| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,313,540 | Δ2 bp :: IS186 (+) +6 bp | coding (53‑58/2673 nt) | rcsD → | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2313540 = | 0 (0.000) | 79 (1.080) | 65/276 | 0.1 | 100% | coding (53/2673 nt) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| ? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2313545 | 0 (0.000) | 78 (1.050) | 64/280 | 0.1 | 100% | coding (58/2673 nt) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | noncoding (3/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
ATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCAAAAGCGCGTCGATA > NC_000913/2313405‑2313683 | ggcaagagTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCAGAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTTCCGGGGAGCATTAccataa < 2:840073‑M1/140‑7 (MQ=255) gTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGACGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGACACGACCCGCTATTCACTCCTACCGGGGAGCATGAccatcag > 2:1011919‑M1/1‑136 (MQ=255) gTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataag > 2:170048‑M1/1‑136 (MQ=255) agagTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgc > 1:1135648‑M1/1‑133 (MQ=255) cattcgggggacagcatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttacgttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCttt > 2:309091‑M1/127‑143 (MQ=255) tcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggaGCATTACCCGCTTCTTTTTa > 1:337995‑M1/124‑143 (MQ=255) gAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaa < 1:613877‑M1/143‑19 (MQ=255) aaTTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTCCGCGAAGTGTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaag < 1:758035‑M1/143‑20 (MQ=255) aTTTCACACTGTACCCTTTATACGGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTAccataagcgctaacttaagg < 1:396475‑M1/143‑21 (MQ=255) 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cATTAccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgagaactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacctcggcacgtaatc > 2:1102063‑M1/1‑5 (MQ=255) | ATCAGGTAAGAGTCTGGAATTTCACACTGTACCCTTTATACTGCCCTATCACTTCGCGAAGTTTTAACAGGTCATAAACACGAATGCGTCAGAAAGAGACAACGGCCACGACCCGCTTTTCACTCCTACCGGGGAGCATTACCCGCTTCTTTTTACTGTTGATCATTGTGTTACTGGTGACGATGGGTGTAATGGTACAAAGCGCCGTTAACGCCTGGCTGAAAGATAAAAGTTACCAGATTGTCGACATTACCCATGCTATCCAAAAGCGCGTCGATA > NC_000913/2313405‑2313683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |