| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2181342 | 283 (1.070) | 312 (1.190) | 141/292 | 0.2 | 68.3% | intergenic (+176/+92) | PP_1931/PP_5486 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4459540 = | 8 (0.030) | coding (212/696 nt) | pcaI | 3‑oxoadipate CoA‑transferase subunit A | |||||
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
ATGCCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2181193‑2181342‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTC > NC_002947/4459540‑4459688 ATGCCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGG > 2:272538/1‑150ATGCCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGG < 2:3014714/150‑1 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1:193688/150‑1 CCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGC > 2:4534113/1‑150 CCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGC < 2:5086693/150‑1 CCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGC < 1:650322/150‑1 CCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCG > 2:3899531/1‑150 CAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGC > 2:4090318/1‑150 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TAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGA < 1:4452603/124‑1 CCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTG > 2:5445778/1‑150 GCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGA < 2:4911891/150‑1 GCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGA < 1:421462/150‑1 CCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGC > 2:1502409/1‑150 CCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGC < 1:2970020/150‑1 TTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGT > 1:481686/1‑150 AACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATC > 2:4020788/1‑150 AACGCAATTCGCGTGTTTACACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATC < 2:1886105/150‑1 CGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCG < 1:3765119/150‑1 CATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCG > 1:3187406/1‑150 ATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGC < 2:2029325/150‑1 CGCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCA < 1:1818931/150‑1 GCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAG < 2:3532721/150‑1 GCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAG > 2:729591/1‑150 GCGTGTTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGGTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAG < 1:1722315/150‑1 TTTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCC > 1:3066129/1‑150 TTTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCG > 1:5657933/1‑150 TTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGG < 2:2880304/150‑1 CACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATT < 1:5706350/150‑1 ACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG < 2:2376610/150‑1 ACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG > 2:3447915/1‑150 ACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG < 2:78128/150‑1 ACAGCCTGGCGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG < 1:123055/150‑1 GCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTG > 1:5157982/1‑150 CCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGC < 1:287261/150‑1 ATGCCCAAAAGACCTCAAGAACGACTCACATCGCCACATGCGCCCCAGCACGGCGATTTGAGCTAAACCACGCAATTTCTTGCCAGTTTGGCAAGCCTCTCTAGATCCCTGCGCCCTTCAACGCATTTCGCGTGTTTTCACACAGCCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2181193‑2181342‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTC > NC_002947/4459540‑4459688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |