| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 105 (3.280) | 38/132 | 0.0 | 80.8% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 807574 | 25 (0.780) | coding (336/477 nt) | ybhB | kinase inhibitor homolog, UPF0098 family | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAA > NC_000913/807507‑807638 | tGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGtt < 2:876938/68‑1 (MQ=255) gCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTc < 1:245194/68‑1 (MQ=255) cACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCg > 2:743043/1‑68 (MQ=255) cTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgat < 2:1068697‑M2/68‑7 (MQ=255) aTCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTcg < 1:1122786/68‑1 (MQ=255) cGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcc > 2:1163171‑M2/1‑56 (MQ=255) cGACATCAATACGTTCTAAATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcc > 1:419966‑M2/1‑56 (MQ=255) cGACATCAATACGATCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTcggc > 2:331551/1‑68 (MQ=255) gACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgcca < 2:1093009‑M2/68‑14 (MQ=255) gACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGATggtgatgctgcca < 2:778640‑M2/68‑14 (MQ=255) aCATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTgg > 2:1156965‑M2/1‑54 (MQ=255) aCATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGAAGAGATGAGTTggtgatgctgccaa < 2:633120‑M2/68‑15 (MQ=255) aTCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact > 1:690940‑M2/1‑52 (MQ=255) aTCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact > 1:1178009‑M2/1‑52 (MQ=255) aTCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact > 1:315009‑M2/1‑52 (MQ=255) tACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTgcg > 1:210720/1‑68 (MQ=255) aCGTTCTATATCCTGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga > 2:1010104‑M2/1‑46 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga < 2:72140‑M2/68‑23 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga < 2:550492‑M2/68‑23 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga > 1:265882‑M2/1‑46 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga > 1:269501‑M2/1‑46 (MQ=255) aCGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga < 2:207527‑M2/68‑23 (MQ=255) gTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCa > 2:331897/1‑68 (MQ=255) gTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCa > 1:1133310/1‑68 (MQ=255) cTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttag < 2:71871‑M2/68‑28 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:72140‑M2/1‑40 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:550492‑M2/1‑40 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgacttagt > 2:1132530‑M2/1‑40 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGt < 1:1155306/68‑1 (MQ=255) tataTCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGCAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 2:935641‑M2/1‑40 (MQ=255) tatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGTGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:1093010‑M2/1‑38 (MQ=255) tatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgt < 2:287615‑M2/68‑31 (MQ=255) tatCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 2:693220‑M2/1‑38 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:242010‑M2/68‑32 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:295124‑M2/68‑32 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 2:708365‑M2/68‑32 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:397316‑M2/68‑32 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:1016995‑M2/68‑32 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgt < 2:855334‑M2/67‑31 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:855334‑M2/1‑37 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTAcc > 1:580556/1‑68 (MQ=255) atCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTAcc > 1:605486/1‑68 (MQ=255) atCCAGAGAGTGAACGGTAAAAATGTAGCTATGAGTTTCGCATTTCGGAGGAGCTGAGCCGTCGTAcc > 2:416612/1‑68 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:335671‑M2/68‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:1080441‑M2/68‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:879555‑M2/68‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:842248‑M2/68‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:647479‑M2/68‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:68996‑M2/1‑36 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagt < 2:68996‑M2/64‑29 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact > 2:1128494‑M2/1‑36 (MQ=255) tCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTAccc > 1:116565/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTGGACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:400805‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 1:808576‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:388559‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:661128‑M2/68‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga > 2:175148‑M2/1‑35 (MQ=255) ccAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactga < 1:175148‑M2/57‑23 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:337930‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:271953‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:684846‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:1014371‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:89962‑M2/68‑35 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 1:172364‑M2/1‑34 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:172364‑M2/66‑33 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCgg > 2:479028/1‑68 (MQ=255) cAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCgg > 1:6854/1‑68 (MQ=255) gcgcGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:152362‑M2/68‑37 (MQ=255) gcgcGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:935249‑M2/68‑37 (MQ=255) cgcgTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaact > 2:237292‑M2/1‑31 (MQ=255) gcgGGAACGGTAAATTTGTAGCGATGAGTTggtgatgctgacaacttactgatttagtgtatgttggt > 1:1173946‑M2/1‑30 (MQ=255) tttacggTATAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 1:778640‑M2/4‑27 (MQ=255) tGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 1:248484‑M2/1‑27 (MQ=255) tGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 2:368225‑M2/1‑27 (MQ=255) ggaACGGTAAAAATGTTGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 2:130638‑M2/2‑27 (MQ=255) aaCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 2:1127623‑M2/68‑44 (MQ=255) aaCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCaa > 1:361409/1‑68 (MQ=255) aCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 1:1002510‑M2/68‑45 (MQ=255) aCGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 1:585435‑M2/68‑45 (MQ=255) ggTAAAAATGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:580989‑M2/1‑22 (MQ=255) aaaTGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 2:242010‑M2/1‑17 (MQ=255) actgtAGCGATGAGCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct > 2:363824‑M2/3‑16 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct < 1:673286‑M2/68‑53 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct < 1:1131891‑M2/68‑53 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGt > 1:417443/1‑44 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGt < 2:417443/44‑1 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGt > 1:1067673/1‑44 (MQ=255) aaTGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGt < 2:1067672/44‑1 (MQ=255) tGTAGCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc < 2:364668‑M2/68‑55 (MQ=255) tGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTAcgc > 2:244311/1‑68 (MQ=255) tGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTAcgc > 1:13850/1‑68 (MQ=255) gCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 1:137244‑M2/68‑59 (MQ=255) gCGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 2:38322‑M2/68‑59 (MQ=255) cGATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg > 1:1127625‑M2/1‑9 (MQ=255) cGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTg > 2:1013423/1‑68 (MQ=255) gATGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc < 1:567284‑M2/68‑61 (MQ=255) ttgAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 1:1008112‑M2/2‑7 (MQ=255) aTGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 2:842248‑M2/1‑7 (MQ=255) tGAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 1:148590‑M2/68‑63 (MQ=255) aGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct > 1:689954‑M2/1‑4 (MQ=255) | TGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAA > NC_000913/807507‑807638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |