New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2420396 | 11 (0.110) | 100 (0.990) | 66/296 | 0.5 | 90.1% | intergenic (‑129/+92) | hisJ/argT | histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit/lysine/arginine/ornithine transporter subunit |
? | CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | intergenic (+10/‑55) | yrhA/insA | pseudogene, interrupted by IS1E/IS1 repressor TnpA |
ATAGCACCAGTTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAAAATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2420249‑2420396 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCT > CP009273/3576788‑3576934 ATAGCATCAGTTCTTTCATAATGTCCTCGACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTG < 1:373639/149‑1 ATAGCACCAGTTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTGGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTG > 2:842088/1‑149 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2:746184/1‑149 CAGTTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGC > 2:686456/1‑149 CAGTTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGC > 1:472719/1‑149 CAGTTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGC > 2:661041/1‑149 CAGTTTTTGCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGC > 1:522993/1‑149 AGTTTTTGCATATTCTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATAAAAAAAAAAAAAAAATGCTGGTGATGCT < 1:1621554/149‑1 TTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGTGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCAGCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGC < 2:552179/149‑1 TTTTTCATAATGCCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGTCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCC < 2:1137883/149‑1 TTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTTATGCTGCCA > 2:857217/1‑149 TTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCA > 2:1644373/1‑149 TTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGTGCTTATTTTCAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGTCCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAA < 2:746501/149‑1 TTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCTAA > 1:312036/1‑149 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1:944251/1‑149 ATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 2:569269/1‑149 caCAACTGACAGTCGTTTTATAGGGAATATTTACAGGTCTGTTACCCTTATCGGGCCATAAAACTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTATACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:485108/147‑1 CTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCAACAAGGCAACATATCCCGCCCCGATAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGACGCTGCCAACCTACTGActca > 1:236137/1‑145 TCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:1250157/1‑149 TCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTACCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:1179450/1‑149 CAACTGACTGTCTTTTTATAGGTAGTATTTTCAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAATATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:275548/149‑1 CAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGTTTTGTTACACTTATCGTGCTATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGACCCGTTAGATGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:1300947/149‑1 ACAGTATTTTTAGAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACCCTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACAAATACCGCTCCGTTGTTCGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:1495994/149‑1 AGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCCAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTCACTGATTTAGTGTATTATG > 2:535289/1‑149 AGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:1321026/149‑1 AGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:1583093/149‑1 AGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:438580/149‑1 TCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 2:1101069/1‑149 TCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTCGGACGTATTATATTGCATGAAAAATGCTGGTGATACAGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:1407408/1‑149 TTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 2:1583692/1‑149 tatgaAATATGTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:654943/144‑1 TAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACGTAGCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:1616086/149‑1 AGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:184453/149‑1 AGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGACGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:742530/149‑1 GGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:739251/149‑1 GGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAAATGACCATCAAGGCAGCATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAGCTTACTGCTTTAGTGTATGAGGGTGTTTTTGAGG > 1:8882/1‑149 GGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTACAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTGTGATGGTGTTTTTGATGT > 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2:895077/1‑149 TTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:1343958/1‑149 TTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 2:276300/1‑149 ACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:1255848/149‑1 ACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGTCTTCTGTTTCTg > 1:909388/1‑148 CTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:1456973/149‑1 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1:1514061/149‑1 TAAAATTGACACTCAAGGCAACAAACCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 1:842088/149‑1 TTGACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 2:1080584/149‑1 GACCATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:296710/149‑1 ATCAAGGCCACATATCCCGCCCCGTTAGCCGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCACACTTACAGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 2:1458604/1‑149 ATCAAGGCAACATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTACCTCGAAATGCAGATAATGCAACCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 2:1625382/1‑149 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cATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACGGATTACGAGTATGAGGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATGAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGCCGGGGT > 1:248310/2‑149 ATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTTGCCTCGGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTG < 1:1086961/149‑1 ATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 1:1336270/149‑1 ATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 1:746184/149‑1 ATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATGTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAGTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 1:899919/149‑1 CCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGC < 2:1530907/149‑1 CGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCATCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTAATCTACTGCCGGGGTGGTTCGT > 2:555710/1‑149 CGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT > 2:1284594/1‑149 GCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCAGTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTGCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTA > 2:825529/1‑149 TAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAA < 1:22992/149‑1 ATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACC > 1:422486/1‑149 ATTATTTTTCATTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGTAACGGCAAAAGCACC > 1:1649178/1‑149 TTTTTCATTAAAAATGCTGGTGCTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG < 1:1621029/149‑1 cTTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGTGGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGGACCGCCGGACATC < 2:1122202/148‑1 TTAAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCCCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCA < 2:191941/149‑1 AAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGC < 1:276300/149‑1 AAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGGCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGC < 2:317169/149‑1 AAAAATGCTGGTGATGCTGCCAACCTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCGGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGC < 2:401291/149‑1 TGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTAT > 2:1462664/1‑149 CTGGTGATGCTGGCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTGTGGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCT < 2:438852/149‑1 ATAGCACCAGTTTTTTCATAATGTCCTCAACTGACAGTCTTTTTATAGGGAATATTTACAGGTTTGTTACACTTATCGTGCCATAAAATTGACCATCAAGGCAAAATATCCCGCCCCGTTAGACGTATTATTTTTCATTAAAAATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2420249‑2420396 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCT > CP009273/3576788‑3576934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |