| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4400783 = | 121 (1.080) | 3 (0.030) | 3/476 | 19.3 | 2.5% | coding (39/1338 nt) | amiB | N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase AmiB |
| ? | NC_007779 | = 4400779 | 118 (1.100) | coding (35/1338 nt) | amiB | N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase AmiB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGATATCAAACAAACGGGCGTGATTCAGGGACTGCCGTTGTTGTTCAGCGGCAATAATCTGGTGAAGGCGATTCGCTCTGGAACGCCTAAAGATGCACAAAC > NC_007779/4400536‑4401028 | aGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACgctgct > 2:499456/1‑250 (MQ=255) gggATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCtgt < 1:1042921/250‑1 (MQ=255) ggATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCtgtg < 2:437595/250‑1 (MQ=255) gagccGCGATTATTTTGCCAACGATGGCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGc < 2:78047/247‑1 (MQ=255) tCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCAc < 2:641509/250‑1 (MQ=255) cgcgATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGc > 1:851510/1‑250 (MQ=255) gcgATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGCCGCTGCTGCTGCTGTGCACGcc > 2:287776/1‑250 (MQ=255) ttattTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGACAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCCGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGGCggtg > 2:810911/1‑250 (MQ=255) attTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtggg > 2:202725/1‑250 (MQ=255) ttttGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtgggt < 2:357941/250‑1 (MQ=255) tttGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAACTTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCggtgggtg > 2:107212/1‑250 (MQ=255) gCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCcg < 1:563635/250‑1 (MQ=255) gCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGGATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCcg > 2:2394/1‑250 (MQ=255) aaCGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCcgcgc > 2:330646/1‑249 (MQ=255) aaCGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGa > 2:551723/1‑250 (MQ=255) cGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTAGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTGGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACg < 1:597279/250‑1 (MQ=255) ccATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGctctc > 2:286971/1‑250 (MQ=255) cATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGctctct < 2:829205/250‑1 (MQ=255) cTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCCGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGcc > 2:737941/1‑225 (MQ=255) tGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGata < 1:869713/250‑1 (MQ=255) ggtggAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAGCCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAg < 2:60340/250‑1 (MQ=255) gtggAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAgg < 1:749089/250‑1 (MQ=255) tggAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGt < 1:25469/250‑1 (MQ=255) gTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCt < 1:598720/250‑1 (MQ=255) tGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTa < 1:610014/250‑1 (MQ=255) ccACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACg < 2:380177/250‑1 (MQ=255) cacaACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGATGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACgg < 1:4133/250‑1 (MQ=255) acaacaAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCTCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGt > 2:678119/1‑250 (MQ=255) caaGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATc < 2:925838/250‑1 (MQ=255) aaGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCTACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCa < 1:506649/250‑1 (MQ=255) tACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAg < 1:77080/250‑1 (MQ=255) gtgtTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg < 1:844863/250‑1 (MQ=255) tgtTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCgg < 2:900481/250‑1 (MQ=255) gACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCTGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGa < 1:111769/250‑1 (MQ=255) ggATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGtttt > 2:832220/1‑250 (MQ=255) tGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTAtt > 1:232579/1‑250 (MQ=255) tCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTgg > 1:45330/1‑250 (MQ=255) 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aaTACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGAt < 1:803909/250‑1 (MQ=255) tACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGAC‑‑‑GCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGa > 1:987812/1‑250 (MQ=255) gATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGACATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATCTTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGTCGCGGATAACGTTGAGTTTTCTTGGCGATCCTGATTacg > 1:983258/1‑248 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |