| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | 1429311 = | 129 (1.100) | 117 (1.010) | 105/490 | 0.2 | 64.7% | pseudogene (209/216 nt) | Y75_RS07225 | Ail/Lom family outer membrane beta‑barrel protein |
| ? | NC_007779 | = 3361428 | 0 (0.000) | coding (398/765 nt) | Y75_RS16705 | DUF1120 domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CAAGGGGCTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACCCTGGCCAACCTGTTTCGGGTGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCAGTAAAAACCGGAAATAACGCCAGAAATGGTGGAAAAAATAGCCTAAATAGGCTGATTCGATGTGTTTGCGGGAAAAAAATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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TAGGCTGATTCGATGTGTTTGCGGGAAAAAAATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTT < 2:260986/250‑1 TAGGCTGATTCGATGTGTCTGCGGGAAAAAAATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTT < 1:133489/250‑1 AGGCTGATTCGATGTGTTTGCGGGAAAAAAATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTA < 2:704444/250‑1 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AAATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAG > 1:1025135/1‑250 AATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGT < 2:860788/250‑1 ATCGGCCCAGATCCGCGAAATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTT < 2:577300/250‑1 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AATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTT < 2:964323/250‑1 AATTTTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTT < 2:684682/250‑1 TTAATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACC > 1:76248/1‑250 AATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGG < 1:340860/250‑1 ATCAGCGAGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGT > 2:499446/1‑250 AGTCAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTC > 2:693100/1‑250 CAGCTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGC > 2:653721/1‑250 CTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCA > 2:339022/1‑250 CTTGGGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCA > 1:626036/1‑250 GGAAGAAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGT > 1:1097237/1‑250 AAATGACCTGCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGTTATGA < 1:135462/250‑1 GCTTATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGTTATGATGTTTCCCA < 1:48675/250‑1 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ATTCGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGTTATGATGTTTCCCATAGT > 1:783838/1‑250 CGCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGTTATGATGTTTCCCATAGTCAA < 1:879371/250‑1 GCACCTTCCCTAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGTTATGATGTTTCCCATAGTCAAC > 2:278617/1‑250 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NC_007779/1429562‑1429311‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctAAACCAAAGGCGTTTTTCGTTCCCTTCATATCTACGAGAGTATCATAAGCTTTTTCAATATAGGATGTGTCGTTTAACGCTACAATGGTCGACTGACGGTTATCCTTGGAGGTTACAGCAATTAGCGTTGGTGCTGTGCAGGTTATATTTAATGTGCTGTTTTTGCGGCCCAGTTGAACCAGTTTATTACTTTTACCGGTCGGATTCAGCGCACTGTTATGATGTTTCCCATAGTCAACAATGCCGCC < NC_007779/3361428‑3361181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |