New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 471220 | 54 (0.620) | 3 (0.040) | 3/250 | NT | 5.1% | coding (585/1782 nt) | mdlB | putative multidrug ABC transporter ATPase |
? | NC_000913 | = 471245 | 61 (0.740) | coding (610/1782 nt) | mdlB | putative multidrug ABC transporter ATPase |
TCCTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGCGAGGATGCA > NC_000913/471072‑471363 | tCCTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTTGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGT < 2:31787‑M1/149‑1 (MQ=255) tCCTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGT > 7:195713‑M1/1‑149 (MQ=255) tCCTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGT < 8:933‑M1/149‑1 (MQ=255) cTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAGTGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGACTGTCCGTCgtgt < 2:215131/149‑1 (MQ=255) cTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCgtgt < 8:62126/149‑1 (MQ=255) aGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTgcgcgc < 3:356148/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATGTTCACGGTGGAGCTGGTGGTAATGGTGATATAACAGAGTTACAGCACGCCGATTCTCCGTCGTGTGCGCGCGTAtat > 4:98584/1‑147 (MQ=255) cTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGc < 7:355142/149‑1 (MQ=255) gtggGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGGGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGGGCGCGCCTATTTGGCg < 1:46033/147‑1 (MQ=255) tggtggCTATGGTCCGCATCGACTGGCGAATGGCAAGGGTTGCGATAATGCTTTTCCAGGTGGTGGTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTtgatatccgccaaataggcgcgcacacgacgga < 5:254538‑M1/149‑34 (MQ=255) gCGATGTTCACCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGCGGCGACAATGATCATCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTaa < 8:301672/149‑1 (MQ=255) gATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAAc > 4:33540/1‑148 (MQ=255) tGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGaa < 7:263839/149‑1 (MQ=255) ttCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGaaa < 3:333556/148‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTtgatatccgccaaataggcgcgcacacgacgg > 4:133139‑M1/1‑104 (MQ=255) tCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTtgatatccgccaaataggcgcgcacacgacgg < 3:133139‑M1/136‑33 (MQ=255) tCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAat > 4:90361/1‑148 (MQ=255) cAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCGGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAacga < 7:401578‑M2/132‑5 (MQ=255) cAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCGGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAacga > 8:401578‑M2/1‑128 (MQ=255) gCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAatcat > 8:99025/1‑148 (MQ=255) ccTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAatcatc > 1:239208/1‑148 (MQ=255) cTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCaa < 5:115084/149‑1 (MQ=255) gACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTTCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATg < 8:174934/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATgg > 5:325513/1‑148 (MQ=255) gAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGc < 2:134610/149‑1 (MQ=255) aaTGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCg > 4:131839/1‑149 (MQ=255) tGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGtt < 3:90361/149‑1 (MQ=255) tGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGCCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGtt < 6:383514/149‑1 (MQ=255) gCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTa < 1:227209/148‑1 (MQ=255) tggCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCCTCAATGGCATGAGCGTTATCcagcag > 3:162848/1‑149 (MQ=255) tggCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCcagcag > 8:52156/1‑149 (MQ=255) gCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGtt < 3:131839/149‑1 (MQ=255) gCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCGGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGt < 6:167214/148‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACGAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGGGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTc < 5:120451/149‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTc < 6:16967/149‑1 (MQ=255) aTAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCg > 7:393927/1‑149 (MQ=255) aTGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGt > 4:195687/1‑147 (MQ=255) gATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTcag > 5:90283/1‑148 (MQ=255) tttCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTca > 7:112452/1‑144 (MQ=255) tttCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTca < 8:112452/144‑1 (MQ=255) tCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGgcg > 8:365335/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTAtt > 5:286272/1‑72 (MQ=255) cGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTAtt < 6:286272/72‑1 (MQ=255) ggtggtAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAAc > 4:176743/1‑149 (MQ=255) gtggtAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAAc < 4:50150/148‑1 (MQ=255) gtAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTAt > 6:87265/1‑149 (MQ=255) tAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATg < 5:119520/149‑1 (MQ=255) ggTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAAAGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATgggg > 1:158689/1‑148 (MQ=255) gTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATgggg > 8:112798/1‑147 (MQ=255) gTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGa < 6:164047/149‑1 (MQ=255) tGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGAGTTGGCGAACGTATGGGGGAg > 2:387428/1‑149 (MQ=255) gATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGGTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAgg > 5:7711/1‑149 (MQ=255) cAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCCCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATAAAAAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCg > 4:366070/1‑149 (MQ=255) gTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCTCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTca < 8:350562/149‑1 (MQ=255) aCAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTcaca < 3:176743/148‑1 (MQ=255) gCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTca > 4:91623/1‑143 (MQ=255) gCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTca < 3:91623/143‑1 (MQ=255) cACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGATATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTAGGGGGGAGGCCAGTCGTTCACCCtcta > 6:322627/1‑149 (MQ=255) gCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATgg > 3:130699/1‑149 (MQ=255) ccGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGc > 2:368768/1‑149 (MQ=255) cGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGc > 1:54320/1‑148 (MQ=255) tCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAacgacggacaatcggcgtgctgtaacgctggtatatcaccattaccaccaccaccacctggaaaagcattatcgcaacccttgccattcgccagtcgatgcggaccatagccacca < 5:254538‑M2/149‑117 (MQ=255) tCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGCGAGGAt > 5:76590/1‑148 (MQ=255) tCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGCGAGGAt < 6:76590/148‑1 (MQ=255) ccGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAacgacggacaatcggcgtgctgtaacgctggtatatcaccattaccaccagcaccaccgggaaaatcattatcgccaccagtgccattcgccagtcgaggctga < 3:133139‑M2/136‑105 (MQ=255) ccGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAacgacggacaatcggcgtgctgtaacgctggtatatcaccattaccaccagcaccaccgggaaaatcattatcgccaccagtgccattcgccagtcgaggctga > 4:133139‑M2/1‑32 (MQ=255) ccGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATAAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCCGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGCGAGGATGc > 4:253057/1‑149 (MQ=255) gtcgtGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGCGAGGATGCa > 3:293637/1‑148 (MQ=255) tcgttgatatccgccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacgccggtatatcaccattaccaccagcaccaccgggaaaatcattatcgccaccagtgccattcgccagtcgaggctg < 7:401578‑M1/132‑129 (MQ=255) tcgttgatatccgccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacgccggtatatcaccattaccaccagcaccaccgggaaaatcattatcgccaccagtgccattcgccagtcgaggctg > 8:401578‑M1/1‑4 (MQ=255) | TCCTGCGCAGTGCCGCGCTGGTGGGCGCGATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCGGATATCAACGACGGCTTTAACGAAATCATCAATGGCATGAGCGTTATCCAGCAGTTTCGTCAGCAGGCGCGATTTGGCGAACGTATGGGGGAGGCCAGTCGTTCACACTATATGGCGAGGATGCA > NC_000913/471072‑471363 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |