New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2442529 | 119 (0.700) | 4 (0.040) +AATAGCGCCAGCGACAACAACGCGCTGGCAATACCACCGCCGATAATCGCCGCTTCCCGTTTGCTGCTGCCCGTGCGGTTAAACC |
4/296 | 11.3 | 4.7% | coding (766/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
? | NC_000913 | 2442615 = | 137 (0.800) | coding (852/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTACTTTTGCTCGTCGGTTTTACGACCAA > NC_000913/2442282‑2442780 | tgcgtgcttgctagtggtcTTTGCCCCCGAGAAAACCCCGGGTATGTGGACGCACATTCGGGTTCACGCCCTGGCAAGGTTCGCGCGTCCGGGAGTCAGGTTCGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAACCGGGAAATGCTGTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGt < 2:137904/233‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTCTGGACGGCTTTGCACCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCGGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGt < 2:577517/251‑1 (MQ=255) cTGGTTTCTGGCGGGCTTTGCCACAGCAAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGAAAGGTTGGGGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTa < 2:1542584/251‑1 (MQ=255) gTTTCTGGACGGCTTTGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTg < 2:1777893/243‑1 (MQ=255) tttGCGCCAGCGAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAAAGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGAGGGAACAGACATTACCGCCCCCCTGCTCCGCGCCGTGGGTTAACCGCACGGgcagcag > 1:591412/1‑251 (MQ=255) gAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCaa > 1:1777539/1‑243 (MQ=255) gAAAAACCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTCTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAg > 1:114787/1‑251 (MQ=255) aaaaCCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCAGGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg < 1:1012187/251‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGATATGTAGACGCCAACTCTGTTTACCGCCCTGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGGGGCACGCTGGCGCCATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGCTGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg < 2:114852/251‑1 (MQ=255) aaaaCCCGAATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGAAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAgcg < 2:1687597/251‑1 (MQ=255) aaCCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGGGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAACCGGGAAgcggc > 2:434942/1‑251 (MQ=255) aaCCCGGATATGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGAGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTACGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTCTGCGGGGTGACGGAACAGACATTACCCCTCCCCCGCCCCGCGCCGTGGCTTACACGGACGGGCAGCAGCAAACGGGTAacggc > 2:1447483/1‑251 (MQ=255) atatGTGGACGCAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCACACGGGAAGCGGCGATTAta > 1:1350974/1‑250 (MQ=255) aatgtgaacgcacagtcgtgtggaCGCCATGGCAGGGTGGGCGCGGCCCGGCGGCAGGCGGGCGACAATTCCGTCTGCCGGTTTTTGCCGCCGCGGTTGGCAGTACGC‑CGGATTCAGGATGCAAAAGCGTACGGGCTTTGGGCGCAAACGGGGAATGCTGTTCGGGGTGATGGAATAGCCATTCCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcg < 2:758653/228‑1 (MQ=255) atGTGGACGGAAAATCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCTCGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGt < 1:425454/208‑1 (MQ=255) atgaagaaTCTGTGTAACGCATTGGCAGGGTTGTCACGGCCGGGCGGCGCGCTGGCGCCATTTGCGTCTTCCGGTTTTGTCCGCCGTGGTTTGCAGGCGGC‑CGGATTCACGATGCAAAATGGTAAGAGCTTTGGGCGCAAACGTGAAATGATTTGCGGAATGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGGGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgg < 1:1629967/245‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTg < 1:1334190/251‑1 (MQ=255) ttttAACGCCATGGAAAGGGTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACGTTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTAATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAgcg < 1:791230/250‑1 (MQ=255) gTTTAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCCCCCCTGCTCCGCGCCGTGGGTTAACCGCCCGGGCAGGAGACAACGGGAAGCGGCGAGTATCGGGGGGGGGATTGGCacgg > 2:357243/1‑248 (MQ=255) tAACGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTAGTGCCAGCGCgt > 1:1187510/1‑251 (MQ=255) accGCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGACGGCACGCTGGCGTCATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCgtt < 1:175316/249‑1 (MQ=255) aaCGCCATGGCAAGGTTGGCCCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCCGGACGC‑CGGATTCACGACGCAAAAAAGCAAGGGCTATGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGATCCCCTGCTCCGCGCCGGGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGATGGGGCCACTATCGTCGGGGGGCTTGCCTCcgcgct > 2:537933/1‑249 (MQ=255) gCCATGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGGGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAAc > 2:425550/1‑208 (MQ=255) aTGGCAAGGTTGGCGCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGgcagcagc < 2:1562634/201‑1 (MQ=255) gcgTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCCAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGCTGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGTCAGCGCGTTGGTGGTGCTGGCGCTATCAc > 1:681343/1‑251 (MQ=255) ccggaccgaaCGCTGACAAAAGTTACGTCTTCGAGTTTTGTACACGGCGATTTGCAAGACGC‑CGGATTTCAGATGGAGTATCGTAGTGGCTTCGGACGAAAACGGGAAATGCGTTGCGAGCTGATGAATCGGACATAACCGCTCCCCGTCTCCGCGCCGTGGTGTAACCGCACGGGCGTCAGCAAACGTGAAGCGGCAATTATCGGAGATGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGgcg < 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gCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTAACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGTGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAgg < 2:87367/251‑1 (MQ=255) tggcatcctttgcgttgaccGGTTTTGTCCCCCGC‑GCTTGGAGGACCCGCGATTTCTCGATGCAGACACGTAGGGACTTTGAGCGCAAACGGGGATTGCTTTGCTGGGTGATGGAACAGACGTTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGAACGGGCAGCAGCAAACGGGAATCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTa < 1:1718332/233‑1 (MQ=255) tGGCGACATTTACGGCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCAGGTTGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTa < 2:816623/251‑1 (MQ=255) ggCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGACCGGGCAGCAGCAAAAGGGGAGCGGCGATTATCGGCGGCGGTATTGCCAGCGCGCTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCCGGCAGGGaa > 1:890302/1‑251 (MQ=255) aTTTACGTCTGCCGGTTTTGGCCGCCGGAGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGTCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCttt < 1:1447182/251‑1 (MQ=255) ccagtGCCGGTTTTGCGCGCCGCGGTTTGCGGGGCGC‑GGGATTTACGATGCAAAAACGTAAAGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCAGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAGACGTGAAGCGGCGATGATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgc < 1:745736/247‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |