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AAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCAC < 2:1255353/169‑1 AAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGA < 1:1044642/250‑1 AGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAG > 1:392465/1‑250 cttccgatctTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTT < 1:627870/240‑1 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AAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTAT < 1:660106/138‑1 AGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATCCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTTGTTGTAGGACTGACAGTAACGC > 2:451748/1‑250 TATTACAANTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCATTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCG < 2:715254/250‑1 cttccgatcTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCG < 1:1307296/241‑1 TTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC < 2:938208/134‑1 TTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC > 1:938208/1‑134 TACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCGGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCG < 2:843411/244‑1 TACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCGGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCG > 1:843411/1‑244 CAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTC < 2:678552/250‑1 TTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAA > 1:1071055/1‑139 TTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAATCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTC < 1:683233/167‑1 TTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAATCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTC > 2:683233/1‑167 TTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGCCAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTGGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCCGTTGTTGTTGTTGATTTTAGTACTGACAGTAGCTCGGCGCGGcatcgggaa > 2:1307296/1‑241 ACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTA < 1:324754/132‑1 TTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATT < 1:676853/250‑1 TTATTGTGAAATTGGGTCGGGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATT > 2:646330/1‑207 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GCCAGAAAACGGCTTTGACGATGAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779_cfb/3742679‑3742935‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCA‑AACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATTGTCGGGTTG > NC_007779_cfb/3744272‑3744514 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |