| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2539674 | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/246 | NT | NA | intergenic (‑91/+43) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit |
| ? | NC_000913 | = 2539688 | NA (NA) | intergenic (‑105/+29) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCA > NC_000913/2539529‑2539819 | ttCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCACGGAT‑cg > 1:279184/1‑149 (MQ=255) gCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑cgcg < 3:333067/148‑1 (MQ=255) gCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCgg > 4:316672/1‑149 (MQ=255) gCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCgg > 6:384653/1‑149 (MQ=255) gCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCgg < 3:316672/149‑1 (MQ=255) tGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCggg > 1:345058/1‑148 (MQ=255) cAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGaa < 2:345058/148‑1 (MQ=255) cAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGA‑‑TCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAgcg < 2:54530/149‑1 (MQ=255) ttCACCAGAGGTGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGcc > 1:51126/1‑149 (MQ=255) ttCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGcc > 6:343400/1‑149 (MQ=255) ccAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccg < 2:347926‑M2/149‑5 (MQ=255) cAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgg > 8:266596‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgg > 8:159602‑M2/1‑144 (MQ=255) gagGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgggc > 8:10664‑M2/1‑142 (MQ=255) gCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 7:268000/1‑149 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAGTGTAATCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGAAGCTTGATCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGACCGGAT‑ATCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 5:63081/1‑148 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGt > 1:380724/1‑140 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 5:231579/1‑148 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 6:212113/1‑148 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTc < 4:81201/149‑1 (MQ=255) tgttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAcc > 6:113519/1‑148 (MQ=255) gttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGAccgggctttttaatggcaaggtttgt > 6:33753‑M2/1‑122 (MQ=255) ttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTAt > 8:237752/1‑149 (MQ=255) ttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTAt > 1:334133/1‑149 (MQ=255) cTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATc < 1:173972/148‑1 (MQ=255) tAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAg > 7:224671/1‑149 (MQ=255) gtGTACTAAAGATATCTATACATACTTTGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGAGTCTTATCAGTTCTACAGTTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGgc < 6:63081/148‑1 (MQ=255) aTGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCa < 8:268000/146‑1 (MQ=255) aTGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAgg < 3:212897/148‑1 (MQ=255) aTGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGgc < 1:247374/149‑1 (MQ=255) tGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggctttt < 5:158230‑M1/125‑26 (MQ=255) tGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAcc < 5:63174/140‑1 (MQ=255) tGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAcc > 6:63174/1‑140 (MQ=255) gTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGgcgc > 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aaaCCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGa > 5:21962/1‑149 (MQ=255) cTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCaa > 1:356597/1‑149 (MQ=255) gCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAAc < 1:314437/147‑1 (MQ=255) cATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAAt < 1:158276/149‑1 (MQ=255) cATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAAt < 2:275759/149‑1 (MQ=255) ttAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATa > 1:180242/1‑148 (MQ=255) ttAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATa > 8:126428/1‑148 (MQ=255) ttAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATa > 8:228135/1‑148 (MQ=255) aaaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATaaa < 7:237752/148‑1 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcaacaccacgtatggatagagatcgtgagtaca > 6:158230‑M2/1‑25 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcaacaccacgtatggatagagatcgtgagtaca < 5:158230‑M2/125‑101 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAAc < 1:326386/148‑1 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACg > 4:184995/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGc > 8:353847/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGAT‑CGCCGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATACACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATAGCGGGTATCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGCCCAACGAATAAACg > 7:228496/1‑148 (MQ=255) gCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcaacaccacgtatggatagagatcgtgagtacattagaacaaacaataggcaatacgcctc > 8:10664‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGcc > 4:339749/1‑149 (MQ=255) ccGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGc > 5:15264/1‑148 (MQ=255) cGGAggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcaacaccacgtatggatagagatcgtgagtacattagaacaaacaataggcaatacgcctctgg < 2:347926‑M1/149‑146 (MQ=255) | TTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCA > NC_000913/2539529‑2539819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |