) cTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGc > 2:168875/1‑150 (MQ=255) cTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGc > 2:2109983/1‑150 (MQ=255) gATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTc > 2:4054377/1‑150 (MQ=255) tCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTccc < 1:2840656/150‑1 (MQ=255) tCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTccc > 2:1637985/1‑150 (MQ=255) tCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTccc < 1:453128/150‑1 (MQ=255) cacccaccAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCg < 2:1188862/150‑1 (MQ=255) cccaccAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGc < 2:3602886/150‑1 (MQ=255) caccaGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCt > 1:3872582/1‑150 (MQ=255) caccaGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCt > 2:3944568/1‑150 (MQ=255) aGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCt > 2:4992806/1‑150 (MQ=255) gACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTggccggc > 1:2980900/1‑150 (MQ=255) 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acaGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCtgaatgaa > 2:677896/1‑150 (MQ=255) gctggatgcggcgcaaggtggagcgcgaagtgcgcaacttgcgtgagcgctcggcggatgtgtcgtctttcctggtcgagaccctgccggcgatgaagttcattCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAAc > 1:5426378‑M1/105‑150 (MQ=255) gctggatgcggcgcaaggtggagcgcgaagtgcgcaacttgcgtgagcgctcggcggatgtgtcgtctttcctggtcgagaccctgccggcgatgaagttcatcCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAAc > 1:2080578‑M1/105‑150 (MQ=255) aGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACt < 2:898991/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTcc < 2:517020/117‑1 (MQ=255) gcgcGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTcc > 1:517020/1‑117 (MQ=255) gcgcGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTc > 2:2006935/1‑150 (MQ=255) cgGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATc < 2:1092793/150‑1 (MQ=255) accacGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCg < 2:947615/150‑1 (MQ=255) accacGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCGTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCg < 1:4054377/150‑1 (MQ=255) acGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCa > 1:1662824/1‑150 (MQ=255) acGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCa > 1:1278040/1‑150 (MQ=255) cGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAg > 2:3863339/1‑150 (MQ=255) gAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAgg > 2:1882133/1‑150 (MQ=255) gAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTggcc > 1:1336580/1‑114 (MQ=255) gAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGtctc < 2:1246804/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATc < 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2:728430/1‑150 (MQ=255) gcTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTcgc > 2:1775118/1‑150 (MQ=255) cTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTcgcg < 1:1483913/150‑1 (MQ=255) tGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCgcgc > 1:587214/1‑150 (MQ=255) aCGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTc < 1:167962/150‑1 (MQ=255) gCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCa > 1:1149878/1‑150 (MQ=255) gTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCtt > 2:3133039/1‑150 (MQ=255) gTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCtt > 2:403611/1‑150 (MQ=255) aaCCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTgc > 1:1717974/1‑150 (MQ=255) aaCCTTGCCAAAGCTGGTCAAGGAGCCATGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGTCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCAGCCGAGAGCTCACGCAAGTTGAGCACTTCGCGCTCCACCTTgc > 2:5007825/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTgcgc > 1:152524/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTgcgc > 2:4407469/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGcgcc < 2:4516943/150‑1 (MQ=255) ccAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATc > 1:3703774/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATcc > 1:1402181/1‑150 (MQ=255) caGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACCTCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCa < 2:3745555/149‑1 (MQ=255) tGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAgcgc > 1:5218186/1‑150 (MQ=255) ggTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAGCGCa < 1:4682814/150‑1 (MQ=255) gTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAGCGCAg > 1:1632682/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTcgcg < 1:2652042/122‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAGCGCAGc < 2:4362330/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAGCGCAGcc > 2:468297/1‑150 (MQ=255) | GCCAGGTGCCCTGGATCACCCACCAGCCACCGACCAGGAACGCACAGGCGCGGCACCACGAGGTGAGCGTGCCGGGGATGGCCTGGGTGAAGAATTCGGTCACCTGCACCTTCAGCAGCTGACGCATGTAACCTTGCCCAAGCTGGTCCAGGCGCCCTGCTTCCCGGCCTTGCTGGCCGGCCGCCTGAATGAACTTCATCGCCGGCAGGGTCTCGACCAGGAAAGACGACACATCCGCCGAGCGCTCACGCAAGTTGCGCACTTCGCGCTCCACCTTGCGCCGCATCCAGCGCAGCCA > NC_002947/3934605‑3934902 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |