| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,313,540 | Δ2 bp :: IS186 (+) +6 bp | coding (53‑58/2673 nt) | rcsD → | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2313540 = | 0 (0.000) | 53 (0.930) | 42/274 | 0.3 | 100% | coding (53/2673 nt) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| ? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2313545 | 0 (0.000) | 48 (0.830) | 43/278 | 0.3 | 100% | coding (58/2673 nt) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | noncoding (3/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCAAAAGCGCGTCGATAAC > NC_000913/2313409‑2313685 | ggtggccactcgtggtacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagatcgcgaggcatcgtcttaacgatgcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGc > 2:424282‑M1/133‑143 (MQ=255) gtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagctggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGct < 1:805612‑M1/12‑1 (MQ=255) gTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataag > 1:205363‑M1/1‑136 (MQ=255) gcgatgcgcgggacggtatccctggcagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGcttct > 2:186337‑M1/129‑143 (MQ=255) tGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGACTG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCATTTCACTCCTACCGGGTAGCATTAccacgagcgcgaccgc > 2:825642‑M1/1‑127 (MQ=255) tGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaactt > 1:691982‑M1/1‑127 (MQ=255) tGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataaccgctaactt > 1:957663‑M1/1‑127 (MQ=255) gtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACt > 1:512806‑M1/122‑143 (MQ=255) ggcatttCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTGTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaactta < 2:422905‑M1/140‑18 (MQ=255) ggAATTTCAGCCGGTGCCCTGTAGACAGCCCTAGCCCTACGCGAAGTTTTAACCGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGGCAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaactta < 2:258676‑M1/143‑18 (MQ=255) ggAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaactta > 1:945055‑M1/1‑126 (MQ=255) tgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTg < 1:45683‑M1/23‑1 (MQ=255) tgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgacttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaaggtagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTGTtacgg < 1:555411‑M1/23‑3 (MQ=255) gggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGt < 1:191413‑M1/24‑1 (MQ=255) acagtctccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcagtcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGa > 2:152583‑M1/117‑143 (MQ=255) tCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggtt > 2:496373‑M1/1‑120 (MQ=255) cggtgtcccgcacagcctactacgcgcagctgaataacgcgaggcatcgtcttaccgaggcaccgaggcgtcgcagtcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGAt > 2:846035‑M1/116‑143 (MQ=255) cagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggtccaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGAt > 1:555365‑M1/116‑143 (MQ=255) cacaCTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCCGGGAGCATTAccatcagcgctaacttaagggttg > 2:585741‑M1/1‑119 (MQ=255) cacTGTACCCTTTATACGGCCCTATCACTGCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtg < 2:233941‑M1/143‑27 (MQ=255) cacCGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtg < 1:355740‑M1/143‑27 (MQ=255) cctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATtgtg < 1:209047‑M1/35‑1 (MQ=255) cctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATtgtg < 1:700061‑M1/35‑1 (MQ=255) tACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAACATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtagt > 2:58897‑M1/1‑112 (MQ=255) ctgccagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTgtgt > 2:183603‑M1/108‑143 (MQ=255) tttATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGCGAGCATTAccataagcgctaacttaagggtggtggtattacgcc > 2:396130‑M1/1‑107 (MQ=255) cctacaagacgcaagtgaatgtcgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGt > 2:4044‑M1/101‑143 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagcacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGa > 1:90732‑M1/99‑143 (MQ=255) taCTGCCCTATCACTTCGCGAAGCTTTAACAGGCCATACACACGACTG‑CTTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctcacttaagggttgtggtattacgcctgat < 2:734344‑M1/143‑41 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGAc < 1:897089‑M1/46‑1 (MQ=255) tGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGAGCCGGTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgccggatatg > 1:787543‑M1/1‑100 (MQ=255) acgcagttgaggaacgctaggcatcttcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTGTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATgg > 2:205716‑M1/93‑143 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATGGGGTTACTGGTGACgatgggggt < 1:392117‑M1/55‑4 (MQ=255) gaagaacgcgaggcatcgtcttaacgtggcaccgacgcgtcgtattcttcacatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTAGCCGCTTCTTTGTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATg > 2:510053‑M1/85‑143 (MQ=255) gcgAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtggcga > 1:236446‑M1/1‑86 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCCTTGTGTTACTGGTGACGATGGGTCTAATGGTa < 2:513181‑M1/62‑1 (MQ=255) cgAAGGTTTAACGGGTCACGTACCCGATTG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgat < 2:907964‑M1/143‑59 (MQ=255) aacgcgaggcatcgtcttaacgaggccccgaggcgacgcattcttcagatggttcaacacttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTCCTGTTGATCATTGTGGTACCGGGGACGATGGGGGTaatggcac < 2:112713‑M1/63‑4 (MQ=255) gAAGGTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGACAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaaaataagggttgtggtattacgactgatatgatataacgtgccgaag > 2:144018‑M1/1‑84 (MQ=255) gTTTTAACAGGTCCTACACAC‑AATGTCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGCCCCGCTTTTCACTCCTACCGCCGAGCATTCtcatatgcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat < 2:699801‑M1/143‑63 (MQ=255) ttttAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt > 1:683283‑M1/1‑80 (MQ=255) gcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGcc < 1:955418‑M1/71‑1 (MQ=255) aaCAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgacgatgaattgctc > 1:255681‑M1/1‑76 (MQ=255) aGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctca < 1:623817‑M1/143‑71 (MQ=255) cgtgataagCACGAATG‑CGTCAGAAAGAGAGAACGGCCACGACCCGCTTGTGACTCCTACCGGGGATCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcac < 2:701075‑M1/139‑72 (MQ=255) tcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAAc < 2:208797‑M1/77‑1 (MQ=255) gTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacg > 2:419248‑M1/1‑71 (MQ=255) tCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccatgagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgcggaattactctcacga > 2:120211‑M1/1‑70 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACGAGGCGCGgttaaggg < 1:76685‑M1/79‑4 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGc > 2:581122‑M1/65‑143 (MQ=255) tAAACAGGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataa < 1:620641‑M1/143‑77 (MQ=255) tAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGCCCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataa < 1:35664‑M1/143‑77 (MQ=255) tAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgctacgatttaacgtgccggtgaattactctcccgataa > 1:51934‑M1/1‑67 (MQ=255) acGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggt > 2:1040553‑M1/1‑62 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGAGGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGCTAACGCCTGGCTGaaa < 1:157100‑M1/89‑1 (MQ=255) cgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGCTGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGa < 2:656482‑M1/91‑1 (MQ=255) ggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATaa < 1:52435‑M1/94‑1 (MQ=255) cgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATaaaa > 1:590131‑M1/48‑143 (MQ=255) cgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATaaaa > 1:633550‑M1/48‑143 (MQ=255) cgtcgcattcgtcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATaaaa > 2:803745‑M1/48‑143 (MQ=255) cAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTGTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattct < 2:709326‑M1/143‑92 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACCGGTGACGGTGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAgataaacgt < 1:93960‑M1/98‑4 (MQ=255) aGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgctttaacgtgccgatgagtgactctcacgataagtggtcagcaattgtg > 2:712266‑M1/1‑51 (MQ=255) aaaGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggc > 2:140773‑M1/1‑49 (MQ=255) aaaGACACAACGGCCACTACCCGCTCTGCACTGCTCCCGGGGAGCATTAccatacgcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggc < 2:370419‑M1/143‑95 (MQ=255) agaCAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccat > 1:369780‑M1/1‑45 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGAt < 2:901146‑M1/106‑1 (MQ=255) aCAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCAGTAccataagcgctaactgaagggttggggtatgacgcctgataggatttaacgggccggtggatgactcccacgataacaggtcagcaattctgggccaact > 2:290156‑M1/1‑43 (MQ=255) cAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt < 1:461781‑M1/143‑102 (MQ=255) aaCGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaccttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttcacgtgccgatgaattactctcacgataatccatcagcaattctgacccatattg > 2:943427‑M1/1‑41 (MQ=255) aCGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattgg < 1:126476‑M1/143‑104 (MQ=255) ggtggttcaacccttaggttagcgcttatgggcGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATAGTACAAAGCGCCGTTAACCCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTc > 2:555411‑M1/34‑143 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATaaaa > 2:90216‑M1/34‑129 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATaaaa < 1:90216‑M1/96‑1 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTc > 2:45683‑M1/34‑143 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTc > 1:873999‑M1/34‑143 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgctgatgggaGCAGTACCCGCTTCTGTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTc > 1:340926‑M1/34‑143 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGa > 2:213250‑M1/32‑143 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGAc > 1:832719‑M1/31‑143 (MQ=255) cACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgatggctggggtgtaattctggcccacagtggtagtc > 1:441660‑M1/1‑35 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTAc < 1:581051‑M1/118‑1 (MQ=255) cccGCTGTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaa < 1:951547‑M1/143‑114 (MQ=255) atccttgagttagtgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTAcc > 1:573171‑M1/25‑143 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTTATGTTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTAcc > 2:700061‑M1/25‑143 (MQ=255) ccGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagagctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattaaacgtgccgatgaattactctcacgataacgggtcagcaatgctggcccatatcggtgagcccgaag > 2:870418‑M1/1‑29 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGATACCAGATTGTCGACATTACCCAt < 2:22104‑M1/122‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTAt > 1:901146‑M1/17‑143 (MQ=255) tCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaactaaagggttgtggcatcacgcctgataagatgtaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatact > 1:1038828‑M1/1‑18 (MQ=255) gcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCaaaa > 2:191413‑M1/11‑143 (MQ=255) tACCGGGAAGCATTAccatgagctataatttaaggtggggggtattacgcctcatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcg < 1:537653‑M1/143‑129 (MQ=255) cttgtgggaGCATCACCCGCTGCTTTTTGCGCGTGAGCATTGTGTTACCGGGGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCAAAAg > 2:311208‑M1/10‑143 (MQ=255) ttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCAGTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAGGATGAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCAAGGCTATAAAAAAgc < 1:463552‑M1/135‑1 (MQ=255) aCCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcgg > 1:809330‑M1/1‑14 (MQ=255) tatgggaGCATTACCCGCTTCTCTTTACTGCTCATCATTGTGTTACGGGTGACGATGGGTGTACGGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCAAAAgcg > 1:83910‑M1/8‑143 (MQ=255) cGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggca < 1:496373‑M1/143‑132 (MQ=255) gggaGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTACTGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGGAGGATAAAAGTAACCAGACTGGCGACATTACCCATGCTATCCAAACGCGCGt < 2:121058‑M1/139‑1 (MQ=255) ttAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgcc < 2:369780‑M1/143‑141 (MQ=255) ttACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGGCATTACCCATGCTATCCAAAAGCGCGTCGATAAc > 1:4667/1‑143 (MQ=255) accataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatta < 1:947100‑M1/65‑65 (MQ=255) accataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatta > 2:947100‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATG‑CGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCAAAAGCGCGTCGATAAC > NC_000913/2313409‑2313685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |