| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,606,148 | IS2 (+) +5 bp | coding (49‑53/876 nt) | lsrF → | putative autoinducer‑2 (AI‑2) aldolase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 76 (0.740) | 47/470 | 0.8 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1606152 | 0 (0.000) | coding (53/876 nt) | lsrF | putative autoinducer‑2 (AI‑2) aldolase | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
AAAAGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAGGTTGCGGTGCGCTGGATTGGGGAATGCAGTCACGCTTATCGCGGATATTTAATCCGAAAACGGGTAAAACCGTGATGCTGGCTTTTGACCATGGTTATTTTCAGGGACCGACTACCGGACTTGAACGCATTGATATAAATATCGCCCCGCTGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGAC > NC_000913/1605902‑1606398 | aaaaGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCTGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTAGTACCGATCAAcc > 1:886382/1‑251 (MQ=255) aaGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCta > 1:355‑M2/1‑249 (MQ=255) agtccggagagtaacggaatagcagagggcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtacgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCaa < 1:773715‑M2/9‑1 (MQ=255) aTGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggcc > 1:1060759‑M2/1‑241 (MQ=255) aaaaCGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTCTGTCTACGACGGGGATGGTACTGGCATCGTACTGTTCCCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGATAATACCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGCAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTAGTACCGATCAACCtaaactggccccc < 2:106843‑M2/251‑14 (MQ=255) atagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTAcc < 1:60085‑M2/27‑1 (MQ=255) atacaagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgacgacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggaatccgcatagtgcgctgggtgatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTAcc < 1:998657‑M2/27‑1 (MQ=255) gtttgagaagagacaggggcgtaggtcAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTAGGACTACGAAGCGGATGGTAATGTCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctcca > 2:785551‑M2/14‑228 (MQ=255) ccaAGCTGGTGATCTAGGGCTTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCATTCAGTGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGGATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctcca > 1:474989‑M2/2‑228 (MQ=255) aaGATCGATATCTAGGGTGTAGTTCCGGTTTAAGTCTCGCCAAACAGCTTTCAGGTCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGTATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGTTATTCAACAAAGACAATTTCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGTGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctccaga > 2:970024‑M2/1‑226 (MQ=255) 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2:815301‑M2/1‑6 (MQ=255) cAACCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcactgaaataagggatagtcttaatactagtttttagactagtcatttgagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagca > 1:702016‑M2/1‑5 (MQ=255) | AAAAGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAGGTTGCGGTGCGCTGGATTGGGGAATGCAGTCACGCTTATCGCGGATATTTAATCCGAAAACGGGTAAAACCGTGATGCTGGCTTTTGACCATGGTTATTTTCAGGGACCGACTACCGGACTTGAACGCATTGATATAAATATCGCCCCGCTGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGAC > NC_000913/1605902‑1606398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |