New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2442529 | 119 (0.700) | 4 (0.040) +AATAGCGCCAGCGACAACAACGCGCTGGCAATACCACCGCCGATAATCGCCGCTTCCCGTTTGCTGCTGCCCGTGCGGTTAAACC |
4/296 | 11.3 | 4.7% | coding (766/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
? | NC_000913 | 2442615 = | 137 (0.800) | coding (852/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTACTTTTGCTCGTCGGTTTTACGACCAATTACCCGTTAAATTTGATCATGACTGGTGCGGCGTCACGCAGTTAGGCTGGGATGAGAAAAGCCAGCATAAAATCGCAC > NC_000913/2442366‑2442859 | gcgTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCCAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGCTGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGTCAGCGCGTTGGTGGTGCTGGCGCTATCAc > 1:681343/1‑251 (MQ=255) ccggaccgaaCGCTGACAAAAGTTACGTCTTCGAGTTTTGTACACGGCGATTTGCAAGACGC‑CGGATTTCAGATGGAGTATCGTAGTGGCTTCGGACGAAAACGGGAAATGCGTTGCGAGCTGATGAATCGGACATAACCGCTCCCCGTCTCCGCGCCGTGGTGTAACCGCACGGGCGTCAGCAAACGTGAAGCGGCAATTATCGGAGATGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGgcg < 2:302012/242‑1 (MQ=255) ccGGGCGGCAGGCGGGCGGCATTGACGGCTTCCGGTTTTGTCCGCCGGGGTTTGCAGGATGC‑CGGTTTCACTATGCAAAAACGGAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTGTGAGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGgcg < 2:1014546/251‑1 (MQ=255) ccGGGCGCCAGCCTGCCAACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGGGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGgcg < 1:357157/251‑1 (MQ=255) gcggcACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAAAAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTACTCGCCCGGGCCGCAGCAAACGGGAAGCGGAGCTTATCGGCGGTGGTATCGCCAGCGCGATGTTCTCGCGTGCGCTCTTAAGGCGCggg > 2:530772/1‑250 (MQ=255) gcACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCCCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGAGGCGATTATCGGCGGGGGTATTGCCAGCGCGTCGTTGTCCATGGCGCTATTCAGGGCCGGCTgg > 2:758896/1‑251 (MQ=255) gCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTAACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGTGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAgg < 2:87367/251‑1 (MQ=255) tggcatcctttgcgttgaccGGTTTTGTCCCCCGC‑GCTTGGAGGACCCGCGATTTCTCGATGCAGACACGTAGGGACTTTGAGCGCAAACGGGGATTGCTTTGCTGGGTGATGGAACAGACGTTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGAACGGGCAGCAGCAAACGGGAATCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTa < 1:1718332/233‑1 (MQ=255) tGGCGACATTTACGTTTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTa < 2:1145302/251‑1 (MQ=255) tGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTa < 1:616753/251‑1 (MQ=255) tGGCGACATTTACGGCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCAGGTTGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTa < 2:816623/251‑1 (MQ=255) ggCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGACCGGGCAGCAGCAAAAGGGGAGCGGCGATTATCGGCGGCGGTATTGCCAGCGCGCTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCCGGCAGGGaa > 1:890302/1‑251 (MQ=255) ttttACGTGTGCCGGTTTTGTCCGCGGCGGTTTCCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAGCGGAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCttt < 2:1367380/250‑1 (MQ=255) aTTTACGTCTGCCGGTTTTGGCCGCCGGAGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGTCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCttt < 1:1447182/251‑1 (MQ=255) ccagtGCCGGTTTTGCGCGCCGCGGTTTGCGGGGCGC‑GGGATTTACGATGCAAAAACGTAAAGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCAGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAGACGTGAAGCGGCGATGATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgc < 1:745736/247‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑TGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCTGCAGCCAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGGTGTTGTAGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGGTTTCTTggg > 1:693035/1‑249 (MQ=255) ttttGTCCGCCGGGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCAGGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTAGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAgg < 1:530650/251‑1 (MQ=255) ccgcGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGACGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTttgttg > 1:183193/1‑231 (MQ=255) ccgcGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCAc > 1:1691197/1‑251 (MQ=255) ttGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAAAGTAAGGGGTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCGAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCttt < 1:784512/220‑1 (MQ=255) tGCAGCGCGC‑CGGTTTCAGGATACAAAACAGTGAGGGCTTGGGGCCCAACCGGGAAGTGCTTGGCGGGGTGATGGAACAGCCATTCCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCt < 2:1428920/251‑1 (MQ=255) aGGACGC‑CGGGTTTACGAGGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCGAACGGGCAATGATTTGCGCGGTGATGGAACAGACATTACAGCTCCCCTGCTCCGGGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCATACGAGAGGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATAACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTcc < 2:591546/251‑1 (MQ=255) aGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTcc < 2:1591512/251‑1 (MQ=255) aCGG‑CGGATGCAGGAGGCAAAAACGGAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGGGGGGTGGGGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGc < 2:1691542/251‑1 (MQ=255) aCGC‑CGGATTCACTATGCAAAAGCGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGATATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAATGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGc < 1:982167/251‑1 (MQ=255) aCGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAGGCGGCGATTATCGGCGGTTGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGc < 1:592175/251‑1 (MQ=255) aCGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTAc > 2:1127259/1‑189 (MQ=255) gC‑CTGATTAACGATGCAGAGACATGAGGACTTTGGGCGCAAACGGGATATGCTTGGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGAACGTGCAGCAGCAAACGGGAGGCGCCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGTGTTGTTGTCGCTGGAGATATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCCGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCaa < 1:1303752/251‑1 (MQ=255) gC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCaa < 1:71672/251‑1 (MQ=255) gtcGGATGCACGATGCAAGAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACAGGAAATGCTTTGCGGGGGGATGGAACGGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCGAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCaa < 2:473494/249‑1 (MQ=255) cccgtgttccggATGCAAAAGCGTAAGGGCTTTGGCCACAATCGAGAAATGCGTTGGTGGGTGATGGAACAGACCTGACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTGAACCGCACGGGCAGAAGCGAACGGGAAGCGGCGATTAACGGCGGTGCTATTGCCAGCGCTTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCGCTGGGTGCTTCCGGCaa < 1:1596698/240‑1 (MQ=255) cGGATTAACGGTGCAAGAGCGTAAGGGCGTGGGGAGGAAACGGGAGATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCGCCGCGCCGTGGTTTAACCGAACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATc < 2:1525904/251‑1 (MQ=255) tCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAg < 1:574749/251‑1 (MQ=255) gATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAggggg > 1:467727/1‑251 (MQ=255) 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gCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGGTGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGGGCGGTATCCGttatta > 2:1481364/1‑251 (MQ=255) gaaagtcTTTGCGGGGTGACGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCTCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCGGCAGCCAACGTGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGgc < 1:418836/245‑1 (MQ=255) gAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGAGCGGGTGGCAGGCATCGCTTTATTTCGCGGATGAGGCCCCCGCACCGGGTTGTTCCGGCAAACGCCAGGGGGCGCGTGATCCGTTATTAAGCAAacaccagtaggc > 2:1253448/1‑243 (MQ=255) 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(MQ=255) aTTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCTTGGGTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTa < 2:467839/251‑1 (MQ=255) aTTACCGCTCCCCTGCCCCGCGCCGTGGGTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTa < 2:439804/251‑1 (MQ=255) ttACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGAGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTATGGCGTGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCCATGTATCCGTTATTAAGCAAACACAGTGAGG‑GCTCAAACTCCCTTTTCTCTAATGCGTCTAc > 1:1303150/1‑251 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGCTGAGGCCCCCGCCCTGGGTGCTTCCGGCCATCGCCAGGGGGCGCTGTCTCCGTTATTAAGCAAAAACGCTGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCCTTTGCGTTTATTTTTGCt > 2:1352468/1‑251 (MQ=255) tCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCTAGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTCTTTTTCTAATGCGTTTAAtttttca > 1:1302259/1‑248 (MQ=255) ccccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTACTTTTGCt < 1:64133/250‑1 (MQ=255) 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2:1480061/154‑1 (MQ=255) | GCGTCCGGGCGGCACGCTGGCGACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGC‑CGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGGCAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGGGCGCTGTATCCGTTATTAAGCAAACACGATGAGGCGCT‑AAACCGCTTTTTCTCTAATGCGTTTACTTTTGCTCGTCGGTTTTACGACCAATTACCCGTTAAATTTGATCATGACTGGTGCGGCGTCACGCAGTTAGGCTGGGATGAGAAAAGCCAGCATAAAATCGCAC > NC_000913/2442366‑2442859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |