| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779_cfb | 3,742,936 | Δ1,336 bp | insD_8–insC | insD_8, insC | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779_cfb | 3742936–3744262 | 3744271 | 10–1336 | 159 [0] | [0] 154 | insD_8–insC | insD_8,insC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779_cfb | = 3742935 | 0 (0.000) | 146 (1.250) | 128/418 | 0.0 | 100% | intergenic (‑123/+9) | yieE/insD_8 | phosphopantetheinyl transferase/IS2 element protein |
| ? | NC_007779_cfb | 3744272 = | 0 (0.000) | intergenic (‑100/+21) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
AACGGCTTTGACGATGAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGC > NC_007779_cfb/3742686‑3743178 | ggCTTTGACGATGAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGG < 2:1332097‑M1/247‑1 (MQ=255) ggCTTTGACGATGAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGG > 1:1332097‑M1/1‑247 (MQ=255) cTTTGACGATGAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgc < 1:1347927‑M1/250‑6 (MQ=255) ggAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGAGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAATTTGGgtcgcgtttcatacgattcg > 2:402474‑M1/1‑230 (MQ=255) tCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTCCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgcc > 2:529153‑M1/1‑222 (MQ=255) gggCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccat < 1:720685‑M1/250‑31 (MQ=255) tatnanNCTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgta < 2:980725‑M1/249‑40 (MQ=255) gatgaCACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgta < 1:402474‑M1/250‑40 (MQ=255) atgaCACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaa > 2:320396‑M1/1‑210 (MQ=255) acacTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaagg < 1:1121439‑M1/250‑44 (MQ=255) atctggggacgaacagAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCAGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGGCTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtgtttaa < 2:631244‑M1/243‑51 (MQ=255) gggagACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcat < 2:6845‑M1/209‑13 (MQ=255) ggagACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAACTCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGCAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgacatcgacgcgtaaaggtttttaaagat > 1:631244‑M1/1‑196 (MQ=255) agaCGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggttt < 1:44409‑M1/250‑57 (MQ=255) gaCGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGG > 1:176800‑M1/1‑193 (MQ=255) gaCGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGG < 2:176800‑M1/193‑1 (MQ=255) aaCAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttat > 1:734998‑M1/1‑189 (MQ=255) gAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaacc > 2:289149‑M1/1‑185 (MQ=255) cAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacg > 1:42657‑M1/1‑180 (MQ=255) aGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCGAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGGTTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggttgcccgtaaccagacga < 2:443903‑M1/250‑72 (MQ=255) aGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacga > 1:1381691‑M1/1‑179 (MQ=255) gTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCATAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgt < 1:481543‑M1/236‑62 (MQ=255) ttCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcgga < 2:1173593‑M1/250‑80 (MQ=255) ttCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcgga > 1:1173593‑M1/1‑171 (MQ=255) cGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggatta < 1:78588‑M1/250‑83 (MQ=255) ctaAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAAGGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAAC‑TTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatgg < 1:963404‑M1/249‑86 (MQ=255) cccTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTTTTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacga < 1:957930‑M1/175‑17 (MQ=255) cccTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTTTTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacga > 2:957930‑M1/1‑159 (MQ=255) cTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcga > 2:408894‑M1/1‑157 (MQ=255) gggCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACACGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtacgggtttttaatggcttcccgtaaccagacgatcttcggcttatggctggtccggct > 2:1047967‑M1/1‑154 (MQ=255) gAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatc < 2:205001‑M1/176‑32 (MQ=255) gAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatc > 1:205001‑M1/1‑145 (MQ=255) aGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattat < 1:1142767‑M1/227‑84 (MQ=255) cATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgttt > 1:712922‑M1/1‑138 (MQ=255) cATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAATTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaagggtttttaatggcttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggta < 1:1047967‑M1/250‑113 (MQ=255) tcttccgatctaatggtccatTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaac < 1:714053‑M1/240‑121 (MQ=255) tCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatg < 2:735085‑M1/227‑100 (MQ=255) ccATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgac < 2:1257274‑M1/161‑35 (MQ=255) aTGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttc < 2:274507‑M1/201‑77 (MQ=255) aTGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttc > 1:274507‑M1/1‑125 (MQ=255) ttAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcatcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctt > 1:831460‑M1/1‑121 (MQ=255) tAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagcttt > 2:583405‑M1/1‑120 (MQ=255) aagggtccATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttt > 2:1214476‑M1/4‑119 (MQ=255) aaTGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttt < 1:320396‑M1/250‑132 (MQ=255) aaTGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgatccgtttatgccacaaccggggaaaaggaacaanacgggaga > 2:714053‑M1/1‑119 (MQ=255) tCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgc < 1:289149‑M1/250‑137 (MQ=255) ttATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgt < 1:569693‑M1/204‑95 (MQ=255) ttATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgt > 2:569693‑M1/1‑110 (MQ=255) aTGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggtta > 2:1338197‑M1/1‑108 (MQ=255) aaTACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttc < 2:760704‑M1/181‑77 (MQ=255) aaTACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttc > 1:760704‑M1/1‑105 (MQ=255) tACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatctccggattatggctg < 1:364262‑M1/191‑89 (MQ=255) tACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatctccggattatggctg > 2:364262‑M1/1‑103 (MQ=255) aCAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtca < 1:583405‑M1/250‑149 (MQ=255) aTCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgcctcagcagggtaaaaggaacttccagctttttatgctggctttcgtcaaacgggaga < 2:42657‑M1/250‑158 (MQ=255) aTTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagagga > 1:301881‑M1/1‑90 (MQ=255) tACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttat < 1:890945‑M1/185‑99 (MQ=255) aCTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttattccacagcaggggaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtccaaccgggngggaagag > 2:676853‑M1/1‑86 (MQ=255) aCTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagcgaaaaaggaacttcccgctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagag > 1:794352‑M1/1‑86 (MQ=255) cTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatg > 1:563513‑M1/1‑85 (MQ=255) cTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgtgcagtttatg < 2:563513‑M1/184‑100 (MQ=255) tgatgGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagcttttt > 1:17316‑M1/1‑79 (MQ=255) tgatgGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagcttttt < 2:17316‑M1/211‑133 (MQ=255) tgatgGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCAATTCAGACAAGCTTATCACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggccttcgtcaaacgggagaggaagagtaaccag > 1:1282147‑M1/1‑79 (MQ=255) tgGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttttgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccg > 2:354842‑M1/1‑76 (MQ=255) ggACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggc > 2:1044642‑M1/1‑75 (MQ=255) aaaGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccac < 2:1255353‑M1/169‑104 (MQ=255) aaaGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccaa > 1:1255353‑M1/1‑66 (MQ=255) aaGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatgga < 1:1044642‑M1/250‑186 (MQ=255) aGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggag > 1:392465‑M1/1‑64 (MQ=255) cttccgatctttcgattcagacAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagtt < 1:627870‑M1/240‑189 (MQ=255) aaGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgta < 1:742318‑M1/250‑196 (MQ=255) aTTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttggtggagttgattgtantantga > 2:1169803‑M1/1‑48 (MQ=255) tCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgaca < 2:301881‑M1/250‑205 (MQ=255) tctcaagCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagt < 1:1247504‑M1/247‑207 (MQ=255) aCAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaa > 1:332536‑M1/1‑42 (MQ=255) aaGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttat < 1:660106‑M1/138‑99 (MQ=255) aGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgatccggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagtttgttgtaggactgacagtaacgc > 2:451748‑M1/1‑39 (MQ=255) gCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggatt < 2:1220282‑M1/119‑82 (MQ=255) gCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggatt > 1:1220282‑M1/1‑38 (MQ=255) tattaCAANTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcatttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcg < 2:715254‑M1/250‑216 (MQ=255) ttaCAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgcc < 2:938208‑M1/134‑102 (MQ=255) cttccgatcttttacattttatTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcg < 1:1307296‑M1/241‑218 (MQ=255) taCAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccggctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcg < 2:843411‑M1/244‑213 (MQ=255) cAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcggtc < 2:678552‑M1/250‑221 (MQ=255) cAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattatagtactgacagtagcgcggcgcggtc < 1:529153‑M1/250‑221 (MQ=255) tttttACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaa > 1:1071055‑M1/1‑25 (MQ=255) tttttACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaa < 2:1071055‑M1/139‑115 (MQ=255) tttACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaatcagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttc < 1:683233‑M1/167‑145 (MQ=255) tttACATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggccaaaggaacttccagctttttttgctggctttggtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggccgttgttgttgttgattttagtactgacagtagctcggcgcggcatcgggaa > 2:1307296‑M1/1‑23 (MQ=255) aCATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggta > 2:324754‑M1/1‑20 (MQ=255) aCATTTTATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggta < 1:324754‑M1/132‑113 (MQ=255) tttATTGTGAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcggtcgccagtagcagatt < 1:676853‑M1/250‑235 (MQ=255) ttATTGTGAAATTGGgtcgggtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgatt > 2:646330‑M1/1‑15 (MQ=255) gAAATTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtca < 1:422535‑M1/156‑149 (MQ=255) aaaTTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaagagcaaccaacggcagttgatggagttgattgtagtactgacagtagcgcggcgcggtcgccagtagcagattgtcgggttg > 2:501408‑M1/1‑7 (MQ=255) aaTTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaag > 2:824431‑M1/1‑6 (MQ=255) aaTTGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaag < 1:824431‑M1/122‑117 (MQ=255) tGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaaga > 1:738182‑M1/1‑3 (MQ=255) tGGgtcgcgtttcatacgattcggttatgccatcgacgcgtaaaggtttttaatggtttcccgtaaccagacgatcttcggattatggctgttccgtttatgccacagcagggtaaaaggaacttccagctttttttgctggctttcgtcaaacgggagaggaaga < 2:738182‑M1/166‑164 (MQ=255) | AACGGCTTTGACGATGAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGC > NC_007779_cfb/3742686‑3743178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |