| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 771005 = | 9 (0.480) | 27 (1.450) | 19/132 | 0.1 | 75.0% | intergenic (+394/‑453) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/771071‑771005‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < NC_000913/1050545‑1050480 CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAG < 1:570941/68‑1 TTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTTAGGT > 2:302224/1‑68 TTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGT > 1:344675/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 1:363732/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 2:471422/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGATTTAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 1:420670/1‑68 CATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT < 1:302226/68‑1 TATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAA < 2:523689/68‑1 TATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAA < 1:345617/68‑1 TATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAA < 1:649613/68‑1 TGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 2:363730/68‑1 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 2:94666/1‑68 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 1:613491/1‑68 AAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:141281/68‑1 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:147583/60‑1 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT > 2:147583/1‑60 TGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:394205/68‑1 GTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 2:674466/68‑1 TGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 1:157337/1‑68 TTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:444618/1‑68 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:157337/68‑1 TTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 2:613487/68‑1 TTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 2:240331/1‑68 TTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:21875/68‑1 TTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 2:548192/1‑68 TTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 1:538155/68‑1 AAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG > 1:639561/1‑68 CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/771071‑771005‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < NC_000913/1050545‑1050480 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |