New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5117384 | 192 (1.170) | 14 (0.090) | 8/262 | NT | 6.9% | coding (372/861 nt) | PP_4500 | TrpH family protein |
? | NC_002947 | = 5117412 | 192 (1.190) | coding (344/861 nt) | PP_4500 | TrpH family protein |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
TGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCA > NC_002947/5117263‑5117554 | ctggctgcgtgccgaagaaatcgacagacggctggcggccaagggcaTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCgg > 1:1660374‑M1/48‑150 (MQ=255) tggctgcgtgccgaagaaatcgacagacggctggcggccaagggcaTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCggg > 2:655231‑M1/47‑150 (MQ=255) cGGCGCCCAGCCACGTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGgca > 2:3944449‑M2/1‑147 (MQ=255) 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ccACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGgc < 1:5389247/150‑1 (MQ=255) cACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCGTGgcc > 2:4230537/1‑150 (MQ=255) cTTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGgccgc > 1:662876/1‑150 (MQ=255) tGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCa < 1:4672889/150‑1 (MQ=255) gAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGcc > 2:5334963/1‑150 (MQ=255) 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cACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGgcagcacgagttgggtgacagcggcaacgccccggcgcgcccgcattttgccgagtatctggtgcgggccgggcacgtcaaggaccgtggtgaagcgtttcgcaagtggctgggcgccggc < 1:5056999‑M2/150‑122 (MQ=255) cACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGgcagcacgagttgggtgacagcggcaacgccccggcgcgcccgcattttgccga < 2:5112682‑M2/83‑55 (MQ=255) cACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGgcagcacgagttgggtgacagcggcaacgccccggcgcgcccgcattttgccga < 2:2383742‑M2/83‑55 (MQ=255) aCGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGTgcagcacgagttgggtgacagcggcaacgccccggcgcgcccgcattttgccgagtatctggtgcgggccgggcacgtcaaggaccgtggtgaagcgtttcgcaagtggctgggcgccggca < 2:3516247‑M2/150‑123 (MQ=255) aCGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGcaca > 1:2534832/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTgg < 1:4102679/129‑1 (MQ=255) ggCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACatg > 1:192386/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACatggatgg < 2:5364061/150‑1 (MQ=255) cgcgcCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGt > 2:3978342/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTc > 2:3769075/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCgcgc > 1:2390728/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGcgcc > 1:2479845/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGcgcc > 1:3745704/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGcgccg > 1:2209644/1‑150 (MQ=255) cGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGcgccgc < 2:1188164/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGAGTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCCTAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGccc > 1:3630229/1‑150 (MQ=255) | TGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTCCTTGACGTGCCCGGCCCGCACCAGATACTCGGCAAAATGCGGGCGCGCCGGGGCGTTGCCGCTGTCACCCAACTCGTGCTGCACGGCGCGCGCGCCTTCGAGCGTGCCGGGCATGCCCTTGGCCGCCAGCCGTCTGTCGATTTCTTCGGCACGCAGCCAGCGGCCGTGGTGCAGCGCTTGAATCGCCGCCAGCAGTGGCGGTGCGTCGAGTGGGAAGTCATAACCCAGCACATGGATGGTCGCGCCGCCCCA > NC_002947/5117263‑5117554 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |