| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,992,524 | (CGGGC)2→1 | coding (1372‑1376/2547 nt) | cyaA → | adenylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3992522 = | 2 (0.030) | 48 (0.830) | 45/270 | 0.2 | 96.1% | coding (1370/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 3992516 | 2 (0.030) | coding (1364/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
GCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCG > NC_000913/3992380‑3992663 | tctccgccagtccgcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgaccgttatttatgtgccg < 1:592628‑M1/1‑1 (MQ=255) cgccggtccgcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCgg > 2:315026‑M1/139‑143 (MQ=255) gccagtccgcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcaaccgatctctcggaaccgaatatgacctttattcacgtgccGCCggg < 2:492862‑M1/6‑1 (MQ=255) ggccgcgggagatcggcgtgctgacgcgtgagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTaa > 2:115078‑M1/134‑143 (MQ=255) tccgcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagggccgctggtaagcccgcagatgtcacccgatctctcggaaccgaagctgacccttatgtatggggcGCCGGGCTAAc < 2:807630‑M1/11‑1 (MQ=255) ccgcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattacgaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggacccgagtctgaccataatttaggtgtcGCCGCGCTGAcc < 2:30167‑M1/12‑1 (MQ=255) gcagtatatcggcttgctgaggcgtaagctgtatgccgcgtttgaagaattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGt > 2:965408‑M1/130‑143 (MQ=255) gcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGt < 1:870648‑M1/14‑1 (MQ=255) gcagcatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgccgatttcgcccgatctctcggaaccgaatctgaccttgatttatgtgccGCCGGGCTAACCGt > 2:186432‑M1/130‑143 (MQ=255) aggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTc > 2:576680‑M1/128‑143 (MQ=255) tcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccaaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTg > 2:455385‑M1/122‑143 (MQ=255) ctgacgcgtaagcgggatgccgcgttcgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGt > 1:219245‑M1/114‑143 (MQ=255) tgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGta < 1:181570‑M1/31‑1 (MQ=255) cgacgcgtaagctggatgccgcgtttgaagcactaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGta > 1:1022492‑M1/113‑143 (MQ=255) cgcgtcggctgtaggccgcgtttgacgcattaccaggtaaagtgacgctggtaaccccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATaa > 2:645271‑M1/110‑143 (MQ=255) cgtaagcggtatgccgcgtttgaagcatcaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagagttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAAcc > 1:366982‑M1/108‑143 (MQ=255) taagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttctgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACcgc < 2:651272‑M1/38‑1 (MQ=255) agctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaccccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACcgcgc > 1:522290‑M1/104‑143 (MQ=255) ctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctgggaaacccgcagatttcacccgatctcgaggaaccgaatcggacctttatttaggtgccGCCGGGCTAACCGTTAGGGTTGGTATCGGTGTAAccgcgcgg < 1:28773‑M1/42‑2 (MQ=255) tgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAat < 1:592781‑M1/47‑1 (MQ=255) gcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCgcgccaaagctga < 1:30800‑M1/51‑6 (MQ=255) caacctttACCATCTAAATCGACTCTTCTAATCCCCCATATTTCACCCGTTCTCTCGTAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCTCCG‑‑‑C‑‑TCTAACCTTTCATTTTGGTATCTTTATAACCTCTCGCCAAATATTGAGTCGa < 2:800062/137‑1 (MQ=255) gttgaagcatcaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGt > 1:642046‑M1/90‑143 (MQ=255) aagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGat > 1:668421‑M1/86‑143 (MQ=255) ttaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGAtcatca < 2:637125‑M1/63‑1 (MQ=255) ttaccaggtaaagggacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGAtcatca > 1:483751‑M1/81‑143 (MQ=255) aggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATcatcagccat > 1:1079583‑M1/76‑143 (MQ=255) ggtaaagtgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCCAAGATTGAGTCGATcatccgccatc < 2:613775‑M1/69‑1 (MQ=255) aggtgactcggattaaccggcagatggcccccgctctctcgggaccgaatctgacttttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTCTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTGGATCatcagccatcagcc > 2:968952‑M1/71‑143 (MQ=255) tgacgctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCt > 2:923321‑M1/68‑143 (MQ=255) gctggtaaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGAGCCAACTATCGAGTCGATCATCAGGCATCAGCCGCTGGaa < 2:975900‑M1/80‑1 (MQ=255) ggtaaacccgcagatttcacccgttcgctcttaaccgaatctgacctgtatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAatat > 1:682853‑M1/61‑143 (MQ=255) taaacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCTCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCACTGGAATATaa < 1:637062‑M1/85‑1 (MQ=255) aacccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAACATTGAGTCGATCATCAGCCATCACCCGCGGGAATATAAcc < 2:746612‑M1/87‑1 (MQ=255) ccgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGtt < 1:32548‑M1/90‑1 (MQ=255) cgcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTa < 1:478194‑M1/91‑1 (MQ=255) tttCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTACGTGC‑‑CC‑‑‑CCGGGCTCACCGTTCAGGCTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAACAATTGCGCCGATCATCTGCCACCCGCCGCTGGGCTAAAACCCttctccgac > 2:194023/1‑136 (MQ=255) gcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACcgttgc < 1:403588‑M1/92‑3 (MQ=255) gcagatttcacccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTAc > 1:269839‑M1/52‑143 (MQ=255) cccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGCCGATCATCGGCCATCAGCCGCCGGAATATCACCgttacctggctaacc < 1:121822‑M1/102‑8 (MQ=255) ccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGACATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACt < 1:821688‑M1/103‑1 (MQ=255) cgagcgctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCGAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACtg > 2:870648‑M1/40‑143 (MQ=255) gctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTACAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGGATATAACCGTTACCTGAATAAACtggtg > 1:596871‑M1/37‑143 (MQ=255) ctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCg < 2:578232‑M1/110‑1 (MQ=255) ctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACAGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGACTAACCTGGTGGCg < 2:130525‑M1/110‑1 (MQ=255) tcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGt < 1:1039795‑M1/111‑1 (MQ=255) cacggatctggccttgatttcggcgccGCGGGGCTAACCTTGCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCa > 2:28773‑M1/28‑143 (MQ=255) ttatttatgtgccGCCGGGCTAACCGTTAAGGTTGGGTTCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCGGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGGGGCGTGGGCATGGTTTAACTGCct < 2:898202‑M1/130‑1 (MQ=255) tatttatgtgccGCCGGGCGGACCGTTGAGGTTGGGATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCAGCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCctg > 2:671275‑M1/13‑143 (MQ=255) 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NC_000913/3992380‑3992663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |