| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) ttCCGGCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGc < 1:4942554/150‑1 (MQ=255) ttCCGGCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGc < 2:2717529/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGcgccggaagagccggcaccgaccaccagtaccgcgccttcaggcaactgctctgggtt < 1:706471‑M2/89‑59 (MQ=255) cGGCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGa > 1:5354467/1‑141 (MQ=255) cGGCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCaa < 2:3137687/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAg < 1:2437384/150‑1 (MQ=255) gTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGcgccggaagagccggcaccgaccaccagtaccgcgccttcaggcaactgctctgggttgaagtaagcggcggaatgaatctggtgcaggttgctgtctttcggcgcgatggccgggatcaccgg < 2:4740869‑M2/150‑125 (MQ=255) tGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCg < 2:2445072/150‑1 (MQ=255) aGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTc > 2:3967442/1‑150 (MQ=255) aGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTc > 1:307455/1‑150 (MQ=255) ttGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTcgcg < 1:3304518/150‑1 (MQ=255) cGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTCGCGAGCa > 2:2254997/1‑150 (MQ=255) gAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTCGCGAGCAt > 2:3842778/1‑150 (MQ=255) agCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTCGCGAGCATGTGa < 2:4535316/150‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTCGCGAGCATGTGACCATcg > 1:3637178/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTCGCGAGCATGTGACCATcgc > 1:3273019/1‑150 (MQ=255) | GGTGATCCCGGCCATCGCGCCGAAAGACAGCAACCTGCACCAGATTCATTCCGCCGCTTACTTCAACCCAGAGCAGTTGCCTGAAGGCGCGGTACTGGTGGTCGGTGCCGGCTCTTCCGGCGTGCAGATTGCCGAAGAGCTGATGCGCGCCGGACGCCAGGTGTACCTGTCGGTCGGCGCCCACGACCGCCCGCCGCGTGCCTACCGCAACCGCGACTTCTGCTGGTGGCTGGGCGTGCTGGGCGAGTGGGACGCGGAAATTGCCAAGCCCGGTCGCGAGCATGTGACCATCGCGG > NC_002947/4055809‑4056104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |