| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2643100 | 39 (1.070) | 9 (0.280) | 9/230 | 2.3 | 18.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 2643110 | 43 (1.320) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGTTTTACG > NC_000913/2642968‑2643254 | aaaGCCCACTTTCACTAAGTCTAAATTACTGTTGCATCTTTACATACTGCCTTAAAGTCAGAAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAaccgtg > 8:47887‑M2/1‑143 (MQ=255) aTTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg > 5:40130/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTAccgtggcgtaatgttttat < 1:104394‑M2/148‑20 (MQ=255) ttACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCttt > 8:73038/1‑148 (MQ=255) ttGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 7:73038/147‑1 (MQ=255) tCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAaccgt > 4:2213‑M2/1‑107 (MQ=255) tCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAaccgt < 3:2213‑M2/112‑6 (MQ=255) aTACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAccc > 1:149341/1‑149 (MQ=255) tACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCt < 6:40130/149‑1 (MQ=255) aCTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTg > 1:916/1‑149 (MQ=255) ttAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCg > 7:27438/1‑149 (MQ=255) aaGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTAccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaac > 2:104394‑M2/1‑90 (MQ=255) aGTCAGCTAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTa < 8:27438/149‑1 (MQ=255) gCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAg < 2:149341/149‑1 (MQ=255) cAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAgg > 4:157554/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAggg > 7:115350/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAac < 8:8573‑M2/77‑3 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAac > 7:8573‑M2/1‑75 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGAt < 8:63182/114‑1 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGAt > 7:63182/1‑114 (MQ=255) cGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt < 7:119868/100‑1 (MQ=255) cGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 8:119868/1‑100 (MQ=255) atatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGt < 8:115350/149‑1 (MQ=255) aCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt > 2:141918/1‑95 (MQ=255) aCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 1:141918/95‑1 (MQ=255) aCAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATcg > 7:41552/1‑149 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATcgcc < 3:157554/149‑1 (MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 5:37248/1‑63 (MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa < 6:37248/63‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACca > 7:17388/1‑149 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa < 8:35258/116‑1 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa > 7:35258/1‑116 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAg > 2:183756/1‑149 (MQ=255) attcatAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGgc < 2:916/148‑1 (MQ=255) 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gCCACGGT‑ACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagt < 7:89039‑M2/47‑30 (MQ=255) gCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcac < 8:17388/149‑1 (MQ=255) ccACGGT‑ACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagccttagtgaatgtgggctt > 6:167115‑M2/1‑17 (MQ=255) ccACGGT‑ACATAAAGTAacagtggcgtaatgtgttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgattttgctgccattaaggcagtatgtaacgctgcaacagtacgttagcctaactgaatgtgggctt < 8:119264‑M2/149‑133 (MQ=255) ccACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcacc > 4:45102/1‑149 (MQ=255) cACGGT‑ACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagccttagtgaatgtgggcttt < 4:33165‑M2/149‑134 (MQ=255) cACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATg > 2:84696/1‑50 (MQ=255) cACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcacca > 4:64173/1‑149 (MQ=255) ggT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTAAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcaccac > 2:93612/1‑147 (MQ=255) gT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc < 1:100900/132‑1 (MQ=255) gT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc > 2:100900/1‑132 (MQ=255) aTAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagccttagtgaatgtgggctttgtcacgag > 3:33165‑M2/1‑8 (MQ=255) aTAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATg > 6:58205/1‑48 (MQ=255) aTAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATg < 5:58205/48‑1 (MQ=255) aTAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGttt > 1:21158/1‑148 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGTTTTACg > 1:127682/1‑149 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGTTTTACg > 8:143788/1‑149 (MQ=255) | AAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑ACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGTTTTACG > NC_000913/2642968‑2643254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |