| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 4770509 | 177 (1.080) | 10 (0.060) | 8/264 | NT | 5.3% | coding (270/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
| ? | NC_002947 | = 4770565 | 182 (1.120) | coding (214/957 nt) | PP_4218 | lipase/esterase family protein | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACC > NC_002947/4770416‑4770713 | cACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACaa < 2:102044/150‑1 (MQ=255)cACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACaa < 2:65534/150‑1 (MQ=255)cACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACaa < 1:3114400/150‑1 (MQ=255)cACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACaa < 1:116964/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGACTCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑CCGGTACAAg < 2:2890665‑M2/150‑2 (MQ=255) aCGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAg > 1:2555815‑M2/1‑149 (MQ=255) aCGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAg > 2:2496269‑M2/1‑149 (MQ=255) aCGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCAACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCAGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAg < 1:1165770‑M2/150‑2 (MQ=255) cGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAgc < 2:5284419‑M2/150‑3 (MQ=255) ggCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAgcg > 1:4499037/1‑150 (MQ=255) aaTCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCAc < 2:458065/150‑1 (MQ=255) aaTCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCAc > 1:3519914/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCg > 1:1510856/1‑150 (MQ=255) 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cagcagCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTc > 1:1008852/1‑150 (MQ=255) cagcagCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTc < 2:4922436/150‑1 (MQ=255) agcagcGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCg > 1:2202980/1‑150 (MQ=255) agcagcGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGCTGCTGTACCTgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccgtg > 1:3093804‑M2/1‑51 (MQ=255) cagcGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGaa < 2:4341287/150‑1 (MQ=255) cagcGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGaa < 2:2202980/150‑1 (MQ=255) agcGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAAc > 1:4071146/1‑150 (MQ=255) gcgccgcgccGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGCTGCTGTACCTgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccgtgggctaccgg < 1:3744957‑M2/150‑104 (MQ=255) gcgccgcgccGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGCTGCTGTACCTgcatggcggcggctacgtggtgggcagcctcgattcgcatgacacgctgtgctggaacctggcgcaggatgccggggtgccggtgattgccgtgggctaccgg < 1:3706771‑M2/150‑104 (MQ=255) ggCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGgcgcgc < 1:1391853/150‑1 (MQ=255) cAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTc > 2:3474233/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTcc < 2:2130369/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTcc < 1:1060691/150‑1 (MQ=255) cAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGcc < 1:3360524/98‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCcgccgc < 2:1640951/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAg > 2:265905/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAggg > 1:850260/1‑150 (MQ=255) gcggcgG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATg > 1:2919456/1‑68 (MQ=255) gcggcgG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcat < 2:5025177/150‑1 (MQ=255) gcgg‑gcggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGgcatgca < 2:4498980/150‑1 (MQ=255) gcggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATggg < 2:3103373/150‑1 (MQ=255) cggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGgc < 2:4979085/150‑1 (MQ=255) cggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGgc < 2:2246610/150‑1 (MQ=255) ggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGgca < 2:3519957/150‑1 (MQ=255) ggTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGgca > 1:1116179/1‑150 (MQ=255) aaGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCtcgtcg > 1:594437/1‑69 (MQ=255) aaGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCAcc < 2:1490835/150‑1 (MQ=255) | CACGGCAATCACCGGCACCCCGGCATCCTGCGCCAGGTTCCAGCACAGCGTGTCATGCGAATCGAGGCTGCCCACCACGTAGCCGCCGCCATGCAGGTACAGCAGCGCCGCGCCGGCCAGTGCAGGGTCGGCCTGCGGCGG‑GCGGTACAAGCGCACCGGCAAGGTATGGCCATCGCGGGTGGTCAACGAAAGGTCGCTGATGCAGTCCGGCTCGTCGGCCTTGCCCGCAATCAGCGCCGAGGACTCTTCGAACTGGCGGCGCGCCTCGTCCGCCGCCAGGGCATGCATGGGCAGCACC > NC_002947/4770416‑4770713 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |