| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4493397 = | 84 (1.120) | 6 (0.090) | 5/256 | 9.5 | 7.6% | intergenic (‑149/‑478) | insG/yjhB | IS4 transposase/putative transporter |
| ? | CP009273 | 4493417 = | 74 (1.140) | intergenic (‑169/‑458) | insG/yjhB | IS4 transposase/putative transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGACGAAGGGAGTTTTAT > CP009273/4493269‑4493559 | gAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTAt < 2:343255/149‑1 (MQ=255) aGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTAtg > 2:560730/1‑149 (MQ=255) cGTTCCCGGATTCTTACACAGCCTCTGGATCGGTCAACTGATCCTTTACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTAtgtg < 1:341598/149‑1 (MQ=255) cGGAGTCTTACAGAGCCTTTGGATCCGTCACCTGTTCCTTAATTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACTAACTATCAGCTACCAAAATATGCTCAATTTGGGACATCCGTATCTATTCGCGTTTTGTTATGTGGATTGc < 1:569236/149‑1 (MQ=255) ggATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTGTCAGCTACACAAATATGCTCAATTAGTGACATCAGTAACAGAAAGCGTTTTGTTATGTGGATTGCt > 2:857729/1‑149 (MQ=255) ggATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCt > 2:237535/1‑149 (MQ=255) aTTCTTACACAGGCACTGGATCGGGGAACTGAGCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCCGGTGGTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCttt > 1:639589/1‑148 (MQ=255) ttCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGt < 1:993121/149‑1 (MQ=255) tCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGtt < 2:195720/149‑1 (MQ=255) ttACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGtttt > 1:362455/1‑149 (MQ=255) tACACAGCCACTGGTTGGTTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGttttt < 1:30355/149‑1 (MQ=255) acacCGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAAGATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACACAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGtttttt < 1:942420/149‑1 (MQ=255) acacAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGtttttt > 2:242320/1‑149 (MQ=255) cccaGCCACTGTATCGGTTAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATTTGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑g < 2:1126327/147‑1 (MQ=255) acaGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATGAACCTTGGATCTGGTGTTAGTAACAAACTATCCGCTACAAAAATATGCTCAATGTGTGACATCACTAACAAAACGCGTTTTGTTCTGTGCGCTTCTTTTTTTTT‑Ga > 1:322890/1‑149 (MQ=255) ccACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGGTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTg > 1:366831/1‑149 (MQ=255) cACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTgg < 2:11102/149‑1 (MQ=255) cTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑TTTCTGGtt > 1:516258/1‑148 (MQ=255) cGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGCTTGTTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAg < 2:912483/149‑1 (MQ=255) cGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GGTCTGGTATAACAg > 2:401676/1‑149 (MQ=255) cGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAg < 1:957476/149‑1 (MQ=255) ggTCAACTGATCCTTAACTGATCTGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACACCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAgg < 1:980218/149‑1 (MQ=255) tCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGta < 1:1045814/149‑1 (MQ=255) tCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGta < 1:1045968/149‑1 (MQ=255) aaCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGtata > 1:620344/1‑149 (MQ=255) cTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAACCTATCAGCTACAAAAATATGCTCCATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATaaa < 1:1106974/149‑1 (MQ=255) cTGATCCTTAACTGACCGGGATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATaaa < 1:493407/149‑1 (MQ=255) tGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTGTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAg < 2:1149480/149‑1 (MQ=255) tGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTAAATCACTCTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAg > 1:265337/1‑149 (MQ=38) aTCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGt > 2:642270/1‑149 (MQ=255) ccTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACCAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTAAAACAAGTATAAAggaag > 1:3539/1‑146 (MQ=255) cTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCACTTTGTGACATCAGTAACGAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GCTCTGGTATAACAGGTAGAAAGGaata > 2:308372/1‑149 (MQ=255) cTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGtata > 2:1213797/1‑149 (MQ=255) cTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGtata > 1:87058/1‑149 (MQ=255) cTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGaata > 1:604650/1‑149 (MQ=255) tAACTGGGCGTCATTAGTCTGGGTTCTGGTGGTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCTTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTCGTATAACAGTTATCCAGGTATACa < 1:992260/149‑1 (MQ=255) ttggtCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGaa < 1:486059/145‑1 (MQ=255) gatctgccgtAATCCTCGTTCTCGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGaaaa < 1:1190408/140‑1 (MQ=38) tCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGc < 2:446057/149‑1 (MQ=255) gCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAAGTATCAGCTACGAAAATATGCTCAATTTGTGCCATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑TCTCCGGTATAACAGGTATACAGGGATACAAGAAAGCcaa > 1:459362/1‑149 (MQ=255) aTTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGa > 2:1047132/1‑149 (MQ=255) ttGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTg < 2:491501/149‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCaaa < 2:620344/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGa < 2:466991/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACGTCAGTAGCAAAACGCTTATTGTTATTTGTATTGCTTGTTTTCT‑GATCCGGTATAACAGGTATAAAGGTATTCAGTAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGa < 2:912841/149‑1 (MQ=255) gttttttGTAACAAACTATAAGCTACAAAAATATGCTTAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGaa < 1:288647/145‑1 (MQ=255) ggTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGaa < 1:560730/149‑1 (MQ=255) gtgtTTGTAACAAACTATCAGCTACGAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAACGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGaaa > 2:683822/1‑149 (MQ=255) ttGTAACAAACTATCCGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAg < 1:1067020/149‑1 (MQ=255) ttGTAACAAACCATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGTATTGTTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAg < 1:162712/149‑1 (MQ=255) gTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCt > 2:1107295/1‑149 (MQ=255) tAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCta > 2:436980/1‑149 (MQ=255) aaCAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTCTACAGAAGAGAAAAGAAATACAGCAAAGGAAAAcgacaat > 1:51167/1‑143 (MQ=38) aaCAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACCGccaa > 1:469840/1‑146 (MQ=255) cAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCCGTTTAATGGCACAATCTACCCCAGGGGTGGGGTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAGGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATaa > 2:592115/1‑149 (MQ=255) aCTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GAGCTGGTATACCAGCACCTAATTCATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGt > 2:536470/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAg < 1:537281/149‑1 (MQ=255) tCAGCTACAAAAATATGCTTAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGCAATACTTAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGc > 2:884858/1‑149 (MQ=39) cTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAATCAGCTATAACGTAAGCTaca > 1:908402/1‑147 (MQ=255) cTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTaaa > 2:532852/1‑149 (MQ=255) cAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTGTTGTGATGTGGAGTGCTGGTTGGTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATGCAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAACGGAAAACCACTAAAACGAAAGCAAAAGtc > 1:898801/1‑148 (MQ=255) atGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACct < 2:919617/149‑1 (MQ=255) cTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATGCAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCGAAAGTAATAACCtctc > 1:532661/1‑149 (MQ=255) tCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTCTAACAGAGATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAATAACAACGAAGGAAAACTGCGATAACGTAATCTaaacgagcaacccctca > 1:107315/1‑135 (MQ=255) tCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCa > 2:258655/1‑149 (MQ=255) ctaactgggtaCATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCa < 2:223924/139‑1 (MQ=255) cAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAg > 2:614088/1‑149 (MQ=255) ttGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCtt < 1:436980/149‑1 (MQ=255) gggACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCGTGTTTTTTCGCACT‑GAAGAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTc < 2:35106/147‑1 (MQ=255) aTCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCAt > 2:865192/1‑149 (MQ=255) taGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCAttt < 2:191588/148‑1 (MQ=255) cAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCAttt < 2:735610/149‑1 (MQ=255) gTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGa > 2:613736/1‑149 (MQ=255) gTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGa < 1:722739/149‑1 (MQ=255) cttttttgtgGAGTTCCTGATTTGT‑GACCTTGTATAACCTGTATAAAGGTATACCGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAACACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCCTTTGACGAAGGGAGTTTTag < 1:242320/143‑2 (MQ=255) | GAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTT‑GATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGACGAAGGGAGTTTTAT > CP009273/4493269‑4493559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |