| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3800664 = | 111 (0.990) | coding (302/699 nt) | waaY | lipopolysaccharide core biosynthesis protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CAATACGATCTTTCGCTTTACGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCAATATCGGGCATATCACACAACTCTATGCCATCAATATACTCGATGATCATGATATAAGTATGGACAAAACGTAAGGTTTTCCGTTCAGCCAATAAATAAAAGTCATTGAGTGTATTTAACCCTTCATTTCGTACTTTTTGGGTTTGCTCAAAAAGGCGTTCGTAATAATCACCTTTTAACAGAGACTTAAAGAAACGTTCGTTACGCTTAACTTTCGGAGAAAAAACCTTAAGAATCAATTTACCGTAATCGGTATCAATAAGCATAACTTTTGTATCATCAATAGAACGAAAAACCTTGATGATATTTATATTATAAGACAAGAAGTCATTTAATACATTGAGGTACTTTGAATTGTTTTCATCGGTAAAAACAACC > NC_000913/3800386‑3800936 | caagtccaTCTTACGCTTTACGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGCAGAGATCGAGAATTCGAACCCCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGATCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCACATCATCAATATCGGGCATATCACACAACTCTATGCCATCAATATACTCGATGATCATGATATAAGTATGAACAAAACGTAAGGTTTACCGTTCAGCCAATAAATAAAAGGCATTg < 2:1071193/274‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |