| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2643100 | 39 (1.070) | 9 (0.280) | 9/230 | 2.3 | 18.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 2643110 | 43 (1.320) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCAC > NC_000913/2642956‑2643244 | tgtgCTCGTGACAAATCAAACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑a < 8:6754/146‑1 (MQ=255) cTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttat > 3:33165‑M1/1‑141 (MQ=255) aaaGCCCACTTTCACTAAGTCTAAATTACTGTTGCATCTTTACATACTGCCTTAAAGTCAGAAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAaccgtg > 8:47887‑M2/1‑143 (MQ=255) aaaGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtg < 4:33165‑M1/149‑17 (MQ=255) aaGCCCACATTCAGTTAGGCTAACGTACTGTTGCAGCGTTACATACTGCCTTAATGGCAGCAAAATCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAACACATTACGCCACTGTtactttatgtaccgtgg < 8:119264‑M1/149‑18 (MQ=255) aaGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtgg > 6:167115‑M1/1‑132 (MQ=255) gCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggcg < 5:167115‑M1/149‑20 (MQ=255) aTTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg > 5:40130/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTAccgtggcgtaatgttttat < 1:104394‑M2/148‑20 (MQ=255) 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cGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt < 7:119868/100‑1 (MQ=255) gTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGacataaagtaaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactt > 2:104394‑M1/1‑60 (MQ=255) atatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGt < 8:115350/149‑1 (MQ=255) aCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 1:141918/95‑1 (MQ=255) aCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt > 2:141918/1‑95 (MQ=255) aCAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATcg > 7:41552/1‑149 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATcgcc < 3:157554/149‑1 (MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa < 6:37248/63‑1 (MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 5:37248/1‑63 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACca > 7:17388/1‑149 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggc > 8:89039‑M1/1‑29 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggc < 7:89039‑M1/47‑19 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa < 8:35258/116‑1 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa > 7:35258/1‑116 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAg > 2:183756/1‑149 (MQ=255) attcatAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGgc < 2:916/148‑1 (MQ=255) atAAAACATTACGCCACGGacataaagtaaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagcctta < 1:104394‑M1/148‑129 (MQ=255) tAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACTGGCAGCATc < 8:41552/149‑1 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGCCCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCGTCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc > 1:166127/1‑148 (MQ=255) 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cACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcacca > 4:64173/1‑149 (MQ=255) aCGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacga > 4:2213‑M1/1‑5 (MQ=255) aCGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacga < 3:2213‑M1/112‑108 (MQ=255) ggT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTAAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcaccac > 2:93612/1‑147 (MQ=255) gTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgc < 8:8573‑M1/77‑76 (MQ=255) gTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgc > 7:8573‑M1/1‑2 (MQ=255) gT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc > 2:100900/1‑132 (MQ=255) gT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc < 1:100900/132‑1 (MQ=255) | TGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCAC > NC_000913/2642956‑2643244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |