New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTACGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCAATATCGGGCATATCACACAACTCTATGCCATCAATATACTCGATGATCATGATATAAGTATGGACAAAACGTAAGGTTTTCCGTTCAGCCAATAAATAAAAGTCATTGAGTGTATTTAACCCTTCATTTCGTACTTTTTGGGTTTGCTCAAAAAGGCGTTCGTAATAATCACCTTTTAACAGAGACTTAAAGAAACGTTCGTTACGCTTAACTTTCGGAGAAAAAACCTTAAGAATCAATTTACCGTAATCGGT > NC_000913/3800252‑3800812 | atttttggATTTTTTTTAGCGCTCTGGTTTCCCTTTCAAACCCCTCATAAAATTGCTCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATATCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCTCTTTACGCTGCGCTTAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCt < 2:682329/275‑1 (MQ=255) 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ATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTACGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCAATATCGGGCATATCACACAACTCTATGCCATCAATATACTCGATGATCATGATATAAGTATGGACAAAACGTAAGGTTTTCCGTTCAGCCAATAAATAAAAGTCATTGAGTGTATTTAACCCTTCATTTCGTACTTTTTGGGTTTGCTCAAAAAGGCGTTCGTAATAATCACCTTTTAACAGAGACTTAAAGAAACGTTCGTTACGCTTAACTTTCGGAGAAAAAACCTTAAGAATCAATTTACCGTAATCGGT > NC_000913/3800252‑3800812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |