| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 75,953 | IS2 (–) +5 bp | coding (1343‑1347/1656 nt) | sgrR ← | transcriptional DNA‑binding transcriptional activator of sgrS sRNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 75953 = | 2 (0.060) | 48 (1.320) | 44/250 | 0.0 | 95.8% | coding (1347/1656 nt) | sgrR | transcriptional DNA‑binding transcriptional activator of sgrS sRNA |
| ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 75957 | 2 (0.060) | 45 (1.250) | 39/248 | 0.1 | 95.6% | coding (1343/1656 nt) | sgrR | transcriptional DNA‑binding transcriptional activator of sgrS sRNA |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TCTCGCCATTGCGCCAGCGAGCAGCGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGCCAGAATCTGCTGCATGATCCCGGCAATCACCCGATGCTCACTGTGATCCTGATAAAAGGTTAGGGTGAGGCTTTCCAGGCCAGC > NC_000913/75811‑76105 | tctcGCCATTGCGCCAGCGAGCAGCGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtg > 7:94304‑M1/1‑147 (MQ=255) tgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCt > 1:54211‑M1/137‑149 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGCAGCGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgccc > 4:133045‑M1/1‑138 (MQ=255) gcCAGCGAGCAGCGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgccccta < 8:94304‑M1/149‑15 (MQ=255) cgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCTGTATGc > 1:132750‑M1/130‑148 (MQ=255) gcagcGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgcccctatatttcca < 3:133045‑M1/149‑23 (MQ=255) gcagcGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAt > 1:81896‑M1/1‑127 (MQ=255) gcagcGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAt < 2:81896‑M1/128‑2 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGAtctctc < 4:131500‑M1/11‑1 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGAtctctc > 3:131500‑M1/119‑129 (MQ=255) ccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATctct > 2:201957‑M1/110‑149 (MQ=255) ccAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 5:168931‑M1/1‑113 (MQ=255) ctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCTTTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCttt > 6:3701‑M1/108‑149 (MQ=255) ctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCg < 4:118573‑M1/28‑1 (MQ=255) 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gCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgcccctatatttcca < 7:51825‑M1/109‑23 (MQ=255) gCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgcccctatatttcca > 8:51825‑M1/1‑87 (MQ=255) tGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgcccctatatttccagac > 3:8291‑M1/1‑83 (MQ=255) tGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGAtggatttgcccctatatttccagac < 4:8291‑M1/108‑26 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGc < 1:95092‑M1/69‑1 (MQ=255) tagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGCCAg < 6:13167‑M1/72‑1 (MQ=255) 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tCACTTTCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac > 5:179107‑M1/1‑10 (MQ=255) tctaTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGCCAGAATCTGCTGCATGATCCCGGCAATCACCCGATGCTCACTGTGATCCTGa < 7:59290‑M1/121‑1 (MQ=255) tctaTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGCCAGAATCTGCTGCATGATCCCGGCAATCACCCGATGCTCACTGTGATCCTGa > 8:59290‑M1/5‑125 (MQ=255) tttCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgca > 6:50605‑M1/1‑6 (MQ=255) tttCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgca < 5:50605‑M1/144‑139 (MQ=255) tttCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg > 2:186349‑M1/1‑6 (MQ=255) tttCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg < 1:186349‑M1/89‑84 (MQ=255) ttCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGCCAGAATCTGCTGCATGATCCCGGCAATCACCCGATGCTCACTGTGATCCTGATAAAAGGTTAGGGTGAGGCTTTCCAGGc > 5:96083/1‑149 (MQ=255) gAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata < 3:140903‑M1/70‑69 (MQ=255) gAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata > 4:140903‑M1/1‑2 (MQ=255) atggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttg > 8:134488‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCTCGCCATTGCGCCAGCGAGCAGCGTCGGCTTGCCAGTCAATGGGAATGCAATGTTGTAGCAGTGGCACTTCGCATAAATGTGCGAAAACAGAGAAGTCCAGCGGCAGGGTAAAGTTGGCGCTGTTTAGCCAGATATCACTTTCGATCTCTCCTGTATGCCACTGATCGTAGTCGATCTCTTTGATTTTCAGCGTGACCTGGTGACTTGCCAGAATCTGCTGCATGATCCCGGCAATCACCCGATGCTCACTGTGATCCTGATAAAAGGTTAGGGTGAGGCTTTCCAGGCCAGC > NC_000913/75811‑76105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |