| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 63 (1.040) | 52/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 57 (0.950) | 45/276 | 0.3 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
TGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458654‑458795‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < NC_000913/609351‑609206 TGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCCCGACGGGCATCTTGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAT < 1:755685/143‑1 GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAACGTGGGGGAAACATC > 2:1086874/1‑143 CTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCC < 1:1093819/143‑1 GATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTCACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCga > 1:393028/1‑141 CAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCGTTCGCGGCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAAGGTGGGGGAGACATCCCGTAAGCGCTA > 2:611936/1‑143 CAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTA > 1:330378/1‑143 cAGCCGAAAGCGCAATCGACATCTAGTGAATAATTGACCTTTCCCATCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTCAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATATGCGCTAA < 2:452518/142‑1 GGAAGCGGAAGAGGCATCTGGTGAATAATGAACCAATCTCGTTCAATTGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCGCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAA < 2:599587/143‑1 GGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAA > 1:1095914/1‑143 AAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:940610/143‑1 GCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGACTGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACGTAAGGGTTG > 1:390126/1‑143 GCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATCAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:275099/1‑143 CAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATGTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGA < 1:563072/143‑1 AACAAGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACCATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAA < 1:94102/143‑1 ATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAGGCGCTAACTTAAGGGTTAAAACATCTG > 1:153802/1‑143 cgtGTGAATAGTTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAA < 2:221493/140‑1 cgGGTGCATAGTTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATATCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAA < 1:182496/141‑1 TGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAAT < 1:677105/143‑1 AATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTGACTTAAGGGTTGAACCACCTGAAGAATGg > 2:769951/1‑142 ATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACAATCTGAAGAATGCG > 2:1120903/1‑143 ataATTCCCTTACAATTAGTTAACGAACAAGGGGGGACTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTC < 2:958688/140‑1 ATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAACTTCTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGT < 1:7280/143‑1 CATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGAACCGTCTGAAGAATGCGAGGACTCGGTGGCTg > 1:920375/1‑142 ACAATTAGTTATCCAATAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGTCCTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTT < 2:970049/143‑1 ACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTT < 1:905966/143‑1 CAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTA < 1:995434/143‑1 AATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGTGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATGTGAAGAATGCGACGACTCCGTGACTCGTTca > 2:708559/1‑141 AATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAA < 1:778108/143‑1 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTAAAGGGTTGAACCGTCGACAGAATCCGACGCCACGGTGCCAGGTTCAGA > 2:8549/1‑143 GTTACCCCAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGGATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGA < 2:866726/143‑1 TTAACCATAAAGGGGTGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCACTTTTCGTGTCGTTGCATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTACCTTAATGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAT < 2:275099/143‑1 TAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCTTTTATTTTGTCCTCTATTCTCGGCGTGGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATG < 2:10834/143‑1 ACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAATCGCTCACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATACGACGCACCGATGCCTCGTTAAGCCCATGCC > 2:758304/1‑143 CAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTGACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTC > 2:859714/1‑143 CAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTAAACCAACTGAAGGATGCCGCGCCGCGGTGCCTCGTTACGAAGATGCCTC > 2:274841/1‑143 CAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTAGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCGTCGGTGCCTCGTTGAGCCGCTGCCTC > 1:183442/1‑143 AAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTtg > 1:688105/1‑141 AGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTT > 1:679657/1‑143 GGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCCTTC > 2:647930/1‑143 GGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGCACCATCTGAACAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTCCGCCTATGCCACGCGTCCTcc > 2:798782/1‑141 agTTTATCTCCCCGTTAATTGTTCCTCTATGCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAAT < 2:53494/141‑1 tcgccaCTTTAATTTTTCCTCTACTCTCGGCGTTGAATGTGGGGAAAACATCCCATAAGCGCTAACGTAAGGCTTGAACCATCTGAACAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTT < 2:52642/137‑1 TCTCGCCTTTTATTTTTCCTTTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTT < 2:466980/143‑1 TCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTT < 1:611936/143‑1 TCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGCCGTTGAATGTTGGTGAAACATCCCATCAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTT < 1:150671/143‑1 ctgcgCTTTAATTGTTTCTCTATTCTCGGCGTTGTATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGCCGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTT < 2:58274/138‑1 ggCCCTTTGATTTTTGCTCTATTCACGGCGTTCAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTT < 2:758879/141‑1 CCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGACACATCCCATAAGCGCTATCTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAACTGCGTTTTGTc > 1:287235/1‑142 CTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTCGTTCAATTGCGTTTCGTAG > 2:104785/1‑143 TTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATACCTCGCGATCTTCAATTGCGTTTcgcacg > 2:294212/1‑137 TAATTTTTCCTCTATGCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTTAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCT < 1:1040002/143‑1 TTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAG < 1:421826/143‑1 TCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTGTGTAGGCCGCCAGGGATACTGTC > 2:486794/1‑143 CGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCA < 2:1113890/143‑1 CGGCGTTGAAGGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGGTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCA < 2:166955/143‑1 aagGTGGGTTAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCGGAATAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGC < 2:1028483/140‑1 GTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGGCAC > 1:706126/1‑143 GGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAAGCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTCTTGTAGGCTGTCAGGGATACCTTCACACGAACGGCCACCg > 2:110366/1‑142 AAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGAATAGCGTCCGTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAG > 1:997626/1‑143 tttcttCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGC < 1:294582/137‑1 accCCCAGAAGCGCTGACGTACGGCTTGAACCAGCTGAAGAGTGCGACGCCGCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTC < 2:818953/140‑1 atgCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAAGTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCC < 2:1073396/140‑1 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGACTGGCCACCTGTAAGCTCC > 2:847724/1‑143 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTGCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGGTACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCC > 1:564981/1‑143 tggCATGAGCCCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCA < 2:958285/140‑1 CCCATAAGCGCTAGCTTAAGTGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAGGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG < 1:59608/143‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG < 1:982265/143‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCACTTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTACAGA > 1:549187/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGc > 1:782339/1‑142 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGA < 1:165682/143‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATGGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAAGGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT > 2:70861/1‑143 CATAAGCGCGAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGGGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < 2:750559/143‑1 TGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458654‑458795‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < NC_000913/609351‑609206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |