New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 289857 = | 154 (1.000) | 203 (1.330) | 166/492 | 0.0 | 71.8% | intergenic (+1/+16) | Y75_RS23110/Y75_RS01415 | DUF3987 domain‑containing protein/IS1 family transposase |
? | NC_007779 | = 755217 | 7 (0.050) | intergenic (‑14/‑367) | Y75_RS24790/sdhC | hypothetical protein/succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCAGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/290103‑289857 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGTTTTCCCCTCTTTCACAGAGCGGCGAGCCAAATAAAAAAC < NC_007779/755217‑754969 CCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGG > 1:1352482/1‑250 TTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAA < 2:449981/250‑1 TTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAA < 2:880685/250‑1 TGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGTACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAG > 2:311972/1‑250 GACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGC < 1:788271/250‑1 CGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCAT > 1:745930/1‑250 GTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATA < 1:1197872/250‑1 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ACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTT > 2:1360358/1‑250 tggcgtCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCG < 2:1336666/244‑1 TGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCG > 1:1304860/1‑250 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CGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTAT < 2:676678/250‑1 CCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGAT < 1:1365779/250‑1 GAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTA > 2:270594/1‑250 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GGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGA > 2:1403863/1‑250 ACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGGCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGCTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGCGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGAAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTC > 2:741952/1‑250 GGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGC < 2:43982/250‑1 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TCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAA > 1:884844/1‑250 AAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATG > 2:1264192/1‑250 AATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGA < 2:1422394/250‑1 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CATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGC > 1:620130/1‑250 ATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCT < 1:933408/250‑1 CGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCT < 2:284689/250‑1 CGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCT > 2:144280/1‑250 TCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGG < 2:320529/250‑1 CTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGT < 1:533545/250‑1 CTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGT > 2:1317739/1‑250 AACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCAAGGTTTT > 2:874325/1‑250 ACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATGTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGTTTTC > 2:814690/1‑250 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AAGTTGGAGTCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGTTTTCCCCTCTTTCACAGAGCGG > 2:978863/1‑250 TCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGTTTTCCCCTCTTTCACAGAGCGGCGAGCCAAA > 2:1259532/1‑250 TCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCT < 1:630211/185‑1 TCATTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCT > 2:630211/1‑185 TTACCCAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGTTTTCCCCTCTTTCACAGAGCGGCGAGCCAAATAA > 2:947891/1‑250 CAGGAAAAGCATATAATGCGTAAAAGTTATGAAGTCGGTATTTCACCTAAGATTAACTTATGTAACAGTGTGGAAGTATTGACCAATTCATTCGGGACAGTTATTAGTGGTAGACAAGTTTAATAATTCGGATTGCTAAGTACTTGATTCGCCATTTATTCGTCATCAATGGATCCTTTACCTGCAAGCGCCCAGAGCTCTGTACCCAGGTTTTCCCCTCTTTCACAGAGCGGCGAGCCAAATAAAAAAC > 1:1361818/1‑250 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |