| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4235570 = | 96 (1.390) | 3 (0.050) | 3/236 | NT | 3.1% | intergenic (+163/‑336) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| ? | NC_000913 | 4235593 = | 99 (1.540) | intergenic (+186/‑313) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGT > NC_000913/4235450‑4235740 | gCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑Tc < 3:166996/148‑1 (MQ=255) aCCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGa < 4:259074/148‑1 (MQ=255) gcaattaatctgcgtattttccgaaataaacaacgattaaaaatctattttaggattaacctcacggtatgatttccgttaaattacagacaaggggatttatctgataaaaaaatgccgacgttatgtcggcattTTTTTA‑TCAGAt < 4:109640‑M2/12‑1 (MQ=255) ccGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGa > 2:225007/1‑147 (MQ=255) gATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATaa < 4:51337/148‑1 (MQ=255) aTGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATAAGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCtt > 8:298153/1‑148 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTa < 1:225007/147‑1 (MQ=255) aaataaacaacgattaaaaatctattttaggattaacctcacggtatgatttccgttaaattacagacaaggggatttatctgataaaaaaatgccgacgttatgtcggcattTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTa > 3:268961‑M2/114‑147 (MQ=255) cgTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATcc < 7:60141/130‑1 (MQ=255) aataaacaacgattaaaaatctattttaggattaacctcacggtatgatttccgttaaattacagacaaggggatttatctgataaaaaaatgccgacgttatgtcggcattTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTaa < 4:268961‑M2/35‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACg > 7:271267/1‑147 (MQ=255) cAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCa > 6:145032/1‑148 (MQ=255) aGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCAt < 5:145032/148‑1 (MQ=255) ggCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATa < 2:145594/148‑1 (MQ=255) ggCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATa > 1:85391/1‑148 (MQ=255) aCAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTaa > 2:248770/1‑132 (MQ=255) aCAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGa > 5:302863/1‑136 (MQ=255) aCAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGa < 6:302863/136‑1 (MQ=255) aCAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAAt < 8:51974/139‑1 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tGTACATCGTATTCGGAAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTaaaa > 2:255744/1‑146 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCAt < 2:98814/124‑1 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCAt > 3:254469/1‑124 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCAt > 1:98814/1‑124 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCAt < 4:254469/124‑1 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTaaaa > 3:299767/1‑145 (MQ=255) tACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAg < 2:85391/147‑1 (MQ=255) aCATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGGATTTTTTTA‑TGATATAAATCCACTTGTCTGTTATTTAACGGAAATCATACCGTTAGGTTAATCCTAAAATAGaa > 6:74213/1‑147 (MQ=255) aCATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATAc > 4:118678/1‑124 (MQ=255) aCATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATAc < 3:118678/124‑1 (MQ=255) cGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAtttt > 7:30282/1‑147 (MQ=255) cGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGAtttt > 1:192461/1‑147 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tATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt > 6:59065/1‑148 (MQ=255) tGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGa > 6:188881/1‑148 (MQ=255) gtcggcattTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAt > 2:314483‑M2/10‑148 (MQ=255) gtcggcattTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAt > 7:314688‑M2/10‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 1:31476‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 4:84526‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 3:192254‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 6:7894‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 6:46053‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 1:36274‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCCACTTGTCTGTAATTTAAAGGAAATCATACAGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 3:29146‑M2/2‑148 (MQ=255) tTTTTTA‑TCAGATAAATCACCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 6:276955‑M2/2‑148 (MQ=255) | CCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTA‑TCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGT > NC_000913/4235450‑4235740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |