New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4847095 = | 98 (0.600) | 9 (0.060) | 9/236 | NT | 9.4% | intergenic (+14/‑123) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4847188 = | 88 (0.610) | intergenic (+107/‑30) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCC > NC_002947/4847039‑4847337 | gTTGGGTGACGAAGCCCTGCACGGCGCCGAACACCAACAGGAGCAACACCGCAAAGCCCTGTGGGCGCGGGCACGCCCGCGAATGCTATCGCTCCGGCACTGGTATTTCCAGGTCTGCCGCATGCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGt < 1:3403575/150‑1 (MQ=255) gggTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGAAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTc < 1:405280/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCt < 2:2493512/150‑1 (MQ=255) 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aaCACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCt < 2:5282468/150‑1 (MQ=255) aGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCCCGAATGCGATAGCTCAGGCCAACGTATTTCCCGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCACAGGGTTTGCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCaa > 2:3242505/1‑150 (MQ=255) cAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAc < 2:2167635/150‑1 (MQ=255) cAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAc < 2:784570/150‑1 (MQ=255) cacCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAcccc > 2:4080413/1‑150 (MQ=255) 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2:3475129/4‑150 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACACCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgc > 1:50680/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGcc > 1:5274816/1‑150 (MQ=255) gcgcCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGcccc > 2:2104410/1‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCAACACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGc > 2:5392496‑M2/16‑150 (MQ=255) gctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctg > 2:3936935‑M2/13‑137 (MQ=255) gctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctg < 1:3936935‑M2/125‑1 (MQ=255) ccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAgg > 1:2878281‑M2/9‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc < 2:290566‑M2/143‑1 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 1:1715593‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc < 2:3734081‑M2/143‑1 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 2:695218‑M2/8‑150 (MQ=255) cagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCgg > 2:5174576‑M2/6‑150 (MQ=255) cagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTATGCTGCCCCGGCTGTCAGGCgg > 1:548278‑M2/6‑150 (MQ=255) agggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt < 2:3092824‑M2/146‑1 (MQ=255) agggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt < 1:260863‑M2/146‑1 (MQ=255) tttCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGcc < 2:601469/150‑1 (MQ=255) tttCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGcc < 2:1241861/150‑1 (MQ=255) tttCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGcc > 2:1446519/1‑150 (MQ=255) | GTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCC > NC_002947/4847039‑4847337 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |