| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 4770509 | 177 (1.080) | 10 (0.060) | 8/264 | NT | 5.3% | coding (270/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
| ? | NC_002947 | = 4770565 | 182 (1.120) | coding (214/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein | |||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TCCAGGGCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGA > NC_002947/4770360‑4770658 | tCCAGGGCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGC > 2:5033809‑M1/1‑150 (MQ=255) aGGGCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACCGCGTGTCATGCGACTCGAGGCTGCCCCGCACGTCGCCGCCGCCATGCAgg > 1:262396/1‑150 (MQ=255) aGGGCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAgg > 2:2923946/1‑150 (MQ=255) aGGGCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGACACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAgg > 1:4970641/1‑150 (MQ=255) ggCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACTCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTa > 1:2130369/1‑150 (MQ=255) ggCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGtc > 2:4554072/1‑149 (MQ=255) aTCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTAcag < 1:472906/150‑1 (MQ=255) aTCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTAcag < 1:276570/150‑1 (MQ=255) aTCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGGAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTAcag < 2:5092721/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACagcagc < 2:5160330/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAgcgccg > 2:2280155/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAgcgccgc < 1:5017684/150‑1 (MQ=255) gTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGcgccgcgccg < 1:3163220/150‑1 (MQ=255) tCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCgg > 1:1801235/1‑150 (MQ=255) ggAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCa > 1:102044/1‑150 (MQ=255) gAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAg > 1:4341287/1‑150 (MQ=255) cGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCa < 2:3900860/150‑1 (MQ=255) aCTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCATCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGACCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGt > 1:879220/1‑150 (MQ=255) 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ccgccATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCCCCAAGGTAGGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCACGTCGCCCCTGCCCGCAATCAgc < 2:262396/150‑1 (MQ=255) ccATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGcc > 2:1297884/1‑150 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgct < 2:3689266‑M2/113‑54 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgct > 1:3689266‑M2/1‑60 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa < 2:1403513/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa < 1:1811376/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGa < 2:556158/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAg < 2:3565918/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAg < 1:3471844/150‑1 (MQ=255) gCttgtaccgcccgccgcaggccgaccctgcactggccggcgcggcgctgctgtacctgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccg < 2:5284419‑M1/150‑149 (MQ=255) cttgtaccggccgccgcaggccgaccctgcactggccggcgcggcgctgctgtacctgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgagtcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccgt < 2:2890665‑M1/150‑150 (MQ=255) cttgtaccgcccgccgcaggccgaccctgcactggccggcgcggcgctgctgtacctgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccgt > 1:2555815‑M1/1‑1 (MQ=255) cttgtaccgcccgccgcaggccgaccctgcactggccggcgcggcgctgctgtacctgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccgt > 1:2555771‑M1/1‑1 (MQ=255) cAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCACCGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGa < 1:3837718/150‑1 (MQ=255) cAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGa < 2:5022499/150‑1 (MQ=255) cAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGa < 2:3506026/150‑1 (MQ=255) | TCCAGGGCATCGTCACTGGCTGTCGGGAAACGCCACTGCGGCGCCAGCCGGTAGCCCACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGGGCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGA > NC_002947/4770360‑4770658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |