| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2539674 | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/246 | NT | NA | intergenic (‑91/+43) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit |
| ? | NC_000913 | = 2539688 | NA (NA) | intergenic (‑105/+29) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGC > NC_000913/2539540‑2539830 | ttCACCAGAGGTGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGcc > 1:51126/1‑149 (MQ=255)ttCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGcc > 6:343400/1‑149 (MQ=255) ccAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccg < 2:347926‑M2/149‑5 (MQ=255) cAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgg > 8:266596‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgg > 8:159602‑M2/1‑144 (MQ=255) gagGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgggc > 8:10664‑M2/1‑142 (MQ=255) gCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 7:268000/1‑149 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAGTGTAATCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGAAGCTTGATCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGACCGGAT‑ATCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 5:63081/1‑148 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGt < 2:380724/140‑1 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGt > 1:380724/1‑140 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 6:212113/1‑148 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 5:231579/1‑148 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTc < 4:81201/149‑1 (MQ=255) cTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCa < 6:414428/149‑1 (MQ=255) ttgtttgtTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTc < 1:347926/149‑1 (MQ=255) gttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGAccgggctttttaatggcaaggtttgt > 6:33753‑M2/1‑122 (MQ=255) ttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTAt > 1:334133/1‑149 (MQ=255) ttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTAt > 8:237752/1‑149 (MQ=255) 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tCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTtg > 3:105090/1‑149 (MQ=255) tCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTtg > 3:115150/1‑149 (MQ=255) tCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTtg > 6:279968/1‑149 (MQ=255) aCGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTtgtg > 7:173270/1‑149 (MQ=255) aCGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTtgtg > 7:382871/1‑149 (MQ=255) cGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGc < 8:382871/149‑1 (MQ=255) cGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGc < 3:93538/149‑1 (MQ=255) gATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGc > 2:326386/1‑148 (MQ=255) ctctATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCga > 6:36026/1‑147 (MQ=255) tATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCgaga < 8:224671/146‑1 (MQ=255) 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ttAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATa > 7:261304/1‑148 (MQ=255) aaaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATaaa < 7:237752/148‑1 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcaacaccacgtatggatagagatcgtgagtaca > 6:158230‑M2/1‑25 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCtccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcaacaccacgtatggatagagatcgtgagtaca < 5:158230‑M2/125‑101 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAAc < 1:326386/148‑1 (MQ=255) aaaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACg > 4:184995/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGc > 8:353847/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGAT‑CGCCGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATACACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATAGCGGGTATCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGCCCAACGAATAAACg > 7:228496/1‑148 (MQ=255) ccGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGcc > 4:339749/1‑149 (MQ=255) ccGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGc > 5:15264/1‑148 (MQ=255) cGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCa < 3:184995/149‑1 (MQ=255) t‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCt < 7:353847/149‑1 (MQ=255) gggAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgg < 7:41293/149‑1 (MQ=255) gggAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgg < 1:9317/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGc < 6:260864/149‑1 (MQ=255) | TTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAT‑CGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGC > NC_000913/2539540‑2539830 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |