| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 57 (2.540) | 29/132 | 0.0 | 89.1% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 807574 | 7 (0.310) | coding (336/477 nt) | ybhB | kinase inhibitor homolog, UPF0098 family | |||||
TCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACG > NC_000913/807518‑807640 | tCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgc < 1:214899‑M2/68‑12 (MQ=255) cGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcc > 1:648659‑M2/1‑56 (MQ=255) cGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcc > 1:366413‑M2/1‑56 (MQ=255) aCATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTcggcgg > 2:108946/1‑68 (MQ=255) tCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAATAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactt < 2:267877‑M2/68‑18 (MQ=255) tCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactt < 2:433005‑M2/68‑18 (MQ=255) cAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactta > 1:382841‑M2/1‑50 (MQ=255) aCGTTCTATCTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga > 1:300384‑M2/1‑46 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga > 1:832688‑M2/1‑46 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGAAAAAAAGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactaactga < 1:309024‑M2/68‑23 (MQ=255) cGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgat > 1:387355‑M2/1‑45 (MQ=255) gTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatt > 1:94569‑M2/1‑44 (MQ=255) gTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatt > 2:503409‑M2/1‑44 (MQ=255) ttCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgattt < 1:739767‑M2/68‑26 (MQ=255) tCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgattta < 1:296931‑M2/68‑27 (MQ=255) cTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:459954‑M2/68‑28 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTCGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:493510‑M2/1‑40 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:250091‑M2/1‑40 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:571575‑M2/1‑40 (MQ=255) atatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtg < 2:310310‑M2/68‑30 (MQ=255) atatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact > 2:72‑M2/1‑39 (MQ=255) atatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact < 1:72‑M2/55‑17 (MQ=255) tatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgattttgtgt > 2:130881‑M2/1‑38 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTAcc > 1:432104/1‑68 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACTGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactta > 2:352221‑M2/1‑36 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:321411‑M2/68‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgcat > 1:246292‑M2/1‑36 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactta < 1:352220‑M2/54‑19 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgctgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:644381‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 1:436610‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:10522‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 1:193873‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCg > 2:819309/1‑68 (MQ=255) caagcGCGTGAACGGTAAATATGTAGAGATGAGTTggtgatgctgcctacttactgatttagtgtatg < 2:644379‑M2/66‑34 (MQ=255) caagcGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgatgaaaaattactgatttagtgtatg < 2:268394‑M2/66‑34 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:59676‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:571251‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt < 1:25833‑M2/62‑29 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 2:25833‑M2/1‑34 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCgg > 1:640453/1‑68 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCgg > 2:99438/1‑68 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCgg > 1:218940/1‑68 (MQ=255) cgTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg < 1:829819‑M2/68‑40 (MQ=255) tGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 2:436611‑M2/1‑27 (MQ=255) tGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 2:212388‑M2/1‑27 (MQ=255) tGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 1:10522‑M2/1‑27 (MQ=255) tGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGCTggcgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgct > 1:131205‑M2/1‑27 (MQ=255) aaCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaactttctgatttagtgtatgatggggtttt < 2:186988‑M2/68‑44 (MQ=255) aCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcc < 1:325795‑M2/36‑13 (MQ=255) aCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcc > 2:325796‑M2/1‑24 (MQ=255) cGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAg < 2:46447/68‑1 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct > 2:321412‑M2/1‑16 (MQ=255) tGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc < 2:238728‑M2/68‑55 (MQ=255) tGAAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc > 1:742497‑M2/1‑14 (MQ=255) gCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactggtttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 2:789008‑M2/68‑59 (MQ=255) gCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 2:194772‑M2/68‑59 (MQ=255) gATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc < 2:361243‑M2/68‑61 (MQ=255) gATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc < 1:646369‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 2:349765‑M2/1‑7 (MQ=255) aTGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 2:186002‑M2/1‑7 (MQ=255) ttggttatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgcttttgatgtgctccagtggcttcttt > 1:602250‑M2/1‑2 (MQ=255) ttggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt > 1:791358‑M2/1‑2 (MQ=255) ttggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt > 1:542400‑M2/1‑2 (MQ=255) ttggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggcgctccagtggcttctgt > 1:763301‑M2/1‑2 (MQ=255) | TCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACG > NC_000913/807518‑807640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |