| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 771005 = | 15 (0.670) | 42 (1.870) | 27/132 | 0.0 | 73.7% | intergenic (+394/‑453) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/771071‑771005‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC < NC_000913/1050545‑1050479 aTTTAGTGACATTAATGTTTAAAATGTGTGTTTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGGTGGCAATTAAG > 2:159253/2‑68CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAG > 2:819662/1‑68CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAG > 2:429585/1‑68 ttaAGTGACATATATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGG > 2:364638/4‑68 TTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGG < 2:315465/68‑1 TTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGG > 1:658023/1‑68 TTTAGAGACATTTATGATTTAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTATCGGTTGGCTATTAAGG > 2:86217/1‑68 TTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGAAAATTAAGGT > 1:148140/1‑68 TGACATTTATGTTTAAAGTGTGTGAGTTATAAGGCTGAAGTTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATG > 1:804050/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCTAATAAGGTAATGA > 2:629420/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTATTGA < 2:83377/68‑1 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 2:483921/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 1:460919/1‑68 CATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTTGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT < 1:461228/68‑1 TATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAA < 2:187050/68‑1 TGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:364637/68‑1 TGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 2:705699/68‑1 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 2:174670/1‑68 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 2:713575/1‑68 TTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTA < 1:483920/68‑1 AAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAGTTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:332911/1‑68 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:609836/1‑68 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT > 1:548772/1‑60 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 2:548773/60‑1 TGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:81056/68‑1 TGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 2:786296/68‑1 GAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:658024/68‑1 GTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGGCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTg > 1:431994/1‑67 TTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:134850/1‑68 TTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:740832/1‑68 TTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 2:809830/68‑1 AAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:371097/1‑68 GCTGAATTTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:332912/68‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCTATTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATTGTGATTTATGATAAGA > 2:563328/1‑68 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCTACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:342678/68‑1 ATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 2:73634/1‑68 TCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 1:752867/68‑1 CGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:527132/68‑1 GTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT > 2:829094/1‑68 GGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGACAATGCCCGATGACTTTGT < 1:294858/68‑1 GCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC < 2:226905/68‑1 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC > 1:67246/1‑68 CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/771071‑771005‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC < NC_000913/1050545‑1050479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |