| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2080205 = | 60 (0.360) | 11 (0.080) | 5/234 | NT | 15.2% | intergenic (+25/+90) | PP_1853/PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2080286 = | 70 (0.490) | intergenic (+106/+9) | PP_1853/PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAACC > NC_002947/2080138‑2080434 | gCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCTGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACCGCCCTGAATACAGTGGGTTCCTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAaga < 2:322817/150‑1 (MQ=255) ctggggCTGGGGGGGGGGTTCGTTGCCCTGCTGGCCTTTTAGTTAATTATTGCCTGTGCGGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGAACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAagag < 2:2559028/148‑1 (MQ=255) ccggggCGGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGTGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTGCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAagag < 2:3309666/148‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTTGAGTCTTATGGCCGGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGTTATCACAGCCGTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCg < 2:2404258/150‑1 (MQ=38) tGGGGGGGGGTTTCGAGGCCGTGCAGGCCCTTTAGAGAATTTTTGCCTGTGCGGGCATTTACGGGGGCCGGCCCGAACCCACAGGTATATCACCGCCGTGAAGACCGTGGGTTCTTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGtt < 2:923748/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGtg > 2:3587080/1‑149 (MQ=255) ggggggggcggTTCTATGCCCTGCCGGCCCTTTTTTGATTTATTGCCGGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGtt < 2:2900498/146‑1 (MQ=255) aTGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGGTCAGACAACAACGACa > 2:1222119/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGa < 2:1249533/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGAAAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCAGAGGCCGGTTCAGACAACAACGACAATGa > 2:3910831/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTATTCGCGGGCCCCCCCGCACCCACAGGCATATCAAAGCCCTGAAGACAGTGGGGTGCGTGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGGTCAGACAACATAGACaaacaa > 2:2075682/1‑146 (MQ=255) aaTTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCAACCACAGGGATATAAAAGCCCTGAAGACAGTGGGGTGCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCa > 2:3782081/1‑150 (MQ=255) attattGCCTGTGCCGGCCTTTGCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACCGCCCTGACGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAg < 2:1004524/150‑1 (MQ=255) tattGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCCCCCGCAACCACAGGGCAAAAACAGCCCTGTAGACAGTTGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGACGCCCCGTCAGACAACAACGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCCGGt > 2:2815152/1‑150 (MQ=255) tGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCa < 2:5376014/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTGCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACAACGACAAAGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCAc > 2:2072749/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGCCGGCCTTTCGGCGGGCCCGCCCGCACCCCCGGGTATACCACCCCCCTGACGCCCGTGGGGCCGTGGGGGCAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCAc < 1:5056615/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATAACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGCGGCCGGTTCAGGCAACAAAGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGcccc > 2:5065334/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGATGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTc < 2:2719593/150‑1 (MQ=255) tggcGGCTTTTGCGGGGGCCGGCCCGCACCCCCTGTGTTATCCCCCCCGTGATGACTGTGGGGTCTTTGGGGGGGGGGGGGGCCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGt < 1:4156041/147‑1 (MQ=255) gcggcccTTTGGGCGGCCCCGCCCCCACCCACCGGTATAACACCGCCCTGACGACTGGGGGGTCGTGGGGGGCGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTc < 1:2327533/145‑1 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGGCATc > 2:4867130/1‑150 (MQ=255) gtGCGGGCGGGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGc < 2:2540949‑M1/148‑1 (MQ=255) 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ggcccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCaa > 1:1385633‑M2/11‑150 (MQ=255) gcccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAAt > 1:33399‑M2/10‑150 (MQ=255) gcccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAAt > 1:1731534‑M2/10‑150 (MQ=255) cccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATc < 2:4262278‑M2/142‑1 (MQ=255) ccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCt > 1:574756‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCt > 2:3306496‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCt > 2:2933391‑M2/8‑150 (MQ=255) cgcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCtt > 2:4576186‑M2/7‑150 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTc > 2:2719851‑M2/6‑150 (MQ=255) gcgaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACC‑TCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCa > 1:1309072‑M2/6‑150 (MQ=255) gaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCaa > 2:1438138‑M2/4‑150 (MQ=255) gaaGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCaa > 2:1437954‑M2/4‑150 (MQ=255) aGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAAcc > 1:2765715‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGTGGGGTAATCACCGTCACCAGCCCGTCACCCTCGCCAATCTTCAACC > NC_002947/2080138‑2080434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |