New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5642209 = | 49 (0.300) | 10 (0.080) | 7/200 | NT | 27.6% | intergenic (+8/‑102) | PP_4950/PP_4951 | hypothetical protein/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
? | NC_002947 | 5642293 = | 16 (0.130) | intergenic (+92/‑18) | PP_4950/PP_4951 | hypothetical protein/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
GCCCGGGGCACTGGTCAAAGGCCTGACCCTGACATTGTGACTGGACTTGCCGGCCCTTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGCTCGTTG > NC_002947/5642162‑5642442 | gCCCGGGGCACTGGTCAAAGGCCTGACCCTGACATTGTGACTGGACTTGCCGGCCCTTTAGCGGCTAAAGCCCCACCGACAAGGCCCCCGTAACCCCCGGTGGCGCGGCGTTTGCCCCGGAAGGGCCCGCCCAGCCAAACCAGGGCGTCa > 2:4603608/1‑150 (MQ=255) cACTGGTCAACGGCATGCCCCTGACATTGGGACGGGACTTGCCGGCCCTTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACACGGAACGCGTAACCCGTGTTGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGaa < 2:5422098/150‑1 (MQ=37) tgacATTGTGACTGGACTTGCCGGCCCTTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGGAAACCCTGGAGGAGCGGCGTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGGCAAACCAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCCCGGGAcccccac > 2:3548628/1‑147 (MQ=37) ccGGCCTTTTGGGGGCTAACGCCGCCCCTAACCGCACCGCTAAACCCGTGTAGGCGCGTCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTg < 2:330381/150‑1 (MQ=255) ccGGCCCGTTGGGGGCTACCCCCGCCCCAACACGTACCGCTTACCCCTTTTCGGCGGGGATTGAGCCGCGAAGGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTg < 2:82710/150‑1 (MQ=255) CGGCCCTTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGTAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTgg > 2:4521441‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGGGTTACGCGTTCCTTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCa < 1:3089617‑M1/150‑1 (MQ=255) CGGCTAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCAt < 1:3757736‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAACCGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCg < 2:4335154‑M1/150‑1 (MQ=255) TAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGcc < 2:2082376‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGGGGTGGCCGTCGcctg < 1:4635820‑M1/150‑2 (MQ=255) GCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCcttct < 2:506955‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACATGGAACGCGTAACCCCTGTTGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCcttctt > 2:4859443‑M1/1‑150 (MQ=255) gctcctacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCa > 1:1639992‑M2/60‑150 (MQ=255) GCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCa < 1:2390172‑M1/150‑1 (MQ=255) ctcctacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCAt > 2:2449819‑M2/59‑150 (MQ=255) tcctacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGaa > 2:2138161‑M2/58‑84 (MQ=255) tcctacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGaa < 1:2138161‑M2/27‑1 (MQ=255) tcctacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATg > 2:2600888‑M2/58‑150 (MQ=255) tcctacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATg > 2:5326893‑M2/58‑150 (MQ=255) CTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCa < 2:3659361‑M1/150‑1 (MQ=255) CTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCa < 2:3659368‑M1/150‑1 (MQ=255) tacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATg > 2:5122967‑M2/55‑75 (MQ=255) tacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATg < 1:5122967‑M2/21‑1 (MQ=255) tacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAg > 2:3752215‑M2/55‑150 (MQ=255) tacaggggttacgcgttccttgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAg > 2:4094184‑M2/55‑150 (MQ=255) TACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAg < 2:336740‑M1/150‑1 (MQ=255) TACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAg < 2:1379780‑M1/150‑1 (MQ=255) TACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAg < 1:1841895‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGt < 1:1954907‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTccc < 1:506955/150‑1 (MQ=255) gAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTg > 2:40475/1‑150 (MQ=255) gAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTg < 2:2390172/150‑1 (MQ=255) gcgTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTTACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACg > 1:4465967/1‑150 (MQ=255) gcgTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACg > 1:4658772/1‑150 (MQ=255) gcgTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACg > 1:978999/1‑150 (MQ=255) gcgTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACg > 1:4658654/1‑150 (MQ=255) gTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGc > 2:4768983/1‑150 (MQ=255) aaCCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCAc > 2:5337329/1‑150 (MQ=255) aaCCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCAc > 2:5337297/1‑150 (MQ=255) aaCCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCAc > 1:2754481/1‑150 (MQ=255) aCCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCAcc > 1:1252580/1‑150 (MQ=255) aCCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCAcc > 2:5234558/1‑150 (MQ=255) aCCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCAcc > 1:1252577/1‑150 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCa > 2:744814/1‑150 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCAt > 1:1359622/1‑150 (MQ=255) tgtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCt > 1:1508652‑M2/35‑150 (MQ=255) gtaggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTc < 1:744814‑M2/117‑1 (MQ=255) aggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTg > 2:803353‑M2/32‑133 (MQ=255) aggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTg < 1:803353‑M2/102‑1 (MQ=255) ggagcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAac > 2:4722679‑M2/31‑150 (MQ=255) gcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACAct > 1:4610299‑M2/28‑150 (MQ=255) gcggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACAct > 2:714271‑M2/28‑150 (MQ=255) cggctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActg > 1:3874838‑M2/27‑150 (MQ=255) gctttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActgcc > 2:2093528‑M2/25‑150 (MQ=255) gattttcccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActgcc < 2:2143710‑M2/126‑1 (MQ=255) tttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActgccct > 1:588233‑M2/23‑150 (MQ=255) tttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActgccct > 1:2121735‑M2/23‑150 (MQ=255) tttagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActgccct > 1:1875262‑M2/23‑150 (MQ=255) tagccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACActgccctgc > 1:4344969‑M2/21‑150 (MQ=255) ccgcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCgg > 1:2148312‑M2/18‑150 (MQ=255) gcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGcc > 2:3555185‑M2/16‑150 (MQ=255) gcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGcc > 1:4227738‑M2/16‑150 (MQ=255) gcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGcc > 2:4788721‑M2/16‑150 (MQ=255) gcgaaagggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGcc > 2:3330676‑M2/16‑150 (MQ=255) taacgggccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCAt < 1:2746775‑M2/137‑1 (MQ=255) ccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGcc < 2:3241921‑M2/135‑1 (MQ=255) ccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGcc > 1:3241921‑M2/7‑141 (MQ=255) ccggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGc > 2:1065562‑M2/7‑150 (MQ=255) cggcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGCt > 2:1476157‑M2/6‑150 (MQ=255) gcaCTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGCTCg > 1:3018913‑M2/4‑150 (MQ=255) cTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGCTCGTTg < 2:1066346/150‑1 (MQ=255) cTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGCTCGTTg > 1:3662146/1‑150 (MQ=255) | GCCCGGGGCACTGGTCAAAGGCCTGACCCTGACATTGTGACTGGACTTGCCGGCCCTTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAAGGAACGCGTAACCCCTGTAGGAGCGGCTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCACTGACAAACGAGGACGTCATGCCCGAACGCACCCCGCTGGACCCCGTCACCGCCCGCTGGATCCCTTGGGTGGTGGCCATCGCCTTCTTCATGCAGTCCCTGGACGGCACCATCCTCAACACTGCCCTGCCGGCCATGGCCCGCTCGTTG > NC_002947/5642162‑5642442 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |