Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	583538	583579	42	4 [3]	[3] 4	tfaX/appY	pseudogene, DLP12 prophage;Phage or Prophage Related/global transcriptional activator; DLP12 prophage

TTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACT  >  NC_000913/583575‑583647      |                                                                    tttGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGa       >  1:997587/1‑68 (MQ=255) tttGTGTATAAAAAAATAAATGCACATCATACTGATTATGATTGTGTTTTTAATTGGTAGTTATTTGa       >  2:789948/1‑68 (MQ=255)  ttGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGac      <  1:372655/68‑1 (MQ=255)      gtATAAAAATTTAAATGCACAGCTTCCTGAGAATGAGTGTGTATTTAATTGTTTGCTATTTGactaca  <  1:789942/68‑2 (MQ=255)      |                                                                    TTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACT  >  NC_000913/583575‑583647

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑