New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 1943789 = | 73 (0.850) | coding (376/786 nt) | znuB | zinc ABC transporter permease | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGC > NC_000913/1943623‑1943912 | tCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc > 4:91384/1‑149 (MQ=255) tCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc > 1:249578/1‑149 (MQ=255) cTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCt < 5:372229/149‑1 (MQ=255) cTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGGCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCt < 2:271502/149‑1 (MQ=255) tGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTg > 4:299392/1‑149 (MQ=255) gTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTgg > 7:65264/1‑148 (MQ=255) gTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGTCGTGAGTCTGATGGCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTg < 5:284170/147‑1 (MQ=255) ggCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGt > 7:246539/1‑148 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAc > 4:257421/1‑149 (MQ=255) 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atGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGAGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGa > 4:122793/1‑149 (MQ=255) tGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGAt < 4:52388/149‑1 (MQ=255) gCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGTTTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATg < 3:299392/148‑1 (MQ=255) ttACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGgtg > 1:396976/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGgtgt < 6:267560/148‑1 (MQ=255) ccTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGa < 4:302780/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGa > 2:69555/1‑148 (MQ=255) cTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATAGCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGa > 5:174080/1‑148 (MQ=255) ttCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTg > 6:323144/1‑99 (MQ=255) ttCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTg < 5:323144/99‑1 (MQ=255) cGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTa < 5:236794/148‑1 (MQ=255) ggTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACa < 5:282935/149‑1 (MQ=255) ggTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTATGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTGGTTGATGGTGTGAAATTa > 6:321987/1‑147 (MQ=255) gTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAg > 4:216086/1‑149 (MQ=255) gTGATTTGCGGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAg < 2:351203/149‑1 (MQ=255) tGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGc < 7:189104/149‑1 (MQ=255) | TCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC‑GCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGC > NC_000913/1943623‑1943912 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |