New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3800403 | 161 (1.790) | 4 (0.050) | 4/238 | NT | 2.5% | coding (563/699 nt) | waaY | lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
? | NC_000913 | = 3800415 | 152 (1.750) | coding (551/699 nt) | waaY | lipopolysaccharide core biosynthesis protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCAAT > NC_000913/3800270‑3800560 | gggggcttgtTTACCTTTCAAAAGGCGCATTAAATTTCTCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGa > 6:278251‑M2/5‑146 (MQ=255) gcgcgcTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑cgctgcgctg > 1:246181/1‑146 (MQ=255) gcgcTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGaagc > 8:14116‑M2/1‑144 (MQ=255) cgcTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCa < 5:91111/148‑1 (MQ=255) gTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCtt > 6:100804/1‑148 (MQ=255) tCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTTCGCTGAAGCACGCTTTc < 2:295480/147‑1 (MQ=255) tCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTcc > 8:417067/1‑148 (MQ=255) tCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTcc > 4:243622/1‑148 (MQ=255) tttCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCg > 2:436976/1‑145 (MQ=255) ttCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTCAGCGCAGCG‑TAaagcgaaagatcgtatt < 1:72866‑M2/147‑18 (MQ=255) tCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGga > 4:406755/1‑145 (MQ=255) cAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGga > 6:271644/1‑144 (MQ=255) cgccgcATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGa < 2:150487/148‑1 (MQ=255) gcATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGATGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAAt > 3:245896/1‑148 (MQ=255) aaaaTTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCg > 1:130228/1‑147 (MQ=255) aaaTTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGaa < 5:196654/148‑1 (MQ=255) gcgcATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTc < 2:350597/147‑1 (MQ=255) cATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCa > 5:406700/1‑148 (MQ=255) tttttttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAtt > 3:173631/1‑148 (MQ=255) ttttttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTCAGCGCAGCG‑TAaagcgaaagatcgtattg > 3:296111‑M2/1‑104 (MQ=255) tttttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAtttt > 3:377244/1‑148 (MQ=255) tttttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAttt < 2:130228/147‑1 (MQ=255) ttttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTCAGCGCAGCG‑TAaagcgaaagatcgtattgacttagagcgtcattacggtattaaaa > 2:72866‑M2/1‑102 (MQ=255) tttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAttttt < 2:121155/147‑1 (MQ=255) ttACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAtttttt < 5:182276/147‑1 (MQ=255) cGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTACTCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCGCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTtata < 3:224893/147‑1 (MQ=255) cGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTtata < 5:271644/147‑1 (MQ=255) cGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATaa < 3:90890/148‑1 (MQ=255) gATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAAt < 7:185662/148‑1 (MQ=255) atatACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAAt > 4:76381/1‑147 (MQ=255) tataCTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGa < 8:336905/148‑1 (MQ=255) tataCTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGa < 7:399999/148‑1 (MQ=255) tataCTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGa < 7:192403/148‑1 (MQ=255) taCTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAg < 7:417067/148‑1 (MQ=255) cTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGtt < 4:367588/148‑1 (MQ=255) aaaaGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATa < 6:395450/114‑1 (MQ=255) aaaaGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATa > 5:395450/1‑114 (MQ=255) aaaaGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTAc > 4:291834/1‑148 (MQ=255) aaaGATAATAGCCTATATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACTATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGTAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTAcg < 7:348725/148‑2 (MQ=255) aaaGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTAc > 4:112208/1‑147 (MQ=255) aaGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCa > 5:303728/1‑148 (MQ=255) gATAATCGCCTAGATATCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATATGATCTATCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCAGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACg < 3:322974/148‑1 (MQ=255) gATAATAGCCTAGATCTCTAATCTTATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACg < 7:309149/148‑1 (MQ=255) gATAATAGCCTAGATCTCTAATCTTATTTTTAATACAGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACg < 7:309150/148‑1 (MQ=255) gATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACTCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACg < 7:88574/148‑1 (MQ=255) ataataGCCTAGATATATACTCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCTCCATTTTTtata < 1:378906/133‑1 (MQ=255) ataGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATgg < 2:419036/148‑1 (MQ=255) ataGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATgg < 1:436976/148‑1 (MQ=255) gCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGAt > 2:36039/1‑143 (MQ=255) gCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGAt < 1:36039/143‑1 (MQ=255) gCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATggggg < 1:172440/148‑1 (MQ=255) aGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGc > 8:438927/1‑148 (MQ=255) gATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGc < 2:161638/80‑1 (MQ=255) tctAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTc < 6:86832/80‑1 (MQ=255) ctAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGaaa > 2:207644/1‑148 (MQ=255) ctAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCAGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACAACGATGGGGGTCGCCAGaaa > 4:6937/1‑148 (MQ=255) aTCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcca < 7:72472/148‑1 (MQ=255) aTCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcc < 3:337408/147‑1 (MQ=255) aTCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcc < 3:406755/147‑1 (MQ=255) aTCTCATTTTTAATACCGTAATGAAGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATATTGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcca < 8:121325/148‑1 (MQ=255) tctcATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcca < 1:129518/147‑1 (MQ=255) ctcATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGt > 3:172563/1‑134 (MQ=255) ctcATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAccatg > 2:94957/1‑148 (MQ=255) tcATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGaa < 1:393973/116‑1 (MQ=255) cATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACAATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAccatgc > 6:319025/1‑147 (MQ=255) cATTTATAATACCTTAATGACGCTCTAAGTCAATACGAACTTTCGCTTTA‑CTATTAGCTGAACCACGCTTTACTGAGAGATAGATAATTCGAACATCACAATTTTTTATAATAAAg > 2:393973/1‑116 (MQ=255) ttttAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAccatgccatg > 1:151925/1‑148 (MQ=255) aaTACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTg < 8:323300/147‑1 (MQ=255) ccGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTa < 1:207644/148‑1 (MQ=255) cGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTaa < 4:348852/148‑1 (MQ=255) gTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGa < 8:244292/79‑1 (MQ=255) aTGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATAGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAATCCATGCCATGTTGATGTAAGGCa < 8:134444/148‑1 (MQ=255) tGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcc > 4:313404/1‑126 (MQ=255) gACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCAt > 5:421102/1‑147 (MQ=255) ctAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACGACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAattga > 6:47330/1‑148 (MQ=255) tAAGTCAATACTATCTTTCGCTTTA‑CGCTGAGCTGAAGCACGCTTTACGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAttttt > 2:141190/1‑81 (MQ=255) tAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATTAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAattgat > 2:200596/1‑148 (MQ=255) tAAGTCAATAATATCTTTCGATTTA‑CGCTTCGCTGAAGCACGCTTTCCGTAGAGATCTATAATTCGAAACTCACCATTTTTTATAATGAATTTACCACGATTTGGGTAGACAGAAAAAATGCCATTTTGATGTAAGGCATTAattg < 3:258085/146‑1 (MQ=255) aaGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGaa > 4:1283/1‑67 (MQ=255) aaGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGa > 8:350568/1‑66 (MQ=255) aaGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTta > 1:346007/1‑82 (MQ=255) cAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCa > 4:259031/1‑134 (MQ=255) aaTACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGa < 5:84762/148‑1 (MQ=255) aTACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGaa > 3:43636/1‑148 (MQ=255) aCGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAAcc > 7:199224/1‑109 (MQ=255) aCGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAatt > 1:443704/1‑148 (MQ=255) aCGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAatt > 2:342016/1‑148 (MQ=255) aCGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCAATAATTGATTGCTGAatt > 7:246745/1‑148 (MQ=255) aTCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAat > 1:422087/1‑132 (MQ=255) aTCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAat < 2:422087/132‑1 (MQ=255) aTCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAatttta > 1:322256/1‑148 (MQ=255) aTCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAatttta > 5:220831/1‑148 (MQ=255) ttCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAAcc < 7:66659/54‑1 (MQ=255) tCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAattttatt < 4:173631/145‑1 (MQ=255) tCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAatttta < 3:112208/143‑1 (MQ=255) gCTTTA‑CGCTGCGCTGAATCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTa < 6:145948/148‑1 (MQ=255) gCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTAtttttt < 1:94957/147‑1 (MQ=255) ttA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCAATTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGAATTAATTGAATGCTGAATTTTATTTTTTAgcg > 5:111088/1‑148 (MQ=255) ctgAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCaa > 8:267435/1‑147 (MQ=255) ctgAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCAat < 8:191222/148‑1 (MQ=255) | GCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTCATTTTTAATACCGTAATGACGCTCTAAGTCAATACGATCTTTCGCTTTA‑CGCTGCGCTGAAGCACGCTTTCCGGAGAGATCGATAATTCGAACCTCACCATTTTTTATAATGAAGTTACCACGATGGGGGTCGCCAGAAACCATGCCATGTTGATGTAAGGCATTAATTGATTGCTGAATTTTATTTTTTAGCGCATCATCAAT > NC_000913/3800270‑3800560 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |