| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
CGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGC > NC_007779/754968‑755464 | cattcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCTTTTCCt > 1:697988‑M2/243‑250 (MQ=255) gTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTg > 1:1361818‑M2/1‑249 (MQ=255) ttATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGAAAACCTGGGTACAGAGCTCTGGGCGCTTGCAGGTAAAGGATCCATTGATGACGAATAAATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTgggtaa > 2:947891‑M2/1‑244 (MQ=255) tggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCTTTTCCTGGTAAt < 2:721253‑M2/14‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |