| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,049,913 | IS2 (–) +5 bp | noncoding (15‑19/109 nt) | spf → | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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TTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAG > NC_000913/4049775‑4050055 | ttaataaggaagCAACATAAGCTATCACGTTATGTGATGACTATTAAAAATTACTATAAAACAACAGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGa < 2:102320/139‑1 (MQ=255) taagtaagCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAAATCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGAAAGAtgga > 2:265137‑M1/1‑139 (MQ=255) gaaagcaACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAAGTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAAGTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGAtggattt < 1:503038‑M1/141‑8 (MQ=255) aagCAACATAAGCTGTCAGGTTTTGTGATGGCTATTCGAACTAGTTATGCAGCATATGACGATAAAGTGCAAAAAGTGCTTTCTGATCTGATCCGAAAAGAGCAAAGTTAGTCTCGTAGGGTACAGAGGTAAGATggatttgc < 1:850908/143‑8 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |