New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 951207 = | 108 (1.520) | 5 (0.070) | 5/270 | 9.1 | 4.7% | intergenic (‑127/+65) | pflA/pflB | pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme; [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme; PFL activase/formate C‑acetyltransferase 1, anaerobic; pyruvate formate‑lyase 1 |
? | NC_000913 | 951233 = | 100 (1.470) | intergenic (‑153/+39) | pflA/pflB | pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme; [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme; PFL activase/formate C‑acetyltransferase 1, anaerobic; pyruvate formate‑lyase 1 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GACCAATAACTGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTA > NC_000913/951065‑951349 | gACCAATAACTGACATTGCAGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGCTGGTACTCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCCTAAAGTATAGATAGCAGAC‑AAAAAAAGAACTCGCGCTaaaa > 2:823829/1‑143 (MQ=255) cAATAACTGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGGCGTGCTGGTGCGGAGCTGGACGGCTGCGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTAACCTTAAAGTACAGATAGCTGCG‑AAGAAAGGCTCTCCGGCTCAAAAAg > 2:238759/1‑143 (MQ=255) cAATAACTGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AGAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAg > 2:1289569/1‑143 (MQ=255) aaTAACTGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑GAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAgg > 1:326332/1‑143 (MQ=255) aaTAACGGACACGGCGGTGGTTGTCAAGAGGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGATGGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTAACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAgg < 2:291715/143‑1 (MQ=255) aTAACTGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCCTAAAGTATAGATACCTGAC‑‑AAAACGGCTCTCGCGCTAAAAAAgcca > 2:1009767/1‑140 (MQ=255) tGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCAc > 1:23984/1‑143 (MQ=255) tGCGGGGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTCGGCGCGCAGCGCGAAGGCTACGTCGAGTCTGCTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGt < 1:1280305/143‑1 (MQ=255) gCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑ATAAAATGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTg < 2:23984/143‑1 (MQ=255) gCGGTGTTGCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAACTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCATCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTg < 1:350597/143‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTCTCCCGAGGTGGCCCGTCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTg < 2:323871/143‑1 (MQ=255) gtgtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAACGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACCTTCGTGGAg > 1:472531/1‑143 (MQ=255) gtgtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAg > 1:378001/1‑143 (MQ=255) gtgtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGGCGAGTCGGTTTTGGCAGTCACCTGAGAGTATAGATAGCTGCC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAGAAAAGGCCCCACTTTCTTGGac > 1:119470/1‑142 (MQ=255) tgtTTCTCCACATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑c < 1:14854/143‑1 (MQ=255) tgctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCtt < 2:194383/141‑1 (MQ=255) tctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTTCGCATCTCGAAGGCTACGTCTAGTCTGTTTTGGCAGTCACATTAAAGTATAGATAGCGGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCttt < 1:567935/143‑1 (MQ=255) tctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCttt > 1:1148539/1‑143 (MQ=255) ctcCAGATGTGGCCCATCTGCGGTCGGGTTCGCGTCCTTCTTGAAGTCTAAGTCGAGTCCGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTa < 2:908577/143‑1 (MQ=255) ctcCAGACGTGGCCCATCTGAGGGCGTGTTGGTGCGCAGCTCGATGGCAGCTTCTATTGGGATTCGGCCGGCAGCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTa < 2:914884/143‑1 (MQ=255) tcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAACAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTa > 2:1050240/1‑143 (MQ=255) ccAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑tt > 1:753830/1‑143 (MQ=255) ccAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑tt < 1:734281/143‑1 (MQ=255) aGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAACGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑ACTTTA‑TTGt > 2:625430/1‑143 (MQ=255) gATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTa < 2:273794/143‑1 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAGGCATATATAGCTGAC‑AATAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGAGGAG‑CCGTTA‑TTGTACGCttt > 2:697522/1‑143 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAACGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCCTGGAG‑CCCTTA‑TCGTACGCttt > 2:588050/1‑143 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCttt > 1:1009798/1‑143 (MQ=255) cccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCtttt < 2:1177831/143‑1 (MQ=255) ccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTGACCTTCAAATATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCCCTAAAAAAGGCCACACTTCCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGAtattt > 2:663615/1‑143 (MQ=255) ccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCttttt > 1:1199193/1‑143 (MQ=255) tCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATCGTTGTG‑TTGTTGTAGACACACGCTAAAAAAAGCCCCAAATTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACt > 1:592711/1‑143 (MQ=255) cTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGGTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCGCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTg < 2:934352/143‑1 (MQ=255) tGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGt > 2:496183/1‑143 (MQ=255) ggCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGtgtg > 1:1138199/1‑140 (MQ=255) gCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGa > 1:768174/1‑143 (MQ=255) cGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTCCTTTGAGTGTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGAtt > 2:783477/1‑143 (MQ=255) cGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGAtt > 2:362469/1‑143 (MQ=255) tgtTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTc > 1:838342/1‑143 (MQ=255) ttttgttcgcATCTCGAAATCTATGTCTAGTCTGTTTTGGCATTCACCTTAAAGTATAGATATCTGAC‑AAAAAATGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa < 2:655626/136‑1 (MQ=255) gtgggTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa < 1:704886/140‑1 (MQ=255) gtTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGGAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGCGGAG‑CCCTTA‑TTTTACGCTTTTTACTGTACGCTTTCa > 2:921806/1‑143 (MQ=255) gctGGTGCGCAGCTCGAAGACTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAATGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa < 1:1233694/141‑1 (MQ=255) ctGGTGCGCAGCTCGAAGACTACGTCGAGACTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCGCTCACGCTAAAAAAGGCCCGACTCTCGTGGAG‑ACTTTA‑TTGTACGCTTTTTCCTGTACGAGTGCAg > 2:1191653/2‑143 (MQ=255) tGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCGCTTTAAAGTATAGATCGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGGG‑CCTTTC‑TTGTACCGTTTTTACTGTACCATTTCAGTCaa > 2:706358/1‑143 (MQ=255) tGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCaa > 1:448755/1‑143 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATc < 2:326332/143‑1 (MQ=255) gcgcGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTaa < 2:88460/140‑1 (MQ=255) gcgcGAAGCCCACGCCGAGTCTGTTTTGCCACTCACCTTAACGCATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTTGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTaa < 1:219123/140‑1 (MQ=255) gCTCTAAGGCTAAGTCGAGGCTGTTTTGGCAGTGACCTTCAAGGATAGATAGCAGAC‑TAATAAGGCTCACGCCCTCAAATACGTCCTACATAAGTGGAG‑CCTTTA‑TTGGACGCTTCTGACTGTACGATTTCAGTCAAAGCTaa < 2:1234088/143‑1 (MQ=255) gCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCCAATCtca > 2:461794/1‑141 (MQ=255) cTCGAATGCTACGTCGAGTCTGTTTTGCGAGTCACATTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTACAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt < 2:166952/143‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt < 2:855717/143‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt < 2:856500/143‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt > 2:28187/1‑143 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCCCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt > 2:127888/1‑143 (MQ=255) cGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTa < 2:858484/143‑1 (MQ=255) aaGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACa > 2:355128/1‑143 (MQ=255) tACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGAGCCACGCACGAGG‑C‑CATTCACATGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCCAACCTAATTACCTAGAt > 2:569171/1‑143 (MQ=255) cGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTg > 1:793563/1‑143 (MQ=255) tCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGCC‑AAAAAAGGCTCTCACGCTAAAACAAGACCGACTTTCGTACAA‑CCAATA‑TTGTGCGCTTTTTACTCTACGACTTCCGTCTAATATAATTACCTatatggct > 2:151238/1‑139 (MQ=255) tCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAg < 2:245146/143‑1 (MQ=255) tCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACATTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATGGAg > 2:158282/1‑143 (MQ=255) aGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGa < 1:1268470/143‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCCCTTTCGTGGAGACATATA‑AT‑TTCGTGTTTTACTGTACGAGTCCCGTCCGATCTAATTACCTAGATTGAGTCAAg > 1:940599/1‑143 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAGTTACATAGCTTGAGGGAAg > 1:1116228/1‑143 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 1:496183/143‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 1:1107993/143‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGACAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 1:156654/143‑1 (MQ=255) tGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGt < 2:712842/143‑1 (MQ=255) tttGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATATAATTACATAGATTGAGTGGAGGTACg > 2:480961/1‑143 (MQ=255) ttGGCATTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGTAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGa < 2:40810/143‑1 (MQ=255) ttGGCAGTCACCTTAAAGTATAGAGAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGa < 1:1292112/143‑1 (MQ=255) cAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGACGGTACGAGtaa > 1:1125794/1‑143 (MQ=255) ccTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGt > 1:1215446/1‑143 (MQ=255) ttAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc > 2:544687/1‑143 (MQ=255) acaaaGTATTGATGGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc < 1:928564/141‑1 (MQ=255) aaaGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGATACGAGTAATAACGTCctg > 1:1130658/1‑143 (MQ=255) gTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg > 2:1117874/1‑143 (MQ=255) gTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg < 2:886805/143‑1 (MQ=255) gTAGAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCGCACGCGGTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTCCCTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg < 1:481395/143‑1 (MQ=255) tctagatagCTGAC‑AACAAGGGCTCTCGGGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCcagctgt < 2:1206140/141‑2 (MQ=255) tataGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctgc > 1:399526/1‑143 (MQ=255) aaagagcgCTGAC‑AACAAAGGCTCGCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATCGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctgct < 1:306692/136‑1 (MQ=255) agatagCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGt < 1:557993/143‑1 (MQ=255) tagCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCt < 1:362469/143‑1 (MQ=255) cTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTa < 1:1267482/143‑1 (MQ=255) aC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGCTTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACATCCTGCTGCTCTTCTTTAGta > 2:606010/1‑142 (MQ=255) aaaaaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTCTGATTGCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTCCTTTACTCAg > 2:847352/1‑143 (MQ=255) aaaaaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAAACTCCTGCCGCTGTGCTCTAGTCAg > 2:259617/1‑143 (MQ=255) aaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGa > 2:1152685/1‑143 (MQ=255) tctcGCGCTAAATCAGGCCCCACTTTCTTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGAGTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGaa < 1:1050240/143‑1 (MQ=255) tctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCGGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGCTAGCGAGTTGaa > 2:479120/1‑143 (MQ=255) tctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTCGaa > 1:876326/1‑143 (MQ=255) ctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGaaa > 1:82350/1‑143 (MQ=255) gcgcT‑AAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGATTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTGTAGTCAGCGAGTTGAAAAGTa > 2:703848/1‑143 (MQ=255) tAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGGAACGTACTg > 1:949781/1‑143 (MQ=255) aaaaaGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCg > 1:262551/1‑143 (MQ=255) aaaaGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGt < 2:399526/143‑1 (MQ=255) aaaGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATCACGTCCTGCTGCTAGTGTTTTGTCCACAAGTTAAAACGTACTGCGTa > 2:1111699/1‑143 (MQ=255) | GACCAATAACTGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTA > NC_000913/951065‑951349 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |