| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 63 (1.040) | 52/278 | 0.1 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 57 (0.950) | 45/276 | 0.3 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
ATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCC > NC_000913/607866‑608148 | aTAGTGCTGTGTTTCGGCATGCCTTGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑c < 1:458806/143‑1 (MQ=255) actcatgtgTTTATCTGTGCTTGCATTTACGCTTCTGGTCGGACACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑ccc < 1:242250/138‑1 (MQ=255) tGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCAt > 1:506271/1‑143 (MQ=255) tgtgTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAg < 1:1114521/143‑1 (MQ=255) 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< 2:771710/143‑1 (MQ=255) tGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt > 1:37986/1‑143 (MQ=255) aTTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCGGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 1:264258/143‑1 (MQ=255) ttACGCTTCTGGTCGGAGCCTGGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGt < 1:475559/143‑1 (MQ=255) ttACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGCTGTggg > 2:613306/1‑142 (MQ=255) cTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATCAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGcc > 1:500155/1‑143 (MQ=255) 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2:461744/137‑2 (MQ=37) cGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa < 2:306399/143‑1 (MQ=255) gCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGCGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGCGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTACTACGCCTGATATGATTTAAc > 2:32232/1‑143 (MQ=255) tgAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg < 1:315697/143‑1 (MQ=255) gAGTTTACGGGGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGa < 1:542387/143‑1 (MQ=255) aGTGTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑ACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAt < 1:942781/143‑1 (MQ=255) 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2:266650/1‑143 (MQ=18) ctcGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCata < 1:461793/143‑1 (MQ=255) tcGCTTACGCACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCatat < 1:96780/143‑1 (MQ=255) cgcgTACGAAACGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGCGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAtt < 2:921082/143‑1 (MQ=255) cTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCACTTCTGGCCCATATTgg > 1:292456/1‑143 (MQ=255) ttACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTTCATTAAGTAAT‑CACATATGCTCTAACTTAAGGGTTGTGTTATTACGTTTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt < 1:151549/143‑1 (MQ=17) cGAACCGGAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTaa < 2:515935/143‑1 (MQ=255) cGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAg < 2:619219/143‑1 (MQ=255) cGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCga > 2:564066/1‑143 (MQ=255) aggaagTAGGCGTGGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATCATTTCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaag < 2:599525/141‑1 (MQ=14) gTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTg > 2:578565/1‑143 (MQ=255) tAGCCGGTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTgg < 1:710130/143‑1 (MQ=255) cGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTCTTACGCCTGCTATGCTTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCCATTCTGGCTCATATTTGTCAGCCCGAAGACCTGGATAc > 1:865941/1‑143 (MQ=14) gtgCTGGTAGTAAT‑CCCATAAGCGCTATCTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGACTTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCg < 2:198879/143‑1 (MQ=255) gtgCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCg < 1:572230/143‑1 (MQ=38) gtgCGGGGAGTAAG‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCg < 1:832614/143‑1 (MQ=38) tgCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCGAGGAATTACTCGCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCgg < 1:67603/143‑1 (MQ=255) aT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGcc > 1:167914/1‑143 (MQ=11) | ATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAAT‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCC > NC_000913/607866‑608148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |